本文選題：芒果 + 轉(zhuǎn)錄組�。� 參考：《熱帶作物學(xué)報(bào)》2016年11期

【摘要】：以紅芒6號(hào)為試材,對(duì)生長(zhǎng)發(fā)育各時(shí)期果皮與果肉樣品提取RNA后等量混合進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,共獲得了68 419 722個(gè)reads,包含6 157 744 980個(gè)核苷酸序列信息,平均讀長(zhǎng)90 bp,序列信息全部登陸NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)(SRP035450)。對(duì)reads進(jìn)行拼接,共獲得124 002個(gè)Contig片段,進(jìn)一步組裝獲得54 207個(gè)Unigene片段,平均長(zhǎng)度為838 bp,閾值小于10-5的序列中共有42 515(78.43%)個(gè)unigenes被注釋到公共蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)。其中,35 198個(gè)被注釋到生物學(xué)過(guò)程、分子功能和細(xì)胞組分GO類(lèi)別的44個(gè)功能組,14 619個(gè)Unigene匹配到25類(lèi)COG功能組,23 741個(gè)Unigene被富集到128個(gè)KEGG代謝通路,包括代謝途徑、次生代謝的生物合成、植物-病原物互作、植物激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、苯丙氨酸生物合成、淀粉和蔗糖代謝、類(lèi)黃酮類(lèi)化合物合成等。本研究將為進(jìn)一步的芒果功能基因克隆、基因表達(dá)分析、分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)等研究奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:Using Hongmang 6 as a sample, the RNA from pericarp and pulp samples were extracted and sequenced. A total of 68 419 722 readswere obtained, including 6 157 744,980 nucleotide sequence information. The average read length is 90 BP, and all the sequence information is recorded in NCBI database (SRP 035450). A total of 124,002 Contig fragments were obtained from reads splicing, and 54,207 Unigene fragments were further assembled, with an average length of 838 BP. A total of 42 515 unigenes were annotated into the common protein database in the sequence with a threshold of less than 10-5. 35,198 of them were annotated to biological process, 14,619 Unigene of 44 functional groups of molecular function and cell components were matched to 23,741 Unigene of 25 COG functional groups, and 23 741 Unigene were enriched to 128 KEGG metabolic pathways, including metabolic pathways. Biosynthesis of secondary metabolism, plant-pathogen interaction, plant hormone signal transduction, phenylalanine biosynthesis, starch and sucrose metabolism, flavonoid synthesis, etc. This study will lay a foundation for the further research of mango functional gene cloning, gene expression analysis and molecular marker development.
【作者單位】： 中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院南亞熱帶作物研究所農(nóng)業(yè)部熱帶果樹(shù)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：農(nóng)業(yè)行業(yè)科研專(zhuān)項(xiàng)子項(xiàng)目(No.201203092-3) 廣東省自然科學(xué)基金-粵西北創(chuàng)新人才專(zhuān)項(xiàng)(No.2016A030307006)
【分類(lèi)號(hào)】：S667.7

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 劉志田;幼齡芒果樹(shù)的管理要點(diǎn)[J];四川農(nóng)業(yè)科技;2000年07期

2 黃日升,胡東升,張景照;芒果采后損失原因及其預(yù)防[J];福建果樹(shù);2001年01期

3 韋健康;奇特的芒果樹(shù)[J];廣西林業(yè);2001年02期

4 ;芒果成年結(jié)果樹(shù)的施肥[J];世界熱帶農(nóng)業(yè)信息;2003年01期

5 甘家生;罕見(jiàn)的千年野生芒果樹(shù)[J];云南林業(yè);2005年03期

6 劉志田,羅關(guān)興,王軍,陳艷瓊;提高攀西芒果栽培經(jīng)濟(jì)效益的途徑與方法[J];四川農(nóng)業(yè)科技;2005年01期

7 黃艷;;巴基斯坦芒果產(chǎn)量將下降[J];世界熱帶農(nóng)業(yè)信息;2006年05期

8 ;芒果樹(shù)秋冬肥水管理技術(shù)要點(diǎn)[J];世界熱帶農(nóng)業(yè)信息;2007年02期

9 林家貴;;成年芒果樹(shù)栽培管理技術(shù)[J];農(nóng)技服務(wù);2007年04期

10 林家貴;;成年芒果樹(shù)栽培管理技術(shù)[J];中國(guó)農(nóng)村小康科技;2007年07期

相關(guān)會(huì)議論文 前4條

1 嚴(yán)家春;;大力實(shí)施品牌戰(zhàn)略 促進(jìn)芒果產(chǎn)業(yè)升級(jí)[A];熱帶作物產(chǎn)業(yè)帶建設(shè)規(guī)劃研討會(huì)——熱帶果樹(shù)產(chǎn)業(yè)發(fā)展論文集[C];2006年

2 黃衛(wèi)東;劉肅;李中文;林德郁;鄭國(guó)華;;多效唑?qū)τ啄昝⒐麡?shù)生長(zhǎng)結(jié)果的影響[A];中國(guó)科學(xué)技術(shù)協(xié)會(huì)第二屆青年學(xué)術(shù)年會(huì)園藝學(xué)論文集[C];1995年

3 余會(huì)康;陳安芳;阮翠冰;;閩東氣候變化與芒果生長(zhǎng)分析[A];2013年中國(guó)農(nóng)業(yè)資源與區(qū)劃學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2013年

4 黃國(guó)弟;李日旺;莫永龍;;芒果套袋綜合比較試驗(yàn)[A];中國(guó)熱帶作物學(xué)會(huì)2007年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2007年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前10條

1 臧平;吃芒果 當(dāng)心變“花臉”[N];衛(wèi)生與生活報(bào);2005年

2 本報(bào)記者 王娜 張鵬毅;三亞早芒果出路在何方[N];中國(guó)特產(chǎn)報(bào);2006年

3 范曉全;廣壩芒果產(chǎn)業(yè)喜見(jiàn)“艷陽(yáng)”[N];海南農(nóng)墾報(bào);2006年

4 本報(bào)記者　 王錫鵬 通訊員　 符廣輝 王聰;深耕沃土 芒果香萬(wàn)家[N];海南農(nóng)墾報(bào);2006年

5 本報(bào)記者　 易家凡 通訊員　 劉興旺 黎想;小小芒果富了一方百姓[N];海南農(nóng)墾報(bào);2006年

6 張鵬毅;三亞早芒果大量積壓[N];經(jīng)濟(jì)參考報(bào);2006年

7 彭隆榮;芒果敲開(kāi)致富門(mén)[N];農(nóng)民日?qǐng)?bào);2006年

8 白福保;芒果大豐收 農(nóng)民笑開(kāi)顏[N];紅河日?qǐng)?bào);2008年

9 王建燕;芒果成為農(nóng)民增收致富重要產(chǎn)業(yè)[N];云南經(jīng)濟(jì)日?qǐng)?bào);2008年

10 柳書(shū)倩;芒果營(yíng)養(yǎng)有幾何[N];中華合作時(shí)報(bào);2002年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前3條

1 胡yN;海南芒果銷(xiāo)售模式選擇與影響因素研究[D];海南大學(xué);2015年

2 劉國(guó)銀;不同土壤含水量對(duì)芒果葉片及果實(shí)的影響[D];海南大學(xué);2014年

3 徐兵強(qiáng);香蕉、番木瓜和芒果NBS-LRR類(lèi)和STK類(lèi)抗病基因同源序列的克隆和特征分析[D];華南熱帶農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

，

本文編號(hào)：1957916