本文選題：馬身豬 + MEFA基因　； 參考：《中國(guó)畜牧獸醫(yī)》2017年04期

【摘要】：本研究旨在克隆馬身豬肌細(xì)胞增強(qiáng)因子2A(myocyte enhancer factor 2A,MEF2A)基因的不同剪接體類型。依據(jù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?qū)勺兗艚拥念A(yù)測(cè)結(jié)果,試驗(yàn)擴(kuò)增MEF2A基因第5~8外顯子之間的編碼區(qū),用生物信息學(xué)軟件分析了馬身豬MEF2A基因不同剪接體的序列特性,預(yù)測(cè)保守結(jié)構(gòu)域,構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,比對(duì)不同物種MEF2A的氨基酸同源性。結(jié)果顯示,獲得了4個(gè)MEF2A基因的剪接體,MEF2A1的第5~8外顯子正常剪接;MEF2A2缺失了第5外顯子,第6外顯子的5′端多出138bp,第7外顯子的3′端多出102bp;MEF2A3缺失了第5外顯子,第6外顯子的5′端多出138bp;MEF2A4第7外顯子的3′端多出102bp。插入的138bp序列編碼的蛋白質(zhì)中存在1個(gè)保守結(jié)構(gòu)域HJURP_C,這可能與MEF2A參與肝細(xì)胞纖維化作用有關(guān)。MEF2A1和MEF2A4與豬MEF2A1(GenBank登錄號(hào):NP_001090890.1)同屬于一個(gè)亞群,同源性高達(dá)98.9%,MEF2A2和MEF2A3與豬MEF2A2(GenBank登錄號(hào):NP_001093168.1)同屬于一個(gè)亞群,同源性分別為98.2%和98.9%。本試驗(yàn)成功克隆了4個(gè)MEF2A基因的剪接體,為進(jìn)一步研究其蛋白功能奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:The aim of this study was to clone different splicing types of myocyte enhancer 2A(myocyte enhancer factor 2 An MEF 2 A gene. Based on the prediction of variable splicing by transcriptome sequencing, the coding region between exon 5 of MEF2A gene was amplified. The sequence characteristics of different splicing bodies of MEF2A gene were analyzed by bioinformatics software, and the conserved domain was predicted. Phylogenetic tree was constructed to compare the amino acid homology of MEF2A in different species. The results showed that exon 5, exon 5 in exon 5, exon 5 The 5'end of exon 6 was 102bpmore than the 3'end of exon 7 of MEF2A4. There is a conserved domain HJURP C in the protein encoded by the inserted 138bp sequence, which may be related to the involvement of MEF2A in hepatocyte fibrosis. MEF2A1 and MEF2A4 belong to the same subgroup as MEF2A1(GenBank accession number: NP001090890.1. The homology of MEF2A2 and MEF2A3 were 98.2% and 98.9%, respectively, which belonged to the same subgroup as Pig MEF2A2(GenBank accession number: NP00103168.1). In this study, four splicing bodies of MEF2A gene were cloned successfully, which laid a foundation for further study of its protein function.
【作者單位】： 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】：山西省科技創(chuàng)新重點(diǎn)團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(201605D131045-24) 三晉學(xué)者項(xiàng)目(2016) 山西省農(nóng)業(yè)科技攻關(guān)項(xiàng)目(20140311020-5) 山西省高等學(xué)校優(yōu)秀青年學(xué)術(shù)帶頭人項(xiàng)目
【分類號(hào)】：Q78;S828

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本文編號(hào)：1952514