本文選題：河流型水牛 + 沼澤型水牛��； 參考：《云南農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學)》2017年02期

【摘要】：本研究以54頭河流型水牛和70頭沼澤型水牛為研究對象,并以從NCBI數(shù)據(jù)庫中下載的普通牛、野牦牛、野牛、綿羊、小鼠和人的序列作對照,對乳成分中重要的κ-酪蛋白(kappa casein)編碼基因CSN3的密碼子使用偏好性及水牛與其他物種間CSN3基因密碼子使用的差異和進化關(guān)系進行了深入分析。結(jié)果表明:兩種類型水牛CSN3基因密碼子使用特征相似,河流型水牛CSN3基因共有26個偏好使用的密碼子,而沼澤型水牛共有27個;其中,兩類水牛偏好性較強的密碼子均為GUU、UCA、AGU、CCA、AGG、GGU和GGA(RSCU≥2),河流型水牛對Asp的兩種密碼子GAU、GAC沒有使用偏好性,而沼澤型水牛偏好使用GAC;河流型水牛編碼Asp和Cys的同義密碼子RSCU值為1,而沼澤型水牛只有編碼Cys的同義密碼子RSCU值為1。研究發(fā)現(xiàn),所有物種CSN3基因均偏好使用以A/U結(jié)尾的密碼子,但不同物種之間偏好使用密碼子種類和數(shù)目均有差異。在密碼子使用頻率上,水牛CSN3基因與其他�？莆锓N的差異小于與小鼠、人的差異。密碼子使用偏好聚類分析表明,河流型與沼澤型水牛親緣關(guān)系最近,聚為一類,然后依次與其他牛、綿羊、小鼠和人等物種相聚。
[Abstract]:In this study, 54 river buffalo and 70 swamp buffaloes were studied, and the sequences of common cattle, wild yaks, bison, sheep, mice and human beings downloaded from NCBI database were used as control. The codon usage preference of the important kappa casein (CSN3) encoding gene in milk components and the differences and evolutionary relationships between buffalo and other species in the use of codon of CSN3 gene were analyzed. The results showed that the two types of buffalo CSN3 gene codon use characteristics are similar, fluvial buffalo CSN3 gene has 26 preferred codon, and swamp buffalo codon has 27, in which, The codon of the two kinds of buffalo with strong preference was GUUUUCAANGUGU and GGA(RSCU 鈮，

本文編號：1951614