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茶樹幾丁質(zhì)酶基因的克隆及其在干旱脅迫下的表達(dá)分析

發(fā)布時間:2018-05-29 16:40

  本文選題:茶樹 + 幾丁質(zhì)酶; 參考:《熱帶作物學(xué)報》2017年05期


【摘要】:以鐵觀音茶樹葉片為材料,利用逆轉(zhuǎn)錄PCR及RACE法,克隆了茶樹幾丁質(zhì)酶基因Cs Chi(Gen Bank登錄號為KR078345)。Cs Chi基因的c DNA全長為1 192 bp,包含972 bp的開放閱讀框(ORF),編碼323個氨基酸。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,Cs Chi蛋白的分子量為34.33 ku;理論等電點p I為8.44;原子組成為C1 519H2 285N413O464S18,總原子數(shù)為4 699;蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析顯示該蛋白有6個蛋白的跨膜區(qū)域,屬于跨膜蛋白;存在于細(xì)胞外;沒有卷曲螺旋結(jié)構(gòu)存在;Cs Chi基因編碼的蛋白屬于糖苷水解酶19家族,含有保守的Cht BD1結(jié)構(gòu)域,與溶菌酶的保守結(jié)構(gòu)域類似,可能兼具幾丁質(zhì)酶活性和溶菌酶活性,q PCR定量分析結(jié)果顯示在不同干旱脅迫處理下茶樹的Cs Chi基因的表達(dá)量,與對照組相比有所增加。推測Cs Chi基因在茶樹干旱等逆境脅迫中起重要作用。
[Abstract]:Using leaf leaves of Tieguanyin tea as material, using reverse transcription PCR and RACE method, the c DNA of tea tree chitinase gene Cs Chi(Gen Bank accession number is 1 192 BP, containing 972 BP open reading frame, encoding 323 amino acids. The results of bioinformatics analysis showed that the molecular weight of Cs Chi protein was 34.33ku; the theoretical isoelectric point Pi was 8.44; the atomic composition was C1 519H2 285N413O464S18, the total atomic number was 4699.The protein structure analysis showed that the protein had six transmembrane regions and belonged to transmembrane protein. The protein encoded by Cs Chi gene is a family of glycoside hydrolase 19, which contains conserved Cht BD1 domain, similar to the conserved domain of lysozyme. The results of Q PCR quantitative analysis of chitinase activity and lysozyme activity showed that the expression of Cs Chi gene in tea plants under different drought stress was higher than that in the control group. It is inferred that Cs Chi gene plays an important role in the stress of tea plants such as drought.
【作者單位】: 福建農(nóng)林大學(xué)園藝學(xué)院;福建農(nóng)林大學(xué)園藝植物生物工程研究所;福州市農(nóng)業(yè)局;
【基金】:福建省自然科學(xué)基金(No.2013J01085) 福建省重大科技專項(No.2015NZ0002-1) 福建省教育廳計劃項目(No.JA15143)
【分類號】:S571.1

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本文編號:1951635


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