斜帶石斑魚干擾素調(diào)節(jié)因子8基因的鑒定與表達(dá)模式分析
本文選題:干擾素調(diào)節(jié)因子 + 斜帶石斑魚; 參考:《廈門大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版)》2017年02期
【摘要】:干擾素調(diào)節(jié)因子8(IRF8)是IRF家族轉(zhuǎn)錄因子中的一個成員.利用簡并PCR和cDNA末端快速克隆(RACE)技術(shù)獲得了斜帶石斑魚(Epinephelus coioides)IRF8基因(EcIRF8)全長cDNA序列,其編碼422個氨基酸殘基的蛋白質(zhì),含有脊椎動物IRF家族的特征性結(jié)構(gòu)域,即N端保守的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DBD)和C端多樣化的干擾素調(diào)控因子結(jié)合結(jié)構(gòu)域(IAD),其中DBD中包含5個特征性的色氨酸殘基和1個核定位信號.與絕大多數(shù)脊椎動物的IRF8基因相似,EcIRF8基因組序列也是9個外顯子和8個內(nèi)含子的結(jié)構(gòu).EcIRF8在斜帶石斑魚肝臟中高水平表達(dá).活體聚肌胞苷酸刺激后6h,EcIRF8在頭腎、中腎、胸腺、肝臟和腸中的表達(dá)量顯著上調(diào)(p0.05),其中在中腎中上調(diào)幅度最大,是對照組的106倍;副溶血弧菌(Vibrio paraheamolyticus)刺激后24h,EcIRF8在肝臟中的表達(dá)量也顯著上調(diào)(p0.05),但上調(diào)倍數(shù)僅為對照組的9.37倍.結(jié)果表明,EcIRF8基因可能主要參與斜帶石斑魚的抗病毒免疫反應(yīng).
[Abstract]:Interferon regulatory factor 8 (IF8) is a member of the IRF family of transcription factors. The full-length cDNA sequence of Epinephelus coioides)IRF8 gene EcIRF8 was obtained by degenerate PCR and rapid cloning of cDNA terminal RACE8. It encodes 422 amino acid residues and contains the characteristic domain of the IRF family of vertebrates. The N-terminal conserved DNA binding domain (DBD) and the C-terminal interferon regulatory factor binding domain (DBD) contain five characteristic tryptophan residues and one nuclear localization signal. Similar to the IRF8 gene of most vertebrates, the genomic sequence of EcIRF8 is also the structure of 9 exons and 8 introns. EcIRF8 is highly expressed in the liver of the oblique grouper. The expression of EcIRF8 in the head kidney, middle kidney, thymus, liver and intestine was significantly up-regulated at 6 h after stimulation of polycytidine in vivo, with the largest up-regulation of EcIRF8 in the middle kidney, 106 times of that in the control group. The expression of EcIRF8 in the liver of Vibrio parahaemolyticus was significantly up-regulated 24 h after stimulation, but the up-regulation was only 9.37 times of the control group. The results showed that the EcIRF8 gene might be involved in the antiviral immune response of the oblique grouper.
【作者單位】: 集美大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院;鰻鱺現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)技術(shù)教育部工程研究中心(集美大學(xué));福建省海洋生物資源開發(fā)利用協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(U205123,31172438,31402329) 國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(2012AA092201) 福建省自然科學(xué)基金(2012J06008,2014J05042) 廈門南方海洋研究中心科技項(xiàng)目(14PYY050SF03)
【分類號】:S917.4
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號:1887411
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