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ANKRD29基因在非小細(xì)胞肺癌中的表達(dá)及其細(xì)胞功能的初步探索

發(fā)布時(shí)間:2018-05-11 03:09

  本文選題:非小細(xì)胞肺癌 + ANKRD29��; 參考:《廣州醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文


【摘要】:研究背景:肺癌在全球癌癥病例中上升最快,死亡率占癌癥死亡數(shù)的19.4%,其中約80%的病例為非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)。全球肺癌患者的5年生存率低,約4-17%,隨著對(duì)肺癌進(jìn)展分子機(jī)制的更深認(rèn)識(shí),分子靶向治療已成為晚期肺癌的重要治療手段。目前肺癌治療方面的研究聚焦于:抗體靶向的免疫治療(如PD-1)和驅(qū)動(dòng)基因(如EGFR、K-RAS、ALK、MET、HER-2等)的分子靶向治療。有研究表明,編碼錨蛋白重復(fù)序列(ANKRD)的基因(如腫瘤抑制基因p16和p18)發(fā)生突變,如基因缺失、甲基化和點(diǎn)突變,可能會(huì)導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生。錨蛋白重復(fù)序列(ANKRD),是自然界中廣泛存在的蛋白質(zhì)模式序列之一,由30-34氨基酸殘基組成,其功能是介導(dǎo)蛋白質(zhì)之間的相互作用,并參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控、促進(jìn)或抑制細(xì)胞周期、細(xì)胞發(fā)育分化等過程。在前期研究中,我們通過基因芯片檢測(cè)5個(gè)NSCLC患者的腫瘤組織和癌旁組織,發(fā)現(xiàn)ANKRD29在腫瘤組織中表達(dá)明顯增高,提示其可能是一種新型腫瘤相關(guān)基因。研究目的本課題擬在前期研究基礎(chǔ)上,驗(yàn)證NSCLC患者肺癌組織和癌旁組織中ANKRD29的表達(dá)差異,進(jìn)一步探索其與患者臨床病理、預(yù)后的相關(guān)性,并初步對(duì)其細(xì)胞功能探索,從而揭示ANKRD29在NSCLC起病中可能的作用機(jī)制。方法1.根據(jù)入排標(biāo)準(zhǔn),選取2012年11月至2015年10月在我院行肺癌根治術(shù)的40例肺癌患者(肺癌組織作為實(shí)驗(yàn)組,其癌旁組織作為自身對(duì)照組),通過RT-PCR檢測(cè)兩組標(biāo)本ANKRD29 m RNA的表達(dá)量差異,分析其與患者臨床病理、預(yù)后的相關(guān)性。2.在7種肺癌細(xì)胞系中篩選出ANKRD29 m RNA表達(dá)量最高及最低的各2種細(xì)胞系作為細(xì)胞實(shí)驗(yàn)研究對(duì)象3.通過MTT、單克隆形成、細(xì)胞劃痕遷移實(shí)驗(yàn),初步觀察4種肺癌細(xì)胞系活性、增殖、遷移的差異。4.統(tǒng)計(jì)學(xué)方法:連續(xù)性資料如果滿足正態(tài)分布采用(?)±s進(jìn)行描述,組間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),配對(duì)資料采用配對(duì)樣本t檢驗(yàn);如果不滿足正態(tài)分布則采用中位數(shù)±四分位數(shù)間距描述,組間比較采用Wilcoxon秩和檢驗(yàn),配對(duì)樣本比較采用符號(hào)檢驗(yàn)。分類資料采用頻數(shù)和百分比描述,組間比較采用卡方檢驗(yàn)。預(yù)后分析采用ROC曲線分析、Kaplan Meire生存曲線分析,組間比較采用Log-rank檢驗(yàn)。多因素分析采用Logistic回歸(結(jié)局為二分類資料)和Cox回歸(結(jié)局為生存資料)。采用SAS9.4軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,P0.05認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)果1、NSCLC患者的流行病學(xué)特征此研究納入40位NSCLC患者(共入組47例,其中7例因臨床隨訪資料缺失而刪除),年齡59.3±9.3;男性26(65.0%)人,女性14(35.0%)人;吸煙19(47.5%)人,不吸煙21(52.5%)人;腺癌26(65.0%)人,鱗癌14(35.0%)人;TNM分期Ⅰ期15(37.5%)人,Ⅱ期15(37.5%)人,Ⅲ期10(25%)人。2、NSCLC患者肺癌組織與癌旁組織中ANKRD29 m RNA的表達(dá)量差異ANKRD29在腫瘤組織【相對(duì)表達(dá)量中位數(shù)為2.42(0.85,6.42)×10-2】中與癌旁組織【相對(duì)表達(dá)量中位數(shù)為1.59(0.48,5.14)×10-2】中表達(dá)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.029)。3、ANKRD29 m RNA的表達(dá)量差異與NSCLC患者臨床特征及預(yù)后的關(guān)系分析【根據(jù)ANKRD29在C/NC組織中的相對(duì)表達(dá)將樣品按照Fold Change中位數(shù)0.603分為2組:高(≥0.603,n=20)和低(0.603,n=20)】1)ANKRD29與NSCLC患者臨床病理特征的關(guān)系分析兩組ANKRD29表達(dá)差異與性別(p=0.507)、年齡(p=0.778)、吸煙史(p=0.752)、組織學(xué)類型(p=0.507)、TNM分期(p=0.138)、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(p=0.116)均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),其中高表達(dá)組TNM III期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移N2占比高于低表達(dá)組,P值偏小,有待進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量研究。2)ANKRD29與NSCLC患者預(yù)后的關(guān)系分析KM曲線分析發(fā)現(xiàn)ANKRD29的表達(dá)量差異與預(yù)后沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05),但低表達(dá)組預(yù)后有優(yōu)于高表達(dá)組的趨勢(shì)。Cox回歸顯示Fold change與復(fù)發(fā)相關(guān)性無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(HR=1.030(0.970,1.093),P=0.338),Fold change與轉(zhuǎn)移相關(guān)性無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(HR=1.000(0.935,1.069),P=0.998),Fold change與存活相關(guān)性無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(HR=1.038(0.968,1.113),P=0.298)。4、7種肺癌細(xì)胞系中ANKRD29m RNA水平的表達(dá)差異(以GAPDH作為內(nèi)參)對(duì)7種肺癌細(xì)胞系的RT-PCR結(jié)果顯示ANKRD29 m RNA相對(duì)表達(dá)量由高到低順序如下:H1975(0.000535±0.0000486370)、Hcc827(0.000428391±0.0000399682)、H1650(0.000334±0.0000513799)、pc9(0.000057±0.0000066776)、A549 ddp(0.000036±0.0000036970)、A549(0.000029±0.0000046298)、H1299(0.000024±0.0000010194)。Hcc827、H1650、H1975細(xì)胞系與其他相比差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.0001)。挑選表達(dá)量較高的Hcc827、H1975和較低的H1299、A549細(xì)胞系作為下一步實(shí)驗(yàn)對(duì)象。5、ANKRD29與4種肺癌細(xì)胞系細(xì)胞功能的相關(guān)性分析1)ANKRD29與4種肺癌細(xì)胞系遷移的相關(guān)性24小時(shí),四種細(xì)胞之間兩兩比較差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.001);48小時(shí),四種細(xì)胞之間差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.0014);72小時(shí),四種細(xì)胞之間差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.0005);96小時(shí),四種細(xì)胞之間差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.001)。2)ANKRD29與4種肺癌細(xì)胞系活性的相關(guān)性四種肺癌細(xì)胞系活性在0-5天并未表現(xiàn)明顯差異。H1975與Hcc8細(xì)胞增殖差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.2194);H1975與A549細(xì)胞增殖差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.4936);H1975與H1299細(xì)胞增殖差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.2928);Hcc827與A549細(xì)胞增殖差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.2051);Hcc827與H1299細(xì)胞增殖差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.3955);H1299與A549細(xì)胞增殖差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.2804)。3)ANKRD29與4種肺癌細(xì)胞系增殖的相關(guān)性Hcc8與A549、H1975、H1299相比,增殖差異有明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.0063);H1299、Hcc827、A549細(xì)胞兩兩比較,增殖差異無明顯統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.495)。結(jié)論1、NSCLC患者中ANKRD29 m RNA在肺癌組織中的表達(dá)量顯著高于癌旁組織。2、ANKRD29在肺癌組織中的表達(dá)差異與性別、年齡、吸煙史、組織學(xué)類型、TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移未見明顯相關(guān)性。3、高表達(dá)組淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移N2、TNM III期占比高于低表達(dá)組,P值偏小。4、ANKRD29 m RNA低表達(dá)組預(yù)后有優(yōu)于高表達(dá)組的趨勢(shì)。5、本研究提示ANKRD29可能是NSCLC的促癌基因之一,可能與肺癌細(xì)胞的遷移能力有相關(guān)性,還有待后續(xù)實(shí)驗(yàn)繼續(xù)探索。
[Abstract]:In this study , we studied the expression of ANKRD29 in lung cancer patients with lung cancer as experimental group . The results showed that the expression of ANKRD29 gene ( such as tumor suppressor gene p16 and p18 ) was significantly higher than that in patients with advanced lung cancer . The relationship between the expression of ANKRD29 and ANKRD29 in NSCLC patients was analyzed by ROC curve and Kaplan Meire ' s survival curve . The expression of ANKRD29 mRNA in lung cancer cell lines was significantly lower than that in high expression group ( P = 0 . The results suggest that ANKRD29 may be one of the pro - oncogene genes of NSCLC and may be associated with the metastasis ability of lung cancer cells .

【學(xué)位授予單位】:廣州醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R734.2

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