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桃鈣調(diào)磷酸酶B類似蛋白基因家族鑒定與分析

發(fā)布時(shí)間:2018-05-02 08:32

  本文選題:鈣調(diào)磷酸酶B類似蛋白 + ; 參考:《西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)》2017年03期


【摘要】:為了研究桃鈣調(diào)磷酸酶B類似蛋白(CBLs)基因家族在桃中如何發(fā)揮作用。利用桃基因組數(shù)據(jù)庫,通過生物信息學(xué)手段,鑒定桃CBL家族基因的基因結(jié)構(gòu)、染色體定位和編碼蛋白,通過序列比對進(jìn)行進(jìn)化和分類分析。結(jié)果表明,桃基因組中含有8個(gè)CBL家族基因,分布于桃的5條染色體上。MEME和Pfam保守結(jié)構(gòu)域分析顯示,桃CBL蛋白均含有4個(gè)保守的EF結(jié)構(gòu)域。進(jìn)化樹分析表明CBLs可分為4個(gè)亞家族。TMHMM 2.0Server分析顯示僅PpCBL1含有1個(gè)跨膜區(qū)。PlantsPFeatureScan分析顯示PpCBL2、3和5均含有1個(gè)N-豆蔻;稽c(diǎn)。NetPhos 2.0 Server結(jié)果顯示PpCBLs存在著大量的絲氨酸(Ser)、蘇氨酸(Thr)及酪氨酸(Tyr)潛在磷酸化位點(diǎn)。以上結(jié)果將為今后揭示桃CBL的功能提供重要的理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:The gene structure , chromosome location and coding protein of the gene family of Prunus persica were identified by bioinformatics . The results showed that there were 4 conserved EF domains in the peach genome . The results showed that there were 4 conserved EF domains in the peach genome . The results showed that PpCBL21 , 3 and 5 contained 1 N - myristoylation site .

【作者單位】: 北京市農(nóng)林科學(xué)院農(nóng)業(yè)基因資源與生物技術(shù)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;中國科學(xué)院大學(xué);
【基金】:北京市農(nóng)林科學(xué)院青年科研基金項(xiàng)目(QNJJ201416);北京市農(nóng)林科學(xué)院科技創(chuàng)新能力建設(shè)專項(xiàng)(KJCX20140202) 北京市科技計(jì)劃(Z151100001015005)
【分類號】:S662.1

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本文編號:1833167

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