發(fā)布時(shí)間：2018-04-28 19:39

  本文選題：多發(fā)性骨髓瘤 + 差異表達(dá)基因�。� 參考：《第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年07期

【摘要】：目的篩選多發(fā)性骨髓瘤(MM)患者與正常人群之間的差異表達(dá)基因(DEGs),探究MM的發(fā)病機(jī)制,為MM的基因診斷和治療提供導(dǎo)向。方法從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索獲取MM患者的芯片數(shù)據(jù),通過(guò)Morpheus在線工具進(jìn)行芯片數(shù)據(jù)質(zhì)量控制和DEGs的篩選,運(yùn)用DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)篩選獲得的DEGs行基因富集和通路分析,通過(guò)STRING數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),并采用Cytoscape軟件行模塊分析。結(jié)果共獲得16 211個(gè)DEGs,包括7 586個(gè)上調(diào)基因和8 625個(gè)下調(diào)基因(P0.05)�；虮倔w(GO)分析結(jié)果表明,生物學(xué)過(guò)程中上調(diào)DEGs主要涉及鞘糖脂代謝等30個(gè)功能簇,下調(diào)DEGs涉及細(xì)胞分裂等163個(gè)功能簇;分子功能中上調(diào)DEGs主要涉及蛋白質(zhì)結(jié)合等29個(gè)功能簇,下調(diào)DEGs主要涉及組蛋白結(jié)合等59個(gè)功能簇;細(xì)胞成分中上調(diào)DEGs主要集中在細(xì)胞溶質(zhì)等27個(gè)功能簇中,而下調(diào)DEGs主要集中在核質(zhì)等78個(gè)功能簇中。京都基因與基因組百科全書(shū)(KEGG)分析結(jié)果表明,上調(diào)DEGs主要涉及溶酶體相關(guān)通路等26條通路,下調(diào)DEGs主要涉及DNA復(fù)制等27條通路。蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析示CDK1、TOP2A、AURKB、BRCA1、CHEK1、PTEN、RAD51、GMPS、CDC45和CDKN2A 10個(gè)基因?yàn)楦患潭茸罡叩暮诵腄EGs,模塊分析顯示得分最高的3個(gè)基因模塊主要與核分裂、DNA復(fù)制和核酸代謝過(guò)程相關(guān)。結(jié)論通過(guò)多種生物信息學(xué)方法篩選獲得了MM患者和健康對(duì)照組的DEGs,并從不同角度闡釋了MM發(fā)病機(jī)制的相關(guān)基因及其表達(dá)特征,為MM特異性診斷標(biāo)志和靶向治療等提供了依據(jù)。
[Abstract]:Objective to screen the differentially expressed gene (DEGsN) between multiple myeloma (MM) patients and normal controls, to explore the pathogenesis of MM and to provide guidance for the gene diagnosis and treatment of MM. Methods the microarray data of MM patients were retrieved from the GEO database. The chip data quality control and DEGs screening were carried out by Morpheus online tools. The gene enrichment and pathway analysis of DEGs were performed by DAVID database. Protein interaction network was constructed by STRING database and analyzed by Cytoscape software line module. Results A total of 16 211 DEGs were obtained, including 7 586 up-regulated genes and 8 625 down-regulated genes (P0.05). The results of gene ontology analysis showed that up-regulated DEGs mainly involved 30 functional clusters such as sheath glycolipid metabolism, down-regulated DEGs related to cell division and so on, and up-regulated DEGs mainly related to 29 functional clusters such as protein binding in the molecular function, which was related to 30 functional clusters such as sheath glycolipid metabolism, down-regulation of DEGs and cell division. Down-regulation of DEGs mainly involves 59 functional clusters such as histone binding, up-regulation of DEGs in cell components is mainly concentrated in 27 functional clusters such as cell solute, while down-regulated DEGs is mainly concentrated in 78 functional clusters such as nuclear and cytoplasm. KEGG analysis of Kyoto gene and genome encyclopedia showed that up-regulation of DEGs mainly involved 26 lysosomal pathways and down-regulation of DEGs mainly involved 27 pathways such as DNA replication. Protein interaction network analysis showed that CDK1 / TOP2An AURKBU BRCA1 / CHEK1 / PTEK1 / RAD51 / GMPSCDC45 and CDKN2A had the highest concentration of core DEGs.The results showed that the three gene modules with the highest score were mainly related to the replication of mitotic DNA and the process of nucleic acid metabolism. Conclusion the DEGs of MM patients and healthy controls were obtained by various bioinformatics methods, and the related genes and their expression characteristics of MM pathogenesis were explained from different angles, which provided the basis for the specific diagnostic markers and targeted therapy of MM.
【作者單位】： 第二軍醫(yī)大學(xué)海軍醫(yī)學(xué)系學(xué)員3隊(duì);第二軍醫(yī)大學(xué)長(zhǎng)海醫(yī)院脊柱外科;
【分類號(hào)】：R733.3

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 丁亞文,邱玉健,周家善;多發(fā)性骨髓瘤誤診1例[J];山東醫(yī)藥;2000年23期

2 陳燕,王燕婷,歐陽(yáng)仁榮;未分泌型多發(fā)性骨髓瘤二例[J];上海醫(yī)學(xué);2000年02期

3 賈有榮,方忠梅,劉偉;刻舟求劍顧舊病 景過(guò)時(shí)遷漏新疾──1例多發(fā)性骨髓瘤誤診的經(jīng)過(guò)[J];新醫(yī)學(xué);2000年03期

4 王煒琴,盧興國(guó),朱彪;多發(fā)性骨髓瘤患者的丙型肝炎病毒感染[J];中華血液學(xué)雜志;2000年05期

5 侯健;加強(qiáng)對(duì)多發(fā)性骨髓瘤的研究[J];中華血液學(xué)雜志;2000年11期

6 余潤(rùn)泉;多發(fā)性骨髓瘤治療進(jìn)展[J];中華血液學(xué)雜志;2000年11期

7 劉以淑,肖文義;12例多發(fā)性骨髓瘤誤診分析[J];重慶醫(yī)學(xué);2000年02期

8 何建明;以癲癇首發(fā)的多發(fā)性骨髓瘤一例報(bào)告[J];華夏醫(yī)學(xué);2000年01期

9 潘海波;多發(fā)性骨髓瘤非典型表現(xiàn)誤診19例分析[J];廣西醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2000年05期

10 孫可;多發(fā)性骨髓瘤誤診分析(附13例報(bào)告)[J];廣西醫(yī)學(xué);2000年03期

相關(guān)會(huì)議論文 前10條

1 李利紅;冷蕓;劉晉瑋;陳文明;;多發(fā)性骨髓瘤高凝機(jī)制的研究[A];第12屆全國(guó)實(shí)驗(yàn)血液學(xué)會(huì)議論文摘要[C];2009年

2 汪萍;沈立松;;B淋巴細(xì)胞刺激物與多發(fā)性骨髓瘤[A];全國(guó)臨床免疫檢驗(yàn)研討會(huì)暨第六屆全國(guó)臨床免疫學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2009年

3 陳文明;;多發(fā)性骨髓瘤的診斷與治療[A];全國(guó)中西醫(yī)結(jié)合血液學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2010年

4 郭宇;;多發(fā)性骨髓瘤15例延誤診斷原因分析[A];第十一屆山西省血液病學(xué)術(shù)年會(huì)暨國(guó)家級(jí)及山西省繼續(xù)醫(yī)學(xué)教育學(xué)習(xí)班資料匯編[C];2010年

5 陸海波;白玉賢;吳瑾;周建華;;25例多發(fā)性骨髓瘤的診治分析[A];2000全國(guó)腫瘤學(xué)術(shù)大會(huì)論文集[C];2000年

6 孫延霞;張鳳春;盧振霞;孫步彤;林玉梅;;白介素6在多發(fā)性骨髓瘤患者中的表達(dá)與臨床[A];2000全國(guó)腫瘤學(xué)術(shù)大會(huì)論文集[C];2000年

7 陳文明;翟玉華;張鵬;宿麗;;多發(fā)性骨髓瘤白介素-6和血管內(nèi)皮細(xì)胞生長(zhǎng)因子的檢測(cè)及意義[A];第九屆全國(guó)實(shí)驗(yàn)血液學(xué)會(huì)議論文摘要匯編[C];2003年

8 陳文明;翟玉華;張鵬;宿麗;;多發(fā)性骨髓瘤白介素-6和血管內(nèi)皮細(xì)胞生長(zhǎng)因子的檢測(cè)及意義[A];第三屆全國(guó)血液免疫學(xué)學(xué)術(shù)大會(huì)論文集[C];2003年

9 鄭立;;59例多發(fā)性骨髓瘤的臨床分析[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第八次全國(guó)血液學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2004年

10 ;多發(fā)性骨髓瘤和并發(fā)癥處理[A];2005年華東六省一市血液病學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議暨浙江省血液病學(xué)學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2005年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前10條

1 李穎;我國(guó)發(fā)布首個(gè)多發(fā)性骨髓瘤診治指南[N];科技日?qǐng)?bào);2008年

2 王建新;對(duì)多發(fā)性骨髓瘤治療要有信心[N];中國(guó)消費(fèi)者報(bào);2008年

3 河南省腫瘤研究所 程心超;識(shí)別多發(fā)性骨髓瘤[N];健康報(bào);2010年

4 天津市腫瘤醫(yī)院血液科主任 張翼澾　李運(yùn)紅 胡顏 整理;多發(fā)性骨髓瘤 發(fā)病靜悄悄[N];健康報(bào);2011年

5 北京朝陽(yáng)醫(yī)院京西院區(qū)血液與腫瘤科主任醫(yī)師 黃仲夏;多發(fā)性骨髓瘤易誤診[N];健康報(bào);2013年

6 馬飛;抗多發(fā)性骨髓瘤新藥研發(fā)踏上新征途[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2013年

7 記者 馮衛(wèi)東;多發(fā)性骨髓瘤復(fù)發(fā)機(jī)理揭開(kāi)[N];科技日?qǐng)?bào);2013年

8 陳文明邋馮靜;多發(fā)性骨髓瘤 把握治療時(shí)機(jī)[N];健康報(bào);2007年

9 李穎;萬(wàn)珂為多發(fā)性骨髓瘤帶來(lái)希望[N];科技日?qǐng)?bào);2007年

10 徐述湘;多發(fā)性骨髓瘤治療進(jìn)入新階段[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2007年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前10條

1 鄧書(shū)會(huì);多發(fā)性骨髓瘤伴髓外病變臨床研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2014年

2 王棟;PAX5通過(guò)結(jié)合RIP2調(diào)控多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞NF-κB信號(hào)通路[D];中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué);2013年

3 劉增艷;miR-186抑制多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞增殖的作用及機(jī)制研究[D];山東大學(xué);2016年

4 于曉晨;多發(fā)性骨髓瘤髓外病變患者M(jìn)YC激活的預(yù)后意義及其分子機(jī)制探討[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2016年

5 范宇;ZNF545在多發(fā)性骨髓瘤、宮頸癌和食管癌中的表觀調(diào)控及其抑制腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)的機(jī)制研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2016年

6 魏華萍;嵌合抗原受體修飾的NK細(xì)胞在多發(fā)性骨髓瘤中的應(yīng)用研究[D];中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院;2016年

7 韓曉雁;多發(fā)性骨髓瘤化療相關(guān)性周?chē)窠?jīng)病變的防治策略及其相關(guān)細(xì)胞因子的研究[D];浙江大學(xué);2016年

8 吳洪坤;miR-145-3p靶向HDAC4調(diào)控多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞凋亡與自噬的作用及機(jī)制研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2016年

9 李燕;轉(zhuǎn)錄因子HOXB7對(duì)多發(fā)性骨髓瘤發(fā)生、發(fā)展的影響及其機(jī)制的研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2017年

10 郭杏;高遷移率族蛋白B1（HMGB1）在多發(fā)性骨髓瘤耐藥中的作用及機(jī)制研究[D];浙江大學(xué);2017年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 張艷花;天然小分子化合物CADPE和ZZZ-1體外抗多發(fā)性骨髓瘤作用及潛在機(jī)制研究[D];浙江大學(xué);2015年

2 楊志瑞;去甲基化藥物聯(lián)合DLI治療多發(fā)性骨髓瘤的免疫效應(yīng)和機(jī)制研究[D];中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院;2015年

3 余慶峰;神經(jīng)鈣粘素在多發(fā)性骨髓瘤患者骨髓瘤細(xì)胞中的表達(dá)及臨床意義[D];鄭州大學(xué);2015年

4 程瑩;淋巴細(xì)胞絕對(duì)數(shù)在初診多發(fā)性骨髓瘤中的臨床意義[D];寧夏醫(yī)科大學(xué);2015年

5 王蕾;泊馬度胺聯(lián)合CAR-T細(xì)胞抗多發(fā)性骨髓瘤效應(yīng)的實(shí)驗(yàn)研究[D];蘭州大學(xué);2015年

6 蘆晗;三種實(shí)驗(yàn)技術(shù)在多發(fā)性骨髓瘤檢測(cè)中的應(yīng)用[D];新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院;2015年

7 王芝濤;髓系來(lái)源抑制性細(xì)胞在多發(fā)性骨髓瘤患者中表達(dá)及臨床意義[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2015年

8 葛雪蘋(píng);粒細(xì)胞集落刺激因子聯(lián)合BCD方案誘導(dǎo)治療初治非多發(fā)性骨髓瘤的療效及安全性評(píng)估[D];蘇州大學(xué);2015年

9 張玉皎;硼替佐米聯(lián)合地西他濱對(duì)多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞株RPMI8226作用的實(shí)驗(yàn)研究[D];蘇州大學(xué);2015年

10 陳丹;桔梗皂苷D抑制人多發(fā)性骨髓瘤（RPMI8226）增殖及其機(jī)制的研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2015年

，

本文編號(hào)：1816594