丹參中轉(zhuǎn)錄因子基因SmMYB-like 1的克隆和表達(dá)分析
本文選題:丹參 + RR; 參考:《揚(yáng)州大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版)》2017年03期
【摘要】:利用同源克隆和RACE相結(jié)合的方法從丹參中克隆得到1條R2R3 MYB轉(zhuǎn)錄因子基因SmMYB-like 1(GenBank登錄號(hào)為JX997333)的全長(zhǎng)cDNA序列。該基因含1個(gè)960bp的開放閱讀框,編碼319個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)其分子量為35.84ku,等電點(diǎn)為6.24。對(duì)SmMYB-like 1的氨基酸序列進(jìn)行多序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析,并對(duì)其二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)。qRT-PCR結(jié)果表明:SmMYB-like 1在根、莖、葉和花中均有表達(dá),其中在根中的表達(dá)量最低,在葉和花中的表達(dá)量較高。構(gòu)建融合表達(dá)載體,利用基因槍轟擊洋蔥表皮細(xì)胞研究SmMYB-like 1蛋白的亞細(xì)胞定位,發(fā)現(xiàn)該蛋白在細(xì)胞核和細(xì)胞膜中均有分布。
[Abstract]:The full-length cDNA sequence of R2R3 MYB transcription factor gene SmMYB-like 1(GenBank was cloned from Salvia miltiorrhiza by homologous cloning and RACE.The gene contains an open reading frame of 960bp and encodes 319 amino acids with a predicted molecular weight of 35.84kuand a isoelectric point of 6.24.The amino acid sequences of SmMYB-like 1 were analyzed by multiple sequence alignment and phylogenetic tree analysis. The results of qRT-PCR showed that: SmMYB-like 1 was expressed in roots, stems, leaves and flowers, and the lowest in roots.The expression was higher in leaves and flowers.The fusion expression vector was constructed and the subcellular localization of SmMYB-like 1 protein was studied by bombarding onion epidermis cells with gene gun. It was found that the protein was distributed in nucleus and cell membrane.
【作者單位】: 揚(yáng)州大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;浙江理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31700257、81773835) 江蘇省高校自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(16KJB180032) 中國(guó)博士后科學(xué)基金面上項(xiàng)目(2015M571826)
【分類號(hào)】:Q943.2;S567.53
【相似文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):1751609
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