牛TNS1基因的克隆和生物信息學(xué)分析
本文選題:牛 + 轉(zhuǎn)基因; 參考:《黑龍江畜牧獸醫(yī)》2017年15期
【摘要】:為了克隆牛TNS1基因序列,試驗(yàn)以人TNS1基因序列為探針,通過NCBI在線網(wǎng)站BLAST獲得同源性較高的牛表達(dá)序列標(biāo)簽(ESTs)及部分mRNA序列,采用RT-PCR方法從牛肌肉組織克隆cDNA序列并與牛ESTs和mRNA序列進(jìn)行拼接,獲得牛TNS1基因序列。結(jié)果表明:克隆獲得的牛TNS1基因含有32個(gè)外顯子和31個(gè)內(nèi)含子,編碼區(qū)長(zhǎng)度為5 148 bp,編碼1 715個(gè)氨基酸。該蛋白含有149個(gè)磷酸化位點(diǎn),分別位于絲氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)和蘇氨酸(Thr)殘基上,二級(jí)結(jié)構(gòu)以無規(guī)則卷曲為主,含有PTEN_C2、Src同源結(jié)構(gòu)域2(SH2)和磷酸化酪氨酸結(jié)合區(qū)域(PTB)3個(gè)功能結(jié)構(gòu)域。牛TNS1蛋白線粒體靶向肽及分泌通路信號(hào)肽所占的比例很小,大部分分布于微體和細(xì)胞核內(nèi),不屬于分泌蛋白。
[Abstract]:In order to sequence the TNS1 gene of cloned cattle, using the human TNS1 gene sequence as probe, we obtained the high homologous bovine expression sequence tags (ests) and some mRNA sequences by NCBI online website BLAST.CDNA sequence was cloned from bovine muscle tissue by RT-PCR method and spliced with bovine ESTs and mRNA sequence to obtain bovine TNS1 gene sequence.The results showed that the cloned bovine TNS1 gene contained 32 exons and 31 introns, and the coding region was 5 148 BP, encoding 1 715 amino acids.The protein contains 149 phosphorylation sites located on serine serine, tyrosine tyrosine Tyr) and threonine Thr) residues. The secondary structure is mainly irregular crimp, and contains three functional domains: PTENC2Src homologue 2SH2) and phosphorylated tyrosine binding region (PTB2).The proportion of bovine TNS1 protein mitochondrial targeting peptide and secretory pathway signal peptide is very small, most of them are distributed in microbody and nucleus, and do not belong to secretory protein.
【作者單位】: 天津農(nóng)學(xué)院動(dòng)物科學(xué)與動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家轉(zhuǎn)基因重大專項(xiàng)項(xiàng)目(2014ZX08007-002)
【分類號(hào)】:S823
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,本文編號(hào):1751587
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