青花菜肉桂酰輔酶A還原酶基因的克隆與表達(dá)特征分析
本文選題:青花菜 + 肉桂酰輔酶A還原酶。 參考:《熱帶作物學(xué)報(bào)》2016年11期
【摘要】:為研究肉桂酰輔酶A還原酶在青花菜生長發(fā)育中的作用,采用RT-PCR技術(shù)克隆青花菜Bo CCR基因全長c DNA序列,并利用q RT-PCR檢測其在不同器官中的表達(dá)模式。結(jié)果表明:Bo CCR基因開放閱讀框?yàn)?87 bp,推導(dǎo)編碼328個(gè)氨基酸。預(yù)測蛋白分子量為36.86 ku,PI值為6.04。該蛋白親水性氨基酸多于疏水性氨基酸,為親水性蛋白。高級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測表明青花菜Bo CCR蛋白具有完整的二級(jí)結(jié)構(gòu),三級(jí)結(jié)構(gòu)的α-螺旋主要位于外部,β-折疊位于內(nèi)部。分子進(jìn)化分析顯示CCR蛋白在植物進(jìn)化過程中,各屬形成單獨(dú)的分枝,可以區(qū)分其親緣關(guān)系。熒光定量技術(shù)檢測到青花菜的Bo CCR基因在花蕾發(fā)育早期表達(dá)最高,推測該基因可能與青花菜花粉發(fā)育相關(guān)。
[Abstract]:In order to study the role of cinnamyl coenzyme A reductase in the growth and development of broccoli, the full-length c DNA sequence of CCR gene of broccoli was cloned by RT-PCR, and its expression patterns in different organs were detected by Q RT-PCR.The results showed that the open reading frame of the CCR gene was 987 BP, encoding 328 amino acids.The molecular weight of the predicted protein is 36.86 Kui Pi value is 6.04.The hydrophilic amino acids are more than hydrophobic amino acids and are hydrophilic proteins.The advanced structure prediction showed that the Bo CCR protein of broccoli had a complete secondary structure, the 偽 -helix of the tertiary structure was mainly located outside, and the 尾 -fold was located in the interior.Molecular evolution analysis showed that CCR protein in plant evolution process, each genus formed a separate branch, can distinguish their kinship.The expression of Bo CCR gene in broccoli was the highest in the early stage of flower bud development, which suggested that the gene might be related to the pollen development of broccoli.
【作者單位】: 山西林業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院園藝系;溫州科技職業(yè)學(xué)院;
【基金】:浙江省重點(diǎn)科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(No.2013TD05) 溫州市種子種苗科技創(chuàng)新專項(xiàng)項(xiàng)目(No.N20150002) 浙江省自然科學(xué)基金(No.LY12C15009) 浙江省農(nóng)業(yè)新品種選育重大科技專項(xiàng)(No.2012C12903-3-3) 山西林業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院科研項(xiàng)目(No.20160403)
【分類號(hào)】:S635.3
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本文編號(hào):1749989
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