本文選題：中國荷斯坦牛 + CXCR��； 參考：《中國農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年12期

【摘要】：【目的】探討中國荷斯坦牛CXCR1基因編碼區(qū)SNP突變與臨床乳房炎和生產(chǎn)壽命的相關(guān)性�！痉椒ā扛鶕�(jù)CXCR1基因編碼區(qū)序列,利用PCR-直接測序法對低SCS和高SCS樣本各20個樣本進(jìn)行SNP篩查,最后對所選擇的4個SNP位點(diǎn)利用飛行質(zhì)譜法對866頭中國荷斯坦牛進(jìn)行檢測,同時收集所檢測牛只臨床乳房炎和生產(chǎn)壽命等信息,利用多因素方差分析法、Logistic回歸、Cox生存回歸等方法分析以上SNP位點(diǎn)突變與臨床乳房炎發(fā)生次數(shù)和生產(chǎn)壽命的相關(guān)性�！窘Y(jié)果】CXCR1基因編碼區(qū)共發(fā)現(xiàn)13個SNP位點(diǎn)(291 CT、333 CG、337 AG、365 CT、570 AG、642 AG、735 CG、816 AC、819 AG、980 AG、995 AG、1008 CT和1068 AG),分為4個連鎖群,隨后從每個連鎖群中各選擇1個SNP位點(diǎn)(642 AG,816AC,980 AG和1068 AG),利用飛行質(zhì)譜法對大樣本中國荷斯坦牛進(jìn)行檢測。4個SNP位點(diǎn)共有9種單倍型,其中單倍型GAGG頻率最高(0.3141),而單倍型ACAA頻率最低(0.0017)。CXCR1-642與2胎�；寂R床乳房炎次數(shù)有顯著相關(guān)(P0.05),AG基因型個體2胎奶�；寂R床乳房炎次數(shù)顯著高于AA基因型(P0.05),CXCR1-816 AA基因型個體3胎奶�；寂R床乳房炎次數(shù)顯著低于AC和CC基因型(P0.05),其它SNP位點(diǎn)與各胎次臨床乳房炎發(fā)生次數(shù)均無顯著相關(guān)(P0.05)。CXCR1-816與奶牛離群月齡有極顯著相關(guān)(P0.01),與奶牛生產(chǎn)月齡和離群胎次有顯著相關(guān)(P0.05),CXCR1-816 AA基因型個體生產(chǎn)月齡、離群月齡和離群胎次均顯著高于CC基因型個體(P0.05),而其它SNP位點(diǎn)對生產(chǎn)月齡、離群月齡和離群胎次均無顯著相關(guān)(P0.05)。Cox生存分析表明:只有CXCR1-816位點(diǎn)與奶牛生存時間有顯著相關(guān)(P0.05),CXCR1-816 CC基因型個體在各時間段的生存概率均低于AA和AC基因型個體�！窘Y(jié)論】CXCR1-816 AC突變與中國荷斯坦牛患臨床乳房炎次數(shù)和生產(chǎn)壽命有顯著相關(guān),在進(jìn)一步驗(yàn)證其功能后,可用于中國荷斯坦牛生產(chǎn)壽命的分子標(biāo)記輔助選擇。
[Abstract]:[objective] to investigate the relationship between SNP mutation of CXCR1 gene coding region and clinical mastitis and production life in Chinese Holstein cattle. [methods] according to the sequence of CXCR1 gene coding region,PCR- direct sequencing was used to screen 20 samples of low SCS and 20 samples of high SCS, and 4 SNP loci were selected to detect 866 Chinese Holstein cattle by flight mass spectrometry (FMS).At the same time, we collected the information of clinical mastitis and life span of production.Multivariate variance analysis and logistic regression were used to analyze the correlation between the mutation of SNP locus and the frequency of clinical mastitis and the life span of clinical mastitis. [results] A total of 13 SNP loci were found in the coding region of CXCR1 gene.CG337AGN365CTT 570AGCU 642 AGC735CG716AC819 AGC980AG995 AGC1008CT and 1068 AGNs are divided into 4 linkage groups.Then, one SNP locus was selected from each linkage group to detect large sample Chinese Holstein cattle by flying mass spectrometry. There were 9 haplotypes at the four SNP loci.The frequency of haplotype GAGG was the highest (0.3141g), while the frequency of haplotype ACAA was the lowest (0.0017). CXCR1-642 had a significant correlation with the frequency of clinical mastitis in two cows with P0.05AG genotype. The frequency of clinical mastitis in two pregnant cows was significantly higher than that of AA genotype (P0.05CXCR1-816AA).The frequency of clinical mastitis was significantly lower than that of AC and CC genotypes (P0.05). There was no significant correlation between other SNP loci and the frequency of clinical mastitis in each birth order. CXCR1-816 had a significant correlation with the age of dairy cows at different months of age, and had a significant correlation with the production age of dairy cows.There was a significant correlation between CXCR1-816AA genotype and outlier birth order, and the age of the individuals with CXCR1-816AA genotype was significant.The age of outliers and the number of outliers were significantly higher than those of CC genotype individuals (P 0.05), while the other SNP loci were significantly higher than those of CC genotypes.The survival rate of CXCR1-816CC genotype was significantly lower than that of AA and AC genotypes. [Conclusion the mutation of CXCR1-816 AC was significantly correlated with the number of clinical mastitis and life span of Chinese Holstein cattle.After further verification of its function, it can be used for molecular marker assisted selection of production life of Chinese Holstein cattle.
【作者單位】： 揚(yáng)州大學(xué)動物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;江蘇君樂寶乳業(yè)有限公司;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31372286) 江蘇省優(yōu)勢學(xué)科(PAPD) 江蘇省企業(yè)研究生工作站資助
【分類號】：S823

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本文編號：1749891