綿羊Toll樣受體7基因多態(tài)性分析
本文選題:Toll樣受體 + 多態(tài)性; 參考:《江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué)》2017年08期
【摘要】:對(duì)新疆薩?搜騎oll樣受體7基因單核苷酸進(jìn)行多態(tài)性分析,探索綿羊TLR7基因多態(tài)性與抗病力的關(guān)系,為家畜抗病育種提供候選分子標(biāo)記。采集新疆地區(qū)種羊場(chǎng)薩?搜蜓600份,提取DNA,設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性(PCR-SSCP)檢測(cè),對(duì)突變位點(diǎn)進(jìn)行測(cè)序分析。結(jié)果表明,12對(duì)擴(kuò)增引物中,第2、5、6、7對(duì)引物擴(kuò)增產(chǎn)物具有多態(tài)性。其中第2對(duì)和第7對(duì)引物擴(kuò)增產(chǎn)物存在錯(cuò)義突變,第5對(duì)和第6對(duì)引物擴(kuò)增產(chǎn)物存在同義突變。經(jīng)SSCP分析,第2對(duì)引物擴(kuò)增產(chǎn)物表現(xiàn)為3種帶型,第7對(duì)引物有2種帶型.經(jīng)序列比對(duì)分析存在A343G、A350G、A1244G的錯(cuò)義突變,氨基酸改變分別是Lys突變?yōu)镚ln,Asp突變?yōu)镾er,Glu突變?yōu)锳rg,且突變都發(fā)生在胞外區(qū)亮氨酸重復(fù)區(qū)內(nèi)。其中第2對(duì)引物的帶型AB是位點(diǎn)A343G和A350G同時(shí)發(fā)生突變。位點(diǎn)A343G的突變頻率最高為45.0%,A350G突變頻率12.0%,而A1244G突變頻率為5.8%。檢測(cè)的突變可能改變TLR7基因的功能,進(jìn)而影響其對(duì)病源的免疫應(yīng)答。為進(jìn)一步的疾病相關(guān)的研究奠定基礎(chǔ),以調(diào)查這些研究結(jié)果在家畜育種方面的用處。
[Abstract]:Single nucleotide polymorphism analysis of Toll like receptor 7 gene in Xinjiang Suffolk sheep was carried out to explore the relationship between sheep TLR7 gene polymorphism and disease resistance and to provide candidate molecular markers for animal breeding for disease resistance.600 blood samples from Suffolk sheep in Xinjiang were collected and DNA was extracted. Polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism (SSCP) was used to detect the mutation sites.The results showed that the amplified products of the second and fifth primer pairs were polymorphic.There were missense mutations in the products of the second and seventh pairs of primers, and synonymous mutations in the products of the fifth and sixth pairs of primers.By SSCP analysis, the products of the second pair of primers showed three bands, and the seventh pair of primers had two bands.Sequence alignment analysis showed that there was a missense mutation of A343GN A350GN A1244G, and the amino acid change was that Lys mutated to Glnn Asp mutation to Seroglu mutation to Arg, and all the mutations occurred in the leucine repeat region of extracellular region.The band type AB of the second pair of primers was the mutation of A343G and A350G at the same time.The highest mutation frequency of A343G was 45.0 and the mutation frequency of A350G was 12.0, while the mutation frequency of A1244G was 5.8.The detected mutations may alter the function of the TLR7 gene and then affect its immune response to the pathogeny.To lay the foundation for further disease-related research to investigate the usefulness of these findings in livestock breeding.
【作者單位】: 石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】:兵團(tuán)博士基金(編號(hào):2014BB016) 國(guó)家自然科學(xué)基金(編號(hào):30960276、31360589) 留學(xué)人員科技活動(dòng)項(xiàng)目(編號(hào):RSLX201304)
【分類號(hào)】:S826.2
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