角蛋白酶kerC基因的克隆及序列分析
本文選題:角蛋白酶 + 枯草芽孢桿菌; 參考:《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年05期
【摘要】:為克隆分析角蛋白酶ker C基因,本研究以羽毛為底物從11株實(shí)驗(yàn)室保存的芽孢桿菌中篩選角蛋白酶產(chǎn)生菌。得到了一株具有高效降解羽毛能力的枯草芽孢桿菌BS10,該菌株3 d即可降解一根完整的羽毛,以羽毛粉、天青角蛋白為底物測(cè)定其酶活力,分別達(dá)(1.88±0.10)U/mL、(1.79±0.49)U/mL。以同源克隆的方法克隆ker C基因,獲得了一條全長(zhǎng)1 149 bp的kerC基因(Gen Bank登錄號(hào):KX108888),編碼383個(gè)氨基酸。利用BLAST、ProtParm、SOPMA和MEGA等生物信息學(xué)工具對(duì)其理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)等進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)其與NCBI中的角蛋白酶基因相似性達(dá)到85%;相對(duì)分子質(zhì)量為39.095 kD,等電點(diǎn)為9.23;該基因蛋白為親水性蛋白;系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析結(jié)果與菌株信息相吻合。羽毛降解菌的獲得可促進(jìn)廢棄羽毛資源化利用;角蛋白酶基因的獲得及其分子特征的分析,為進(jìn)一步通過(guò)基因工程手段提高角蛋白酶活性提供了一定的理論依據(jù)。
[Abstract]:In order to clone and analyze the ker C gene of keratinase, keratinase producing bacteria were screened from 11 strains of Bacillus in laboratory with feather as substrate.A strain of Bacillus subtilis BS10 was obtained, which could degrade a whole feather in 3 days. The enzyme activity of BS10 was determined with feather powder and azure keratin as substrate. The enzyme activity was 1.88 鹵0.10 U / m L ~ + 1.79 鹵0.49 U / m ~ (-1) 路L ~ (-1), respectively.Ker C gene was cloned by homologous cloning, and a 1 149 BP kerC gene named Gen Bank was obtained, which encodes 383 amino acids.The physicochemical properties, secondary structure and phylogenetic tree were analyzed by using bioinformatics tools such as BLASTT-ProtParm-SOPMA and MEGA.It was found that the similarity between the protein and the keratinase gene in NCBI was 85%; the relative molecular weight was 39.095 KD and the isoelectric point was 9.23; the protein was hydrophilic protein; the phylogenetic tree analysis results were consistent with the information of the strain.The acquisition of feather degrading bacteria can promote the utilization of waste feathers, and the acquisition of keratinase gene and the analysis of its molecular characteristics provide a theoretical basis for further enhancing the activity of keratinase through genetic engineering.
【作者單位】: 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【分類號(hào)】:Q55;Q78
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本文編號(hào):1738804
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