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馬尾松PmCBL3基因的克隆及其表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-04-12 07:32

  本文選題:馬尾松 + PmCBL ; 參考:《南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版)》2017年04期


【摘要】:【目的】為明確馬尾松(Pinus massoniana)CBL基因結(jié)構(gòu)特征及干旱脅迫下的表達(dá)特性,探討該基因在馬尾松抗旱調(diào)控過程中的生物學(xué)功能!痉椒ā恳择R尾松優(yōu)良家系為試材,采用RT-PCR和RACE方法克隆馬尾松CBL基因全長cDNA,運(yùn)用生物信息學(xué)方法,分析其蛋白質(zhì)性質(zhì)和親緣關(guān)系,利用熒光定量PCR分析干旱脅迫下的基因表達(dá)特性。【結(jié)果】獲得馬尾松的一個(gè)CBL同源基因,命名為PmCBL3,該基因cDNA序列全長1 035 bp,包括681 bp的完整開放閱讀框,編碼226個(gè)氨基酸。PmCBL3蛋白含4個(gè)EF-hand功能域,且相鄰EF-hand功能域之間的氨基酸數(shù)目非常保守,屬于EFh家族蛋白。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明:該蛋白與其他植物CBL同源性達(dá)62%~98%,其中與北美云杉(Picea sitchensis)CBL親緣關(guān)系最近。qRT-PCR結(jié)果顯示,PmCBL3在馬尾松根中表達(dá)量最高,莖和葉次之;干旱第15天表達(dá)量最大,隨干旱脅迫加劇,表達(dá)量逐漸降低!窘Y(jié)論】PmCBL3基因?qū)儆贑BLs家族,與北美云杉親緣關(guān)系最近。該基因響應(yīng)干旱脅迫,推測其可能參與馬尾松干旱逆境的應(yīng)答調(diào)控。
[Abstract]:[objective] to clarify the structural characteristics of Pinus massoniana)CBL gene and its expression under drought stress, and to explore the biological function of Pinus massoniana)CBL gene during drought resistance regulation of Pinus massoniana. [methods] A good family of Pinus massoniana was used as the test material.The full-length cDNAs of CBL gene of Pinus massoniana were cloned by RT-PCR and RACE, and their protein properties and genetic relationships were analyzed by bioinformatics.Fluorescence quantitative PCR was used to analyze the gene expression characteristics under drought stress. [results] A CBL homologous gene of Pinus massoniana, named PmCBL3, was obtained. The cDNA sequence of the gene was 1 035 BP, including a complete open reading frame of 681 BP.The protein encoding 226 amino acids. PmCBL3 contains 4 EF-hand functional domains, and the number of amino acids between the adjacent EF-hand functional domains is very conserved, which belongs to the EFh family.Phylogenetic analysis showed that the homology of PmCBL3 with other plants was 62kyun98, among which, the expression of PmCBL3 was the highest in roots of Pinus massoniana, followed by stem and leaf, and the highest on the 15th day of drought, especially in the roots of Pinus massoniana, and at the 15th day of drought, the expression of PmCBL3 was the highest in the roots of Pinus massoniana, and in the 15th day of drought.[conclusion] the PmCBL3 gene belongs to the CBLs family and is closely related to Picea spruce.In response to drought stress, the gene may be involved in the regulation of response to drought stress of Pinus massoniana.
【作者單位】: 貴州省森林資源與環(huán)境研究中心貴州大學(xué)林學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31260183) “十三五”國家科技支撐計(jì)劃(2015BAD09B0102) 貴州省重大專項(xiàng)項(xiàng)目(黔科合重大專項(xiàng)字[2012]6001號(hào)) 貴州省人才基地建設(shè)項(xiàng)目(黔人領(lǐng)發(fā)[2009]9號(hào))
【分類號(hào)】:S791.248

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1738788

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