蘋果矮化砧木GA20氧化酶基因的克隆及其表達分析
本文選題:蘋果矮化砧木 + GA氧化酶; 參考:《華北農(nóng)學(xué)報》2017年01期
【摘要】:為了研究GA20氧化酶基因在蘋果矮化砧木中的分子特征和表達特征,利用RT-PCR方法從蘋果矮化砧木2號和36號c DNA中克隆了GA20氧化酶基因(GA20ox1),并對該基因及其編碼氨基酸序列以及在不同時期砧木及嫁接品種中的表達分別進行了分析。結(jié)果表明,GA20ox1基因c DNA編碼序列長1 179 bp,推導(dǎo)編碼393個氨基酸(包括終止密碼子),預(yù)測蛋白相對分子質(zhì)量44.3 k Da,理論等電點5.89,編碼的蛋白質(zhì)包含GA20ox1基因家族所具有的特征保守結(jié)構(gòu)域,系統(tǒng)進化分析表明該蛋白序列與蘋果SH40的同源性達到96.9%。實時熒光定量PCR分析顯示:36號砧木在6月份GA20ox1基因表達強度顯著低于八棱海棠對照,而7-8月份的均顯著高于對照,其上嫁接的品種7月份表達強度顯著低于對照。在7-8月份2號砧木及嫁接品種GA20ox1基因的表達強度均顯著低于對照。
[Abstract]:In order to study the expression characteristics of GA20 oxidase gene in Apple Dwarf Rootstock and molecular characteristics, using the method of RT-PCR from Apple Rootstock No. 2 and No. 36 C DNA clone GA20 oxidase gene (GA20ox1), and the gene and its encoding amino acid sequence and expression in different periods of rootstock and grafted varieties in were analyzed respectively.. the results showed that the GA20ox1 gene C encoding DNA sequence length of 1179 BP deduced encoding 393 amino acids (including termination codon), prediction of protein with a relative molecular mass of 44.3 K Da, the theoretical isoelectric point of 5.89, the characteristics of conserved domain encoding proteins containing the GA20ox1 gene family with the phylogenetic analysis indicated that the protein sequence and apple SH40 is homologous to the real-time fluorescence quantitative PCR 96.9%. analysis showed that the 36 rootstocks in June GA20ox1 gene expression intensity was significantly lower than the eight shoots while 7-8 months were control. The expression level of the grafted varieties in July was significantly lower than that of the control. In 7-8 months, the expression intensity of GA20ox1 gene in 2 rootstocks and grafted varieties was significantly lower than that in the control.
【作者單位】: 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院;
【基金】:河北省科技廳科技支撐項目(14226307D-5)
【分類號】:S661.1
【參考文獻】
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【共引文獻】
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【二級參考文獻】
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本文編號:1738410
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