懲罰廣義估計(jì)方程在縱向數(shù)據(jù)基因關(guān)聯(lián)分析中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2018-04-05 17:06
本文選題:懲罰廣義估計(jì)方程 切入點(diǎn):縱向數(shù)據(jù) 出處:《中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)》2017年04期
【摘要】:目的探討懲罰廣義估計(jì)方程(pGEE)在縱向數(shù)據(jù)基因關(guān)聯(lián)分析的應(yīng)用,為縱向數(shù)據(jù)基因關(guān)聯(lián)分析提供方法學(xué)參考。方法以小鼠糖尿病發(fā)病相關(guān)的數(shù)量性狀位點(diǎn)識別為例,分別采用廣義估計(jì)方程(GEE)和pGEE進(jìn)行分析。結(jié)果 pGEE篩選出糖尿病發(fā)病關(guān)聯(lián)位點(diǎn),為分子生物學(xué)研究提供了重要的候選位點(diǎn)。結(jié)論 pGEE能有效的實(shí)現(xiàn)高維縱向數(shù)據(jù)的變量選擇,識別出有意義的關(guān)聯(lián)位點(diǎn)。
[Abstract]:Aim to explore the application of penalized generalized estimation equation (pGEE) in gene association analysis of longitudinal data, and to provide methodological reference for gene association analysis of longitudinal data.Methods the quantitative trait loci associated with diabetes mellitus in mice were identified and analyzed by generalized estimation equation (GE) and pGEE, respectively.Results pGEE screened the associated sites of diabetes mellitus, which provided important candidate sites for molecular biology.Conclusion pGEE can effectively select the variables of high dimensional longitudinal data and identify meaningful correlation sites.
【作者單位】: 山西醫(yī)科大學(xué)衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)教研室;徐州醫(yī)科大學(xué)流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)教研室;中北大學(xué)體育學(xué)院;美國密西根州立大學(xué)統(tǒng)計(jì)與概率系;
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(30972553,31371336)
【分類號】:R195.1
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3 廉啟國;高爾生;涂曉雯;樓超華;;Stata中xtmixed與xtgee相對于縱向數(shù)據(jù)分析的比較[J];中國衛(wèi)生統(tǒng)計(jì);2007年05期
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,本文編號:1715680
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