發(fā)布時間：2018-03-31 22:33

  本文選題：卷丹百合　切入點：促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)　出處：《分子植物育種》2016年09期

【摘要】：本研究通過卷丹百合在不同濃度的鹽脅迫下確定了鹽濃度閾值,利用同源克隆和RACE技術(shù)獲得了鹽閾值濃度處理下卷丹百合MAPK基因的保守區(qū)(Genbank登錄號:JQ437268),并對其進行生物信息學分析。同時利用了DNAman軟件和Blastn序列比對在基因和蛋白角度分析了MAPK基因在鹽閾值濃度處理下的表達情況。分析表明,卷丹百合鹽閾值濃度為1.09 mg/m L,MAPK基因保守區(qū)長627 bp,推測編碼209個氨基酸,有1個高度保守的區(qū)域(TRWYRAPE)存在于MAPK氨基酸序列中,通過NCBI上的BLAST比對分析,發(fā)現(xiàn)這段保守區(qū)序列為促分裂原活化蛋白激酶超家族的催化活性區(qū)。
[Abstract]:In this study, the threshold of salt concentration was determined under different concentrations of salt stress. By using homologous cloning and RACE technique, the conserved region of MAPK gene of Lilium danlifolia was obtained by using the salt threshold concentration treatment. The accession number of Genbank was: JQ437268, and its bioinformatics analysis was carried out. Meanwhile, DNAman software and Blastn sequence alignment were used in gene and protein alignment. The expression of MAPK gene under salt threshold concentration was analyzed in this paper. The threshold concentration of the salt in lily was 1.09 mg/m, the conserved region of the MAPK gene was 627 BP, which was deduced to encode 209 amino acids, and a highly conserved region, TRWYRAPE, existed in the amino acid sequence of MAPK. The sequence was analyzed by BLAST comparison on NCBI. The conserved region was found to be the catalytic active region of the mitogen-activated protein kinase superfamily.
【作者單位】： 沈陽農(nóng)業(yè)大學遼寧省農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點實驗室設施園藝省部共建教育部重點實驗室;
【基金】：國家自然基金(31572150) 高等學校博士學科點專項科研基金課題(20112103120005)共同資助
【分類號】：S682.29

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本文編號：1692797