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普通小球藻八氫番茄紅素合成酶基因psy的cDNA克隆及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2018-03-31 22:06

  本文選題:八氫番茄紅素合成酶 切入點:psy基因 出處:《上海海洋大學(xué)學(xué)報》2017年02期


【摘要】:通過RACE-PCR首次克隆獲得了普通小球藻(Chlorella vulgaris)中八氫番茄紅素合成酶編碼基因psy的cDNA全長序列。該序列全長1 605 bp,包括1 245 bp開放閱讀框,編碼415個氨基酸。氨基酸序列對比及系統(tǒng)發(fā)生分析表明其與其他物種的PSY蛋白具有同源性,與綠藻聚為一支,與小球藻(Chlorella variabilis)、原殼小球藻(Auxenochlorella protothecoides)和佐夫色綠藻(Chromochloris zofingiensis)的遺傳距離最近(分別為0.173、0.188和0.239),并具有較高的相似性(81%~84%)和一致性(69%~76%)。亞細胞定位預(yù)測表明普通小球藻PSY前45個氨基酸殘基為葉綠體轉(zhuǎn)運肽,可能引導(dǎo)翻譯后的肽鏈進入葉綠體。保守區(qū)塊、特征基序分析及三維建模顯示,序列中具有多個潛在的蛋白質(zhì)修飾位點,以及PSY蛋白的保守區(qū)塊和特征基序,包括兩個保守的底物-鎂離子結(jié)合位點和兩個活性位點遮蔽殘基,用于結(jié)合底物及保護催化反應(yīng)中間產(chǎn)物;普通小球藻PSY蛋白中還具有一個特異的底物-鎂離子結(jié)合位點,其活性和功能還未知。總之,研究結(jié)果揭示了普通小球藻psy基因的cDNA全長序列及可能的蛋白質(zhì)序列結(jié)構(gòu)特性,結(jié)果可為構(gòu)建過表達載體,提高類胡蘿卜素產(chǎn)量提供相關(guān)信息。
[Abstract]:A full - length cDNA sequence of phytoene synthase encoding gene psy in common Chlorella vulgaris ( Chlorella vulgaris ) was obtained by RACE - PCR .

【作者單位】: 上海海洋大學(xué)水產(chǎn)與生命學(xué)院;上海農(nóng)林職業(yè)技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(41272381) 上海市知識服務(wù)平臺上海海洋大學(xué)水產(chǎn)動物遺傳與育種中心項目(ZF1206) 國家海洋局公益項目(201505034)
【分類號】:S917.3

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本文編號:1692654

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