基于COI基因的西北太平洋金烏賊群體遺傳學(xué)研究
發(fā)布時間:2018-03-24 05:19
本文選題:金烏賊 切入點:細胞色素氧化酶亞基Ⅰ 出處:《中國海洋大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版)》2017年09期
【摘要】:對中日海域5個金烏賊群體123個個體的線粒體細胞色素氧化酶亞基Ⅰ(COI)基因片段進行測序,并應(yīng)用于群體遺傳多樣性分析。經(jīng)比對得到454bp的核苷酸序列,并發(fā)現(xiàn)34個多態(tài)性位點,單突變位點15個,簡約信息位點19個,38個單倍型。群體遺傳多樣性較高,總?cè)后w的平均單倍型多樣性指數(shù)Hd為0.904,平均核苷酸多樣性Pi為0.007 7,平均核苷酸差異數(shù)K為3.490。遺傳分化系數(shù)(Fst)及遺傳距離均顯示中國日照群體與日本群體之間遺傳差異遠大于日本群體之間的遺傳差異。日照群體與日本4個群體之間的遺傳分化系數(shù)(Fst)和遺傳距離分別為0.642 9~0.725 9和0.012 8~0.014 3之間;日本愛知、愛媛、長崎、福井等群體之間遺傳分化較小。單倍型網(wǎng)絡(luò)圖及貝葉斯樹均表明5個金烏賊群體分為2大支系,4個日本群體為一個支系,中國日照群體單獨為一支系。Tajima’D檢驗和Fu’s Fs檢驗及核苷酸錯配分布說明,5個群體近期可能經(jīng)歷過種群擴張事件。
[Abstract]:Mitochondrial cytochrome oxidase subunit 鈪,
本文編號:1656878
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