本文選題：丙型肝炎病毒　切入點(diǎn)：基因型　出處：《病毒學(xué)報(bào)》2017年01期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為了解內(nèi)蒙古呼和浩特地區(qū)丙型肝炎病毒(HCV)基因型的分布特征,為本地區(qū)丙型肝炎的治療、預(yù)防提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)資料。收集呼和浩特地區(qū)2014年1月至2015年1月就診的門診和住院丙型肝炎患者血清采樣標(biāo)本149份,均為HCV抗體檢測(cè)陽性且HCVRNA定量檢測(cè)陽性。QIAGEN柱式病毒RNA提取法提取HCV RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,巢式PCR法擴(kuò)增HCVNS5B區(qū),對(duì)擴(kuò)增片段進(jìn)行測(cè)序,在NCBI BLAST上進(jìn)行序列比對(duì)得到相似度最大的參考序列并確定基因型,用Megalign,Clustal W進(jìn)行序列分析并建立同源關(guān)系樹,分析呼和浩特地區(qū)HCV感染基因型的分布特征,以及基因型與宿主性別、年齡的關(guān)系。在測(cè)序成功的94份樣本中,共檢出6個(gè)基因型,1b型占73.40%(69/94),2a型占19.14%(18/94),3a、3b、6a型各占2.12%(2/94),6u型占1.06%(1/94)。性別資料明確的93例樣本,男女基因型分布無顯著差異(P0.05)。年齡資料明確的90例HCV樣本,1+2型的患病年齡高于3+6型的患病年齡有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05)。得出內(nèi)蒙古呼和浩特地區(qū)HCV感染的基因型1b為主,其次為2a型,但也有3型、6型等基因型的傳入。HCV的基因型4型和5型未檢測(cè)到。
[Abstract]:In order to understand the distribution characteristics of hepatitis C virus (HCV) genotype in Hohhot, Inner Mongolia, it is the treatment of hepatitis C in this area. Prevention provides basic data. 149 samples of serum samples from outpatients and inpatients with hepatitis C from January 2014 to January 2015 in Hohhot region were collected, All of them were HCV antibody positive and HCVRNA positive. QIAGEN column virus RNA extraction method was used to extract HCV RNAs, reverse transcribe into cDNAs, amplify HCVNS5B region by nested PCR method, and sequence the amplified fragments. The most similar reference sequences were obtained by sequence alignment on NCBI BLAST and genotypes were determined. The homology tree was established by using Megalignus Clustal W to analyze the distribution characteristics of HCV infection genotypes in Hohhot. And the relationship between genotype and host sex, age. Among 94 samples successfully sequenced, 6 genotypes (73.40 / 94) were found to account for 19.14% / 94 / 3b ~ (6a) and 2.12% / 94 / 94 / 6u / 1.066 / 94 / 94.93 samples with clear sex data. There was no significant difference in the distribution of male and female genotypes (P0.05A). There was a significant difference in the age of HCV type 12 (> 36) in 90 patients with age data. It was concluded that the genotype 1b of HCV infection was predominant in Hohhot, Inner Mongolia. The second genotype was 2a, but genotype 4 and genotype 5 of afferent. HCV were not detected.
【作者單位】： 呼和浩特市第二醫(yī)院;內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué);呼和浩特市結(jié)核病防治所;內(nèi)蒙古第四醫(yī)院;
【基金】：內(nèi)蒙古自治區(qū)自然科學(xué)基金(項(xiàng)目號(hào):2016MS0819);題目:熒光素酶標(biāo)記的嵌合丙型肝炎病毒感染性克隆的構(gòu)建
【分類號(hào)】：R512.63

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本文編號(hào)：1649505