貉源犬瘟熱病毒血凝素基因的克隆及序列分析
本文選題:犬瘟熱病毒 切入點(diǎn):血凝素基因 出處:《動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展》2017年02期 論文類(lèi)型:期刊論文
【摘要】:為了對(duì)1例貉源犬瘟熱(CD)進(jìn)行病毒檢測(cè)并分析其血凝素H基因變異情況,本研究從1只疑似犬瘟熱病死的貉采病料進(jìn)行研磨,利用RT-PCR方法擴(kuò)增犬瘟熱病毒H基因,對(duì)擴(kuò)增出的H基因片段進(jìn)行克隆測(cè)序,并對(duì)得到的H基因序列進(jìn)行分析。結(jié)果表明,該貉感染犬瘟熱病毒,得到的H基因核苷酸和氨基酸序列與CDV野毒株同源性較高,分別為89.1%~98.0%和85.4%~97.5%。遺傳進(jìn)化分析表明其屬于Asia-1型野毒株,N連接糖基化位點(diǎn)分析結(jié)果表明,該毒株在542aa處比參考野毒株多了1個(gè)潛在的N糖基化位點(diǎn),在525aa-550aa間多出了1個(gè)抗原表位。
[Abstract]:In order to detect the virus and analyze the variation of hemagglutinin H gene in a case of raccoon dog distemper, a raccoon whose disease died of canine distemper was ground and amplified by RT-PCR method. The amplified H gene fragment was cloned and sequenced, and the H gene sequence was analyzed. The results showed that the nucleotide and amino acid sequence of the H gene of raccoon dog infected with canine distemper virus had high homology with CDV wild strain. 98.0% and 85.4%, respectively. Genetic evolution analysis showed that the strain belonged to the Asia-1 type wild strain. The results showed that the strain had one more potential N-glycosylation site than the reference wild strain at 542 AA, and one more antigen epitope at 525aa ~ 550aa.
【作者單位】: 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31472196) 青島農(nóng)業(yè)大學(xué)應(yīng)用型人才培養(yǎng)特色名校工程2015年大學(xué)生科技創(chuàng)新項(xiàng)目
【分類(lèi)號(hào)】:S852.65
【參考文獻(xiàn)】
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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
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【相似文獻(xiàn)】
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