百合水通道蛋白LotNIP5-1基因的克隆及表達分析
本文選題:百合 切入點:NIP-基因克隆 出處:《中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報》2017年03期 論文類型:期刊論文
【摘要】:為研究NIP5-1基因(Nodulin26-like intrinsic protein)在百合生長發(fā)育方面的作用機理,利用RACE技術(shù)克隆得到百合NIP5-1基因的全長cDNA序列。運用多個軟件進行生物信息學(xué)分析;采用實時熒光定量PCR(qRT-PCR)及RT-PCR技術(shù)檢測其表達特性。結(jié)果表明:1)百合NIP5-1基因全長為1 492bp,包含1個900bp的完整開放閱讀框(Open reading frame,ORF),共編碼299個氨基酸;2)百合NIP5-1蛋白屬于跨膜通道蛋白MIP超家族。具有6個跨膜區(qū);在B、E環(huán)分別具有NIP5-1蛋白特有的NPS、NPV模體,具有該蛋白Ar/R filter分子篩特有的AIGR模體;與小果野芭蕉、香瓜、葡萄、黃瓜、番茄的相似性分別為86%、83%、84%、83%和82%;3)熒光定量結(jié)果顯示,百合NIP5-1基因在莖中表達量最高,在花瓣中表達量較低,在葉、鱗莖、根中表達量均極低。RTPCR半定量檢測顯示,其在"濕"柱頭上表達量顯著高于"干"柱頭,這與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果相符合。上述研究暗示,百合NIP5-1可能是硼酸通道蛋白,在促進莖生長及生殖活動中發(fā)揮作用。
[Abstract]:In order to study the mechanism of NIP5-1 gene Nodulin 26-like intrinsic protein in lily growth and development, the full-length cDNA sequence of lily NIP5-1 gene was cloned by RACE technique. The expression characteristics of NIP5-1 gene were detected by real-time fluorescence quantitative PCR and RT-PCR. The results showed that the total length of NIP5-1 gene was 1492 BP, containing a 900bp complete open reading frame, encoding 299 amino acids and 2 amino acids. The NIP5-1 protein of lily was transmembrane. Channel protein MIP superfamily with 6 transmembrane regions; The NIP5-1 motifs of NIP5-1 protein and AIGR motifs specific to Ar/R filter molecular sieve were found in the E ring, and the similarity with small fruit field plantain, cantaloupe, grape, cucumber and tomato were 883% and 822%, respectively. Lily NIP5-1 gene expression was the highest in stem and low in petal. RT-PCR semi-quantitative analysis showed that the expression of Lilium NIP5-1 gene in "wet" stigma was significantly higher than that in "dry" stigma. These results suggest that NIP5-1 may be a borate channel protein and play an important role in promoting stem growth and reproductive activity.
【作者單位】: 北京農(nóng)學(xué)院園林學(xué)院;
【基金】:北京市科技提升計劃(TJSHG201310020020) 北京林果業(yè)生態(tài)環(huán)境功能提升協(xié)同創(chuàng)新中心(PXM2016-014207-000038) 北京市屬高等學(xué)校創(chuàng)新團隊建設(shè)項目(IDHT20150503) 城鄉(xiāng)生態(tài)環(huán)境北京實驗室項目(PXM2016-014207-000003)
【分類號】:S682.29
【參考文獻】
相關(guān)期刊論文 前3條
1 吳雪;杜長霞;楊冰冰;樊懷福;;植物水通道蛋白研究綜述[J];浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報;2015年05期
2 劉迪秋;王繼磊;葛鋒;李文嫻;;植物水通道蛋白生理功能的研究進展[J];生物學(xué)雜志;2009年05期
3 楊淑慎,山侖,郭藹光,高梅,孫達權(quán),邵艷軍;水通道蛋白與植物的抗旱性[J];干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究;2005年06期
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條
1 顏廷帥;枳BOR基因家族成員和水通道蛋白基因(SIP、NIP)的克隆與缺硼脅迫下的表達分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年
【共引文獻】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 吳金山;張景歡;李瑞杰;李英英;高豪杰;趙慶杰;;植物對干旱脅迫的生理機制及適應(yīng)性研究進展[J];山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2017年06期
2 薛曉霞;邵楊;張克中;崔金騰;;百合水通道蛋白LotNIP5-1基因的克隆及表達分析[J];中國農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報;2017年03期
3 姜忠義;張寧;黃彤;任燕雄;王磊;王少飛;;二氧化碳跨生物膜的傳遞機制研究進展[J];化工進展;2016年06期
4 趙亞波;李培綱;陳澤愷;潘偉槐;莫億偉;;花期前后稻穗水分含量與水通道蛋白基因家族表達關(guān)系研究[J];華北農(nóng)學(xué)報;2016年02期
5 蔡瓊;丁貴杰;文曉鵬;;馬尾松水通道蛋白PmPIP1基因克隆及在干旱脅迫下的表達分析[J];浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報;2016年02期
6 尹延旭;李寧;王飛;姚明華;;辣椒水通道蛋白基因CaTIP1-1啟動子的克隆及序列分析(英文)[J];Agricultural Science & Technology;2016年04期
7 吳雪;杜長霞;楊冰冰;樊懷福;;植物水通道蛋白研究綜述[J];浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報;2015年05期
8 段瑞君;熊輝巖;且原真木;;青稞根質(zhì)膜水通道蛋白基因?qū)涿{迫的響應(yīng)[J];麥類作物學(xué)報;2015年10期
9 尹延旭;李寧;王飛;姚明華;;辣椒水通道蛋白基因CaTIP1-1啟動子的克隆及序列分析[J];辣椒雜志;2015年03期
10 侯曉婉;胡偉;顏彥;徐碧玉;金志強;;香蕉MaPIP2-2基因的克隆、亞細胞定位及表達分析[J];熱帶作物學(xué)報;2015年07期
【二級參考文獻】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 徐娜;辛士超;強曉晶;于國紅;馬雪峰;程憲國;;番茄SlMIP基因參與轉(zhuǎn)基因擬南芥的滲透調(diào)節(jié)[J];植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報;2014年01期
2 陰霞;陳雯;王磊;楊若韻;薛t熿,
本文編號:1622581
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/1622581.html