本文選題：馬氏珠母貝　切入點：TRA　出處：《基因組學與應(yīng)用生物學》2016年01期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子7(TRA F7)屬于TRAFs家族,參與多種免疫炎癥反應(yīng)。為了研究馬氏珠母貝TRAF7(PmTRA F7)的生物學功能,本研究利用cDNA末端快速擴增(RACE)技術(shù)克隆獲得PmTRA F7基因cDNA的全長序列并對其序列特征進行分析;同時利用熒光定量PCR(RT-PCR)技術(shù)檢測了馬氏珠母貝不同組織中PmTRA F7基因mRNA的表達。結(jié)果顯示,PmTRA F7基因cDNA全長2246bp,開放閱讀框(ORF)1809bp,編碼602個氨基酸,5'非翻譯區(qū)(5'UTR)長211bp,3'非翻譯區(qū)(3'UTR)長226bp,預(yù)測分子量約為67.50kD,理論等電點為6.56。多序列比對結(jié)果發(fā)現(xiàn)軟體動物間TRA F7具有高保守性。軟件分析結(jié)果顯示PmTRA F7的氨基酸序列具有典型的RING結(jié)構(gòu)、鋅指結(jié)構(gòu)和7個重復的WD40序列。熒光定量數(shù)據(jù)分析表明,PmTRA F7基因在全組織中均有表達,在肝胰腺中表達量最高,外套膜和鰓中表達量也較高。
[Abstract]:Tumor necrosis factor receptor-associated factor 7 (TRA F7) belongs to the TRAFs family and participates in a variety of immune inflammatory reactions. In order to study the biological function of TRAF7(PmTRA F7, In this study, the full-length cDNA sequence of PmTRA F7 gene was cloned by rapid amplification of cDNA terminal and its sequence characteristics were analyzed. The expression of PmTRA F7 gene mRNA in different tissues of PmTRA F7 was also detected by fluorescence quantitative PCR RT-PCR.The results showed that the full length of cDNA of PmTRA F7 gene was 2246 BP, the open reading frame ORFN 1809 BP, encoding 602 amino acid 5 'untranslated region 5UTRs 211bpt3' untranslated region. The predicted molecular weight was 67.50 KD and the theoretical isoelectric point was 6.56. The results of multiple sequence alignment showed that TRA F7 was highly conserved among molluscs. The results of software analysis showed that the amino acid sequence of PmTRA F7 had a typical RING structure. Fluorescence quantitative analysis showed that the PmTRA F7 gene was expressed in the whole tissue, the highest in the hepatopancreas, and the higher in the coat and Gill.
【作者單位】： 廣東海洋大學;
【基金】：國家自然科學基金“馬氏珠母貝植核育珠移植耐受免疫相關(guān)基因與蛋白質(zhì)鑒定及關(guān)聯(lián)度研究”(31472306) 廣東省科技計劃項目“海水珍珠貝功能基因的開發(fā)與應(yīng)用研究”(2012A031100010) 湛江市科技計劃項目“馬氏珠母貝抗菌功能多肽的提取與制備技術(shù)”(2013A03022)共同資助
【分類號】：S917.4

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本文編號：1619961