高溫脅迫下茄子qRT-PCR內(nèi)參基因篩選及穩(wěn)定性分析
本文選題:茄子 切入點(diǎn):高溫脅迫 出處:《園藝學(xué)報(bào)》2017年03期 論文類型:期刊論文
【摘要】:為篩選茄子(Solanum melongena L.)高溫脅迫下穩(wěn)定表達(dá)的內(nèi)參基因,以不同茄子品系(種)為研究對象,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對來自茄子高溫脅迫轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫8個(gè)候選內(nèi)參基因(SmEF1a、SmEF2、Sm40s RPS29、Sm60s RPL24、SmTRX、SmCK I、SmDAHPS I、SmUCP)和SmActin在不同試驗(yàn)情況下進(jìn)行表達(dá)檢測,并結(jié)合GeNorm、Norm Finder、Best Keeper和ReFinder軟件綜合評價(jià)9個(gè)內(nèi)參基因的表達(dá)穩(wěn)定性。結(jié)果表明,在茄子熱敏品系05-1和耐熱品系05-4經(jīng)高溫處理不同時(shí)間的樣品和不同組織樣品以及10個(gè)耐熱性不同的茄子品系(種)中,9個(gè)內(nèi)參基因的表達(dá)豐度及穩(wěn)定性存在差異;茄子熱敏品系05-1和耐熱品系05-4高溫脅迫處理不同時(shí)間樣品中表達(dá)穩(wěn)定性最好的是SmEF1a和SmUCP;其不同組織中表達(dá)水平最穩(wěn)定的是SmEF1a和SmTRX;高溫脅迫下不同茄子品系(種)中以SmTRX和SmEF2的表達(dá)穩(wěn)定性最好。綜合來看,SmEF1a和SmTRX在所有茄子試驗(yàn)樣品中的表達(dá)穩(wěn)定性最好,而SmActin和SmCK I的表達(dá)穩(wěn)定性較差。
[Abstract]:In order to screen the stable expression genes of eggplant Solanum melongena L. under high temperature stress, different eggplant lines (species) were studied. The expression of 8 candidate internal reference genes (SmEF1aOOSm2E2OSm40s RPS29rPS29S60s RPL24s SmTRXCK-SmDAHPS / SmUCP-SmUCP) and SmActin from eggplant high temperature stress transcriptional database were detected by real-time fluorescence quantitative PCR (RFP) under different experimental conditions. Combined with GeNorm Finder Best Keeper and ReFinder software, the expression stability of 9 internal reference genes was evaluated. In eggplant heat-sensitive line 05-1 and heat-resistant strain 05-4, the expression abundance and stability of 9 internal reference genes were different among the samples and tissue samples treated with high temperature for different time and 10 eggplant lines (species) with different heat resistance. The best expression stability of eggplant was SmEF1a and SmUCP.The expression levels of SmEF1a and SmTRX were the most stable in different tissues of eggplant under high temperature stress, and different eggplant lines (species) under high temperature stress. The expression stability of SmTRX and SmEF2 was the best in all eggplant samples, and the stability of SmEF1a and SmTRX was the best in all eggplant samples. However, the expression of SmActin and SmCK I was not stable.
【作者單位】: 廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所;華南農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院;海南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31501755) 廣東省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(2015A030313568) 廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2016B070701010) 廣州市科技計(jì)劃項(xiàng)目(2014J4100094,201510010075)
【分類號】:S641.1
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