本文選題：乳腺癌　切入點(diǎn)：單核苷酸多態(tài)性　出處：《西北大學(xué)》2016年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：背景和目的：乳腺癌是一種嚴(yán)重危害女性生命健康的腫瘤,它的發(fā)病率和致死率在全世界和我國(guó)女性中均居惡性腫瘤的首位。流調(diào)資料表明,乳腺癌的發(fā)病呈一定的家族聚集現(xiàn)象,并且在群體中表現(xiàn)出易感個(gè)體差異性和地域差異性,揭示遺傳相關(guān)的因素在乳腺癌的發(fā)病過(guò)程和患病風(fēng)險(xiǎn)中起到非常重要的作用。因此,針對(duì)特定遺傳背景的人群乳腺癌遺傳關(guān)聯(lián)分析的研究,能進(jìn)一步闡明該地區(qū)乳腺癌發(fā)病的原因,以及評(píng)估患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)并為乳腺癌的預(yù)防、診斷過(guò)程和后續(xù)治療思路提供科學(xué)依據(jù)和數(shù)據(jù)支持。方法：本研究采用候選位點(diǎn)病例對(duì)照方案,2011年1月到2014年12月期間收集在陜西地區(qū)的漢族健康對(duì)照血樣583例,561例乳腺癌病例的血樣各5m1,分別提取外周血的基因組DNA。并從已發(fā)表全基因組關(guān)聯(lián)分析研究(GWAS)、Meta-分析以及別的關(guān)聯(lián)分析研究文獻(xiàn)中初步選了48個(gè)與乳腺癌發(fā)病相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNP),應(yīng)用質(zhì)譜分型檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行SNP基因多態(tài)性分型。運(yùn)用Plink軟件進(jìn)行卡方檢驗(yàn)和利用SNP Stats (http://bioinfo.iconcologia.net/SNPstats_web在線分析軟件對(duì)實(shí)驗(yàn)所得的SNP分型結(jié)果進(jìn)行Logistic回歸模型分析。在研究人群中利用SHEsis軟件對(duì)位點(diǎn)間的連鎖程度及單體型進(jìn)行構(gòu)建及分析。結(jié)果：卡方統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示：發(fā)現(xiàn)13個(gè)位點(diǎn)rs616488, rs6678914, rs1432679, rs17530068, rs3757318, rs3734805, rs2046210, rs10759243, rs10822013, rs6001930, rs981782, rs4849887, rs704010的基因型頻率在此乳腺癌病例和對(duì)照中的分布存在顯著不同(P0.05)。SNPStats logistic回歸模型經(jīng)過(guò)年齡性別和身體質(zhì)量指數(shù)調(diào)整后的分析結(jié)果表明9個(gè)位點(diǎn)與乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān),其中PEXl4基因上的位點(diǎn)rs616488在顯性模型下(C/T,C/C vs T/T)是一個(gè)保護(hù)性位點(diǎn),減少了27%的患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn),其優(yōu)勢(shì)率OR=0.73,P=0.015。其余發(fā)現(xiàn)的8個(gè)位點(diǎn),在不同logistic遺傳回歸模型下攜帶最小等位基因都有不同程度的增加患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)。當(dāng)中除了包括七個(gè)與之前卡方檢驗(yàn)顯著的位點(diǎn)HCN1基因上rs981782, RPL17P25-FAM46A基因間的xs17530068, CCDC170基因上的rs3757318和rs3734805,CCDC170-ESR1基因間的rs2046210, KLF4-RPL36AP6基因間的rS107592和ZMIZ1基因上的rs704010與乳腺癌患病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān),此外還發(fā)現(xiàn)SLC4A7基因上的rs4973768,也與乳腺癌的患病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),但在之前的卡方分析中并沒(méi)有發(fā)現(xiàn)此位點(diǎn)顯著。使用SHEsis軟件發(fā)現(xiàn)五號(hào)染色體上RPL26P19-MAP3K1基因間物理位置為56023083的rs16886165和物理位置為56031884的rs889312存在較強(qiáng)的連鎖關(guān)系,另外還發(fā)現(xiàn)了六號(hào)染色體CCDC170基因上rs3734805物理位置的151939350與CCDC170-ESR1基因間的rs2046210物理位置為151948366也存在強(qiáng)連鎖關(guān)系。進(jìn)一步單體型分析表明,僅六號(hào)染色體上兩位點(diǎn)形成的單體型“℃T”頻率為0.3184,OR=1.31,95%置信區(qū)間(95%CI)=1.08-1.58,P=0.006顯著增加患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)。雌激素受體陽(yáng)性和陰性,孕激素受體陽(yáng)性和陰性,TNM分期1-2和3-4期亞組分析發(fā)現(xiàn)除了整體顯著的位點(diǎn)外還發(fā)現(xiàn)四個(gè)位點(diǎn)：rS10510102和rs3817198分別在雌激素受體陽(yáng)性和陰性組中發(fā)現(xiàn)與亞組乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),rS16857609只在孕激素受體陽(yáng)性組中發(fā)現(xiàn)與乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。rs3817198和rs1292011分別在乳腺癌1-2期中和3-4期組中被發(fā)現(xiàn)與相應(yīng)亞組乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。結(jié)論：我們的研究結(jié)果表明九個(gè)位點(diǎn)(rs616488,rs981782, rs17530068, rs3757318, rs3734805, rs2046210, rs10759243, s2046210, rs4973768)可能跟陜西地區(qū)漢族人群乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有關(guān),但結(jié)果和機(jī)制仍需進(jìn)一步驗(yàn)證和研究。分層分析還發(fā)現(xiàn)五個(gè)位點(diǎn)rs10510102, rs3817198, rs13387042, rs16857609 和 rs1292011與不同亞組乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。我們發(fā)現(xiàn)的陽(yáng)性位點(diǎn)的結(jié)果基本與前人研究的一致,不過(guò)還是有很多被報(bào)道過(guò)的位點(diǎn)在本次研究的人群中沒(méi)有體現(xiàn)出與該地區(qū)乳腺癌的相關(guān)性。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：西北大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R737.9

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前4條

1 江文,王洪典,尚磊,黃遠(yuǎn)桂,萬(wàn)琪,徐燕;陜西地區(qū)格林-巴利綜合征發(fā)病的季節(jié)性研究[J];現(xiàn)代康復(fù);2001年13期

2 方宇,楊世民;加入WTO后陜西名藥方、名藥店發(fā)展探討[J];西北藥學(xué)雜志;2004年02期

3 ;梧桐葉[J];武漢新醫(yī)藥;1974年02期

4 ;[J];;年期

相關(guān)會(huì)議論文 前2條

1 孫愛(ài)英;;加速資本市場(chǎng)發(fā)展 促進(jìn)陜西經(jīng)濟(jì)騰飛[A];陜西省經(jīng)濟(jì)學(xué)學(xué)會(huì)會(huì)員代表會(huì)議暨第十九次年會(huì)論文集[C];1999年

2 李新貴;;明代陜西城市的空間分布——兼論城市之間的關(guān)系及其聯(lián)系的環(huán)境因素[A];明代薊鎮(zhèn)文化學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2010年

相關(guān)重要報(bào)紙文章 前10條

1 黃竟;陜西國(guó)壽隆重表彰2008年度各路功臣[N];陜西日?qǐng)?bào);2009年

2 本報(bào)記者 姚蓉;陜西草花銷售趨旺生產(chǎn)趨專[N];中國(guó)花卉報(bào);2011年

3 西北大學(xué)經(jīng)濟(jì)管理學(xué)院院長(zhǎng)、教授 白永秀;統(tǒng)籌陜西科技資源的難點(diǎn)及對(duì)策[N];陜西日?qǐng)?bào);2010年

4 任曉東 潘天波;做好陜西傳統(tǒng)文化這張名片[N];陜西日?qǐng)?bào);2011年

5 劉寧 董元;陜西地區(qū)一航企事業(yè)首次實(shí)現(xiàn)上半年盈利[N];中國(guó)航空?qǐng)?bào);2005年

6 本報(bào)記者 蘇嶸　賀小巍;三大目標(biāo)：陜西邁向富民強(qiáng)省[N];陜西日?qǐng)?bào);2011年

7 記者 張學(xué)斌　通訊員 李凱;陜西局傾力服務(wù)第十三屆西洽會(huì)[N];中國(guó)國(guó)門時(shí)報(bào);2009年

8 本報(bào)記者 汪卉　郭寶岳;陜西：雨災(zāi)直接經(jīng)濟(jì)損失近60億[N];中國(guó)經(jīng)濟(jì)時(shí)報(bào);2011年

9 本報(bào)記者 鄧大洪;陜西“斗氣”之爭(zhēng)該如何收?qǐng)�？[N];中國(guó)商報(bào);2013年

10 記者 于京玄;陜西世博游項(xiàng)目啟動(dòng)[N];西安日?qǐng)?bào);2010年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前1條

1 張萍;明清陜西商業(yè)地理研究[D];陜西師范大學(xué);2004年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 趙燕妮;陜西近代新型知識(shí)分子研究（1900-1937）[D];西北大學(xué);2009年

2 張海軒;近代陜西城市文化教育變遷研究[D];西安工程大學(xué);2016年

3 夏冰;從《關(guān)中情》和《懷鄉(xiāng)曲》看陜西風(fēng)格嗩吶的演奏藝術(shù)[D];西安音樂(lè)學(xué)院;2016年

4 尚燕歌;建國(guó)前后陜西剿匪斗爭(zhēng)研究[D];天津商業(yè)大學(xué);2016年

5 唐寧;移動(dòng)時(shí)代“美麗陜西”對(duì)外傳播策略研究[D];陜西科技大學(xué);2016年

6 李娟;陜西赤腳醫(yī)生與鄉(xiāng)村醫(yī)療研究（1965-1985）[D];西北大學(xué);2016年

7 周龍;陜西地區(qū)漢族人群基因多態(tài)性與乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的病例對(duì)照關(guān)聯(lián)研究[D];西北大學(xué);2016年

8 周羿辰;陜西地區(qū)出土西周原始瓷工藝特征的初步研究[D];西北大學(xué);2016年

9 丁小茹;陜西箏派音樂(lè)歷史與現(xiàn)狀研究[D];西北民族大學(xué);2015年

10 閆萌;民國(guó)時(shí)期的陜西女子教育（1912-1937）[D];寧夏大學(xué);2013年

，

本文編號(hào)：1593811