本文選題：MHC基因　切入點(diǎn)：抗病性狀　出處：《華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年04期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：用嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)感染團(tuán)頭魴(Megalobrama amblycephala)區(qū)分抗病和易感組,通過PCR擴(kuò)增及測序在MHCⅡα基因上篩選單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(single nucleotide polymorphisms,SNP),利用高分辨率熔解曲線法和限制性內(nèi)切酶酶切法對SNP進(jìn)行分型,分析其多態(tài)性及與抗病性狀之間的關(guān)系。在MHCⅡa基因上共篩選出35個(gè)候選SNP位點(diǎn),占MHCⅡa基因總堿基的1.45%,包含30個(gè)轉(zhuǎn)換位點(diǎn)、5個(gè)顛換位點(diǎn)。其中外顯子部分有16個(gè),內(nèi)含子部分7個(gè),5′非編碼區(qū)有1個(gè),3′非編碼區(qū)有11個(gè)。有13個(gè)SNP位點(diǎn)位于編碼區(qū),占總氨基酸位點(diǎn)的5.56%,位于839bp的T/A顛換和1 663bp的A/G轉(zhuǎn)換是無義突變,其余11個(gè)SNP位點(diǎn)為有義突變。α1結(jié)構(gòu)域的SNP位點(diǎn)分別占總堿基和總氨基酸位點(diǎn)的4.88%和10.98%,明顯高于α2結(jié)構(gòu)域的1.08%和3.22%。MHCⅡα基因的21個(gè)抗原結(jié)合位點(diǎn)(peptide binding region,PBR)中,有4個(gè)位點(diǎn)變異,變異率為19.05%;而non-PBR的變異率僅為8.20%(5/61)。用SPSS軟件對分型成功的5個(gè)SNP位點(diǎn)在易感和抗病組各100尾中的基因型頻率和等位基因頻率進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)。通過卡方檢驗(yàn)分析發(fā)現(xiàn)位于1 395bp(T/A)位點(diǎn)的基因型頻率和等位基因頻率在易感和抗病組中差異極顯著,位于221bp(G/T)和1 859bp(G/T)位點(diǎn)的基因型頻率和等位基因頻率在易感組和抗病組中差異顯著。本研究結(jié)果表明團(tuán)頭魴MHCⅡα基因的多態(tài)性和抗細(xì)菌性敗血癥性狀顯著關(guān)聯(lián)。
[Abstract]:The resistant and susceptible groups of Megalobrama amblycephala infected by Aeromonas hydrophila were distinguished. MHC 鈪，

本文編號(hào)：1593516