本文選題：蕎麥　切入點：轉(zhuǎn)錄組　出處：《中國農(nóng)業(yè)科技導報》2017年02期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：蕎麥基因資源相對匱乏。以甜蕎根和金蕎根為材料,利用Illumina Hi SeqTM2000對其進行轉(zhuǎn)錄組測序,經(jīng)過de novo從頭組裝得到64 618條Unigene,其中37 546條基因得到了有效注釋。對甜蕎根和金蕎根中的差異基因進行篩選,共獲得了4 709個差異基因,其中2 460個上調(diào)表達,2 249個下調(diào)表達。這些差異基因的GO注釋集中在10個細胞組分(cellular component)、12個分子功能(molecular function)和22個生物學過程(biological process)中。對差異基因參與的代謝途徑進行富集,上調(diào)基因中共有40個代謝途徑顯著富集,下調(diào)基因中共有18個代謝途徑顯著富集,這些顯著富集的代謝途徑參與甜蕎根和金蕎根的生物學調(diào)控。最后對轉(zhuǎn)錄組中注釋到黃酮合成途徑中的關(guān)鍵基因進行了分析,共有21個基因注釋到黃酮合成途徑中的關(guān)鍵酶。不僅豐富了蕎麥的基因資源,為蕎麥分子生物學研究提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ),也為篩選甜蕎根和金蕎根中相關(guān)基因的表達趨勢提供參考依據(jù)。
[Abstract]:The genetic resources of buckwheat were relatively scarce. Using buckwheat root and buckwheat root as materials, Illumina Hi SeqTM2000 was used to sequence the transcriptome of buckwheat. A total of 64 618 Unigeneic genes were obtained by de novo ab initio assembly, of which 37 546 genes were effectively annotated. A total of 4 709 differentially expressed genes were obtained by screening the differential genes in buckwheat roots and golden buckwheat roots. Among them, 2 460 up-regulated genes were down-regulated. The go annotations of these differentially expressed genes were concentrated in 10 cellular components, 12 molecular functional molecular functionalities and 22 biological processes. The metabolic pathways involved in differential genes were enriched. A total of 40 metabolic pathways were significantly enriched in up-regulated genes, and 18 metabolic pathways in down-regulated genes were significantly enriched. These significantly enriched metabolic pathways are involved in the biological regulation of buckwheat root and buckwheat root. Finally, the key genes in the flavonoid synthesis pathway are analyzed. A total of 21 genes annotated the key enzymes in the flavonoid synthesis pathway, which not only enriched the genetic resources of buckwheat, but also provided the data basis for the study of buckwheat molecular biology. It also provides a reference for screening the expression trend of related genes in buckwheat roots and golden buckwheat roots.
【作者單位】： 貴州師范大學蕎麥產(chǎn)業(yè)技術(shù)研究中心;
【基金】：國家自然科學基金項目(31471562) 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(CARS-08-A4) 貴州省科學技術(shù)基金計劃項目(2016GZ73702) 貴州省蕎麥工程技術(shù)研究中心項目(黔科合農(nóng)G字[2015]4003號)資助
【分類號】：S517

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 穆志新;田翔;周建萍;師穎;;高效液相色譜法測定蕎麥中蘆丁含量[J];山西農(nóng)業(yè)科學;2015年11期

2 李光;余霜;陳慶富;;蕎麥茶中黃酮含量測定的三種比色法比較[J];湖北農(nóng)業(yè)科學;2015年15期

3 楊杰;王金權(quán);丁維俊;李煒弘;劉宏偉;;基于Illumina HiSeq 2000測序技術(shù)對當歸根的轉(zhuǎn)錄組特性研究[J];中草藥;2015年08期

4 同曉娟;王曉梅;黨曼;張元君;劉婷;趙立芳;;蕎麥七中黃酮類物質(zhì)的抗氧化活性研究[J];化學與生物工程;2015年04期

5 閆超;郭軍;張美莉;;蕎麥中黃酮類化合物研究進展[J];中國食物與營養(yǎng);2015年02期

6 李蕾;孫美利;張舒媛;魏穎;時曉娟;張晶;徐暾海;徐銅華;;近十年金蕎麥化學成分及藥理活性研究進展[J];中醫(yī)藥導報;2015年04期

7 閆超;郭軍;張美莉;劉莉敏;;內(nèi)蒙古蕎麥總黃酮含量測定[J];糧食與油脂;2015年02期

8 清源;;苦蕎的價值及開發(fā)利用現(xiàn)狀[J];南方農(nóng)業(yè);2014年27期

9 夏清;黃艷菲;李波;楊正明;劉圓;;HPLC法測定蕎麥不同種不同部位槲皮素和山柰酚的含量[J];中藥材;2014年07期

10 趙曉霞;太成梅;高輝;張清波;;HPLC同時測定金蕎麥中原兒茶酸和表兒茶素的含量[J];黑龍江中醫(yī)藥;2014年04期

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 夏楠;苦蕎CHS基因多樣性與黃酮含量表型多樣性分析[D];山西大學;2012年

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 黃娟;鄧嬌;陳慶富;;蕎麥根的轉(zhuǎn)錄組學分析及黃酮合成基因的鑒定[J];中國農(nóng)業(yè)科技導報;2017年02期

2 冀曉茹;喻雅琪;李聰偉;曹皓軒;龔標;白靜;;蘆丁對1型糖尿病小鼠心肌損傷的影響[J];華北理工大學學報(醫(yī)學版);2017年01期

3 黃娟;鄧嬌;石桃雄;梁成剛;張啟迪;陳慶富;;蕎麥3個種子蛋白基因的序列和表達分析[J];華南農(nóng)業(yè)大學學報;2017年01期

4 賀森;李久毅;趙榮華;俞捷;顧雯;曹冠華;;低糖南瓜蕎麥蛋糕的研制[J];食品工業(yè);2016年09期

5 譚露霖;羅文菊;艾蓉;薛紅;鄧蓉;;黔金蕎麥1號為主的中草藥飼料添加劑對仔豬腸道有害菌及免疫因子的影響[J];貴州畜牧獸醫(yī);2016年04期

6 許明錄;左浩;汪高博;高巖;袁曉芳;李柳燕;郭理想;朱雪雪;;翼蓼塊根的抗氧化活性和抑制癌細胞增殖的研究[J];河南科技學院學報(自然科學版);2016年02期

7 張京;況q，

本文編號：1575446