本文選題：羊痘病毒　切入點(diǎn)：LR基因　出處：《中國(guó)畜牧獸醫(yī)》2017年01期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為分析綿羊痘病毒L2R蛋白的分子特征,本試驗(yàn)提取了綿羊痘病毒固原株(GY)的基因組DNA,設(shè)計(jì)L2R基因引物,對(duì)L2R基因進(jìn)行擴(kuò)增,將擴(kuò)增的基因連接到pGEM-T Easy載體后轉(zhuǎn)化到大腸桿菌Trans 5α感受態(tài)細(xì)胞,篩選陽(yáng)性克隆,進(jìn)行序列測(cè)序。利用生物信息學(xué)軟件對(duì)L2R基因序列進(jìn)行預(yù)測(cè)分析。結(jié)果顯示,L2R基因序列含有一個(gè)由279個(gè)核苷酸組成的開放閱讀框,編碼92個(gè)氨基酸殘基組成的多肽,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量理論值為10.92ku,理論等電點(diǎn)為6.56。該蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)組成分別是α-螺旋占69.57%,β-折疊占9.78%,無(wú)規(guī)則卷曲占8.70%,延伸鏈占11.96%。多序列比對(duì)分析結(jié)果顯示,不同羊痘病毒分離株L2R序列高度保守。進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示,GY株與NK、TU及SA株在一個(gè)分支,表明它們之間親緣關(guān)系較近。本試驗(yàn)結(jié)果為進(jìn)一步研究L2R蛋白的生物學(xué)功能和羊痘病毒早期蛋白的分子相互作用奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:In order to analyze the molecular characteristics of sheep pox virus L2R protein, the genomic DNA of sheep pox virus GY strain was extracted, and the L2R gene primer was designed to amplify the L2R gene. The amplified gene was ligated into pGEM-T Easy vector and transformed into Escherichia coli Trans 5 偽 competent cells to screen positive clones. The sequence was sequenced. The sequence of L2R gene was predicted by bioinformatics software. The results showed that the sequence of L2R gene contained an open reading frame composed of 279 nucleotides and encoded a peptide composed of 92 amino acid residues. The theoretical value of protein molecular mass is 10.92kuand the theoretical isoelectric point is 6.56.The secondary structure of the protein consists of 偽 -helix (69.57), 尾 -fold (9.78), irregular curl (8.70), extended chain (11.96). The results of phylogenetic tree analysis showed that GY strain was in the same branch as NKTU and SA strains. These results provide a basis for the further study of the biological function of L2R protein and the molecular interaction of early protein of sheep pox virus.
【作者單位】： 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所家畜疫病病原生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;深圳出入境檢驗(yàn)檢疫局動(dòng)植物檢驗(yàn)檢疫技術(shù)中心;
【基金】：國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃課題(2016YFD0500907) 甘肅省國(guó)際科技合作專項(xiàng)(1604WKCA012);甘肅省國(guó)際科技合作專項(xiàng)(1504WKCA055)
【分類號(hào)】：S852.654

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本文編號(hào)：1567585