浙貝母肌動(dòng)蛋白基因的克隆及生物信息學(xué)分析
本文選題:浙貝母 切入點(diǎn):肌動(dòng)蛋白(Actin)基因 出處:《中成藥》2017年01期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的克隆浙貝母Fritillaria thunbergii Miq.肌動(dòng)蛋白(Actin)基因,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。方法提取浙貝母根、莖、葉、花、鱗莖總RNA,設(shè)計(jì)合成簡(jiǎn)并引物。以葉片總RNA為模板,通過(guò)RT-PCR和Ta克隆技術(shù)克隆Actin基因保守區(qū)序列片段。以該基因?yàn)閮?nèi)參基因,對(duì)3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A還原酶(HMGR)基因進(jìn)行組織特異性表達(dá)分析。結(jié)果經(jīng)RT-PCR擴(kuò)增和Ta克隆,得到1段基因序列(463 bp)。浙貝母Actin基因與岷江百合、郁金香、虎眼萬(wàn)年青、鐵皮石斛、柿子、光皮樺、玉米相似度較高(84%~98%),其氨基酸序列與阿帝露茅膏菜、甘藍(lán)型油菜、香草蘭、岷江百合、麻瘋樹(shù)、枸杞、紅海欖的同源性均在89%以上,并且其Actin蛋白與百脈根、岷江百合、郁金香親緣關(guān)系較近。HMGR基因在該植物各部位表達(dá)有顯著差異,依次為鱗莖花葉莖根。結(jié)論首次從浙貝母中克隆出Actin基因(命名為Ft Actin),可為其有效利用奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to clone Fritillaria thunbergii Miq. actin (Actinin) gene and analyze it by bioinformatics. Methods Total RNAs of root, stem, leaf, flower and bulb of Fritillaria thunbergii were extracted, and degenerate primers were designed and synthesized. Total RNA of leaves was used as template. The conserved sequence of Actin gene was cloned by RT-PCR and Ta cloning techniques. The 3- hydroxy-3-methyl-glutaryl coA reductase (HMGR) gene was analyzed for tissue specific expression by RT-PCR amplification and Ta cloning. A fragment of Actin gene of Fritillaria thunbergii was obtained, and its amino acid sequence was similar to that of Lilium tinctorius, tulip, evergreen tiger eye, Dendrobium candidum, Persimmon, Betula lucifera and maize. The amino acid sequence was similar to that of Artemisia, Brassica napus, vanilla orchid, and its amino acid sequence was similar to that of Artilla, Brassica napus and Vanilla. The homology of Minjiang Lilium, Jatropha curcas, Lycium barbarum and Red Sea Elm were all above 89%, and there were significant differences in the expression of its Actin protein with the close relationship between Lilium officinalis, Lilium Minjiang and Tulip in all parts of the plant. Conclusion the Actin gene (named Ft Actinus) was cloned from Fritillaria thunbergii for the first time, which could lay a foundation for its effective utilization.
【作者單位】: 浙江萬(wàn)里學(xué)院生物技術(shù)研究所;浙江省中藥研究所;
【基金】:浙江省中藥材育種專項(xiàng)(2016C02058) 寧波市公益類重大專項(xiàng)(2015C110007) 浙江萬(wàn)里學(xué)院重中之重學(xué)科學(xué)生創(chuàng)新項(xiàng)目(CX2015002)
【分類號(hào)】:S567.231
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,本文編號(hào):1565599
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