本文選題：水牛　切入點：甲狀旁腺素　出處：《中國畜牧獸醫(yī)》2017年09期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：本研究參考黃牛甲狀旁腺素(parathyroid hormone,PTH)基因序列設(shè)計引物,運用PCR擴增技術(shù)對水牛PTH基因進行克隆,并用生物信息學(xué)方法對序列進行分析。結(jié)果顯示,成功克隆了水牛PTH基因完整編碼區(qū)序列(CDS)348bp,可編碼115個氨基酸。該基因編碼區(qū)序列與黃牛、豬、馬、山羊、綿羊和駱駝的同源性分別為99%、93%、91%、97%、96%和92%,表明PTH基因在不同物種間高度保守。系統(tǒng)進化樹分析表明,水牛與黃牛PTH基因親緣關(guān)系最近。此外,在水牛PTH基因CDS上共發(fā)現(xiàn)了3個堿基突變,其中兩個屬于同義突變,一個屬于錯義突變。氨基酸序列分析表明,該蛋白屬于堿性、親水、穩(wěn)定型蛋白質(zhì),其分子式為C_(570)H_(941)N_(167)O_(164)S_8,分子質(zhì)量為13.01ku。二級結(jié)構(gòu)分析顯示,水牛PTH蛋白以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主,與三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果相一致。亞細胞定位分析顯示,水牛PTH蛋白分布在細胞質(zhì)(26.1%)、線粒體(21.7%)、細胞外(包括細胞壁)(17.4%)、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(13.0%)、細胞核(8.7%)、高爾基體(4.3%)和其他部位(8.7%),推測PTH蛋白可能在運輸、結(jié)合及細胞被膜等方面發(fā)揮信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。
[Abstract]:In this study, we designed primers for the sequence of parathyroid hormoney (PTH) gene of bovine parathyroid hormone, cloned the PTH gene of buffalo by PCR amplification technique, and analyzed the sequence by bioinformatics. The complete coding region of buffalo PTH gene was cloned successfully, which can encode 115 amino acids. The sequence of the complete coding region of buffalo PTH gene is similar to that of cattle, pig, horse, goat, yellow cattle, pig, horse and goat. The homology of sheep and camel were 9993and 9197%, respectively, indicating that the PTH gene was highly conserved among different species. Phylogenetic tree analysis showed that the PTH gene of buffalo and yellow cattle had the closest relationship. Three base mutations were found in buffalo PTH gene CDS, two of which were synonymous mutations and one was missense mutation. The amino acid sequence analysis showed that the protein belonged to alkaline, hydrophilic and stable proteins. The molecular formula of this protein is: Che 570H / L / N _ S _ (167O) / S _ (8) and molecular mass 13.01ku.The secondary structure analysis shows that the PTH protein of buffalo is mainly 偽 -helix and irregular curl, which is consistent with the prediction result of tertiary structure. Subcellular localization analysis shows that the molecular weight is 13.01ku.Subcellular localization analysis shows that the protein is mainly 偽 -helix and irregular curl, and is consistent with the predicted results of tertiary structure. The PTH protein of buffalo is distributed in cytoplasm 26.1%, mitochondria 21.7m, extracellular (including cell wall 17.4, endoplasmic reticulum 13.0, nucleus 8.7, Golgi 4.33) and other parts, suggesting that PTH protein may be transported. Binding and cell membrane play a role in signal transduction and transcriptional regulation.
【作者單位】： 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院廣西水牛研究所農(nóng)業(yè)部(廣西)水牛遺傳繁育重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(31660649) 廣西科技重大專項(桂科AA16450002) 廣西科技公關(guān)國合項目(桂科合1504001-3) 水�；�160207 水牛基1705005
【分類號】：Q811.4;S823.83

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本文編號：1565713