本文選題：皺紋盤鮑　切入點：黑唇鮑　出處：《山東大學》2017年碩士論文　論文類型：學位論文

【摘要】：線粒體16SrRNA、CO Ⅰ、COⅡ基因是物種線粒體基因研究中比較普遍的基因序列,在群體遺傳結(jié)構(gòu),種系發(fā)生及親緣關(guān)系研究等方面應用廣泛,是比較忠實的遺傳分子標記。本文選取中國的皺紋盤鮑(H.discus hannai),澳大利亞的黑唇鮑(H.rubra)和新西蘭的黑足鮑(H.iris)3種典型經(jīng)濟鮑作為研究對象,通過測定其線粒體16SrRNA、COⅠ、COⅡ基因序列片段,來分析其單核苷酸多態(tài)性及種內(nèi)種間一致性和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,為鮑的新品種引進、雜交育苗提供理論支持。本研究主要獲得以下結(jié)果:(1)三種鮑線粒體16S rRNA基因片段測序及系統(tǒng)發(fā)育分析采用基因測序方法,對皺紋盤鮑(H.hannai)、黑足鮑(H.iris)和黑唇鮑(H.rubra)線粒體16S rRNA基因序列片段進行PCR擴增和測序。試驗得到的序列長度分別為皺紋盤鮑544bp,黑唇鮑550bp,黑足鮑546bp;A+T堿基含量比例分別為皺紋盤鮑58.1%,黑唇鮑56.2%,黑足鮑56.4%;種內(nèi)一致性分別為皺紋盤鮑96.37%,黑唇鮑97.51%,黑足鮑99.06%。三種鮑的種間一致性為93.94%。皺紋盤鮑的堿基突變率為0.37%,黑足鮑的堿基突變率為0.55%,黑唇鮑的堿基突變率為0.36%。黑足鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.148,皺紋盤鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.116,皺紋盤鮑與黑足鮑間的遺傳距離為0.077。(2)三種鮑線粒體CO Ⅰ基因片段測序及系統(tǒng)發(fā)育研究分析采用基因測序方法,對皺紋盤鮑(H.hannai)黑足鮑(H.iris)和黑唇鮑(H.rubra)線粒體COⅠ基因序列片段進行PCR擴增和測序。實驗得到的序列長度分別為皺紋盤鮑554bp,黑唇鮑573bp,黑足鮑552bp;A+T堿基含量比例分別為皺紋盤鮑55.4%,黑唇鮑52.3%,黑足鮑53.5%;種內(nèi)一致性分別為皺紋盤鮑97.66%,黑唇鮑98.49%,黑足鮑97.42%。三種鮑的種間一致性為89.12%。皺紋盤鮑的堿基突變率為0.36%,黑足鮑的堿基突變率為0.36%,黑唇鮑的堿基突變率為2.09%。黑足鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.204,皺紋盤鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.200,皺紋盤鮑與黑足鮑間的遺傳距離為0.186。(3)種鮑線粒體COⅡ基因片段測序及系統(tǒng)發(fā)育研究分析采用基因測序方法,對皺紋盤鮑(H.hannai)、黑足鮑(H.iris)和黑唇鮑(H.rubra)線粒體COⅡ基因序列片段進行PCR擴增和測序。實驗得到的序列長度分別為皺紋盤鮑151bp,黑唇鮑150bp,黑足鮑153bp;A+T堿基含量比例分別為皺紋盤鮑58.3%,黑唇鮑53.7%,黑足鮑56.5%;種內(nèi)一致性分別為皺紋盤鮑98.23%,黑唇鮑99.33%,黑足鮑91.83%。三種鮑的種間一致性為92.51%。皺紋盤鮑的堿基突變率為3.31%,黑足鮑的堿基突變率為19.61%,黑唇鮑的堿基突變率為2.00%。黑足鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.124,皺紋盤鮑與黑唇鮑間的遺傳距離為0.192,皺紋盤鮑與黑足鮑間的遺傳距離為0.071。以上結(jié)果表明:線粒體16SrRNA、COⅠ、COⅡ基因序列片段適用于鮑種間遺傳分析、系統(tǒng)發(fā)生及親緣關(guān)系研究。數(shù)據(jù)表明線粒體16SrRNA序列最為保守,COⅡ基因序列堿基突變率最高。皺紋盤鮑與黑足鮑間的親緣關(guān)系最近。屬于同一地理種群的鮑親緣關(guān)系較近。
[Abstract]:Mitochondrial 16SrRNA, CO I and CO II gene is the gene sequence comparison research of mitochondrial genes in common species, in terms of population genetic structure, phylogeny and genetic relationship of genetic molecular markers is widely used, more loyal. This paper selects the China Abalone (H.discus hannai), Australia (black lip abalone H.rubra) and new Zealand h.iris (H.iris) of 3 typical economic abalone as the research object, through the determination of the mitochondrial 16SrRNA, CO 1, CO 2 gene fragment, to analyze the single nucleotide polymorphism and intraspecific and interspecific relationship and a system development, the introduction of new varieties of abalone, provide hybrid breeding the theory of support. The main results are as follows: (1) analyzed by gene sequencing method of three kinds of abalone mitochondrial 16S rRNA gene fragment sequencing and phylogenetic of Abalone (H.hannai), h.iris (H.iris) and black lip Abalone (H.rub RA) of mitochondrial 16S rRNA gene fragment was amplified by PCR and sequenced. Sequence length tests were Haliotis 544bp, black lip abalone 550bp, h.iris 546bp; A+T base content ratio was 58.1% black abalone, abalone lip 56.2%, h.iris 56.4%; internal consistency were wrinkles 96.37% black abalone, abalone lip 97.51%, a consistency between h.iris 99.06%. three kinds of abalone Haliotis discus hannai 93.94%. mutation rate was 0.37%, h.iris mutation rate was 0.55%, the black lip abalone mutation rate of 0.36%. h.iris and genetic distance between the black lip abalone 0.148, the genetic distance of abalone Haliotis with black lip abalone between 0.116 abalone abalone and h.iris genetic distance between the 0.077. (2) and three sequencing of mitochondrial CO gene fragment of abalone system development research and analysis by gene sequencing method of Abalone (H.hannai) h.iris (H.iris) abalone and black lips (H.rubra) of mitochondrial CO gene fragment was amplified by PCR and sequenced. The sequence length obtained from the experiment were discus hannai Ino 573bp 554bp, black lips, h.iris 552bp; A+T base content ratio was 55.4% black abalone, abalone lip 52.3%, h.iris 53.5%; internal consistency. For the 97.66% black abalone, abalone lip 98.49%, a consistency between h.iris 97.42%. three kinds of abalone Haliotis discus hannai 89.12%. mutation rate was 0.36%, h.iris mutation rate was 0.36%, the black lip abalone base mutation rate of the genetic distance 2.09%. h.iris and black abalone between lips the genetic distance was 0.204, abalone abalone and black lip abalone between 0.200 abalone abalone and h.iris genetic distance between the 0.186. (3) of the mitochondrial CO fragment and sequencing system Bao II gene phylogenetic analysis by gene sequencing method of Abalone (H.hannai), h.iris (H.iris) and black lip abalone (H.rubra) CO II mitochondrial gene fragment was amplified by PCR and sequenced. The sequence length obtained from the experiment were discus hannai Ino 150bp 151bp, black lips, h.iris 153bp; A+T base content ratio was 58.3% black abalone, abalone lip 53.7%, h.iris 56.5%; internal consistency. For the 98.23% black abalone, abalone lip 99.33%, a consistency between h.iris 91.83%. three kinds of abalone Haliotis discus hannai 92.51%. mutation rate was 3.31%, h.iris mutation rate was 19.61%, the black lip abalone mutation rate of 2.00%. h.iris and Powell left among the black lip transmission distance is 0.124, the genetic distance of abalone Haliotis with black lip abalone between 0.192 abalone abalone and h.iris genetic distance of 0.071. between the above results show that mitochondrial 16SrRNA, CO 1, CO 2 gene fragment for abalone interspecific genetic analysis, occurrence and genetic relationship of system data table. Open wire The 16SrRNA sequence was the most conservative. CO II gene sequence had the highest mutation rate. The relationship between Haliotis discus and abalone Haliotis was the closest.

【學位授予單位】：山東大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2017
【分類號】：S917.4

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本文編號：1565431