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EBV轉(zhuǎn)化B淋巴細(xì)胞的差異基因篩選

發(fā)布時(shí)間:2018-02-21 12:36

  本文關(guān)鍵詞: EB病毒 B細(xì)胞轉(zhuǎn)化 基因芯片 差異基因 出處:《廣東醫(yī)學(xué)》2017年19期  論文類型:期刊論文


【摘要】:目的通過全基因組芯片篩選正常人外周血淋巴細(xì)胞(PBLs)和EB病毒(EBV)轉(zhuǎn)化B淋巴細(xì)胞株CGM1中的差異基因,探討EBV轉(zhuǎn)化B淋巴細(xì)胞的機(jī)制。方法分離培養(yǎng)正常人外周血淋巴細(xì)胞(PBLs),通過原位雜交檢測(cè)PBLs和CGM1細(xì)胞中EBER表達(dá)情況;提取2株細(xì)胞RNA,利用人全基因組寡核苷酸基因表達(dá)譜芯片篩選2株細(xì)胞之間差異表達(dá)基因,并通過生物信息學(xué)對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO pathways和KEGG pathways分析。結(jié)果 EBER原位雜交結(jié)果顯示PBLs EBER(-),CGM1 EBER(+);CGM1細(xì)胞與PBLs之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的基因有1 587個(gè),其中上調(diào)基因897個(gè),下調(diào)基因690個(gè),這些基因主要涉及P53、PI3K-Akt、Ras、MAPK、Tolllike receptor、WNT、TNF和JAK-STAT等信號(hào)通路,與細(xì)胞周期調(diào)節(jié),B細(xì)胞增殖、活化、分化和細(xì)胞因子產(chǎn)生,DNA復(fù)制、損傷修復(fù),病毒與宿主相互作用及病毒致癌作用等相關(guān)。結(jié)論 EBV通過細(xì)胞周期調(diào)節(jié)、細(xì)胞活化與分化、DNA復(fù)制和損傷修復(fù)、病毒與宿主相互作用等多個(gè)環(huán)節(jié)參與B淋巴細(xì)胞轉(zhuǎn)化。
[Abstract]:Objective to screen the differentially expressed genes in CGM1 of B lymphocyte strain transformed by EBV and PBLsof normal human peripheral blood lymphocytes (PBLs) and EB virus (EBV) by whole genome microarray. Methods the expression of EBER in PBLs and CGM1 cells was detected by in situ hybridization. Two cell RNAs were extracted and differentially expressed genes were screened by using the whole genome oligonucleotide gene expression microarray. By bioinformatics, go pathways and KEGG pathways were used to analyze the differentially expressed genes. Results EBER in situ hybridization showed that there were 1 587 genes with significant difference between PBLs EBER-CGM 1 cells and PBLs, among which 897 genes were up-regulated. There are 690 down-regulated genes. These genes are mainly involved in the signaling pathways such as P53, PI3K-AktRas MAPK, Tolllike receptor, TNF- and JAK-STAT, and regulate cell cycle, such as proliferation, activation, differentiation and cytokine production of DNA replication, damage and repair. Conclusion EBV is involved in B lymphocyte transformation through cell cycle regulation, cell activation and differentiation, replication and repair of DNA damage, and virus / host interaction.
【作者單位】: 海南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院病理科;
【基金】:海南省自然科學(xué)基金立項(xiàng)項(xiàng)目(編號(hào):812187、814288) 海南省高等學(xué)?茖W(xué)研究項(xiàng)目(編號(hào):Hjkj2012-30) 海南醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院中青年科研培育基金立項(xiàng)課題(編號(hào):HYFYPY201401)
【分類號(hào)】:R392

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本文編號(hào):1521988

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