EBV轉化B淋巴細胞的差異基因篩選
本文關鍵詞: EB病毒 B細胞轉化 基因芯片 差異基因 出處:《廣東醫(yī)學》2017年19期 論文類型:期刊論文
【摘要】:目的通過全基因組芯片篩選正常人外周血淋巴細胞(PBLs)和EB病毒(EBV)轉化B淋巴細胞株CGM1中的差異基因,探討EBV轉化B淋巴細胞的機制。方法分離培養(yǎng)正常人外周血淋巴細胞(PBLs),通過原位雜交檢測PBLs和CGM1細胞中EBER表達情況;提取2株細胞RNA,利用人全基因組寡核苷酸基因表達譜芯片篩選2株細胞之間差異表達基因,并通過生物信息學對差異表達基因進行GO pathways和KEGG pathways分析。結果 EBER原位雜交結果顯示PBLs EBER(-),CGM1 EBER(+);CGM1細胞與PBLs之間差異有統(tǒng)計學意義的基因有1 587個,其中上調基因897個,下調基因690個,這些基因主要涉及P53、PI3K-Akt、Ras、MAPK、Tolllike receptor、WNT、TNF和JAK-STAT等信號通路,與細胞周期調節(jié),B細胞增殖、活化、分化和細胞因子產生,DNA復制、損傷修復,病毒與宿主相互作用及病毒致癌作用等相關。結論 EBV通過細胞周期調節(jié)、細胞活化與分化、DNA復制和損傷修復、病毒與宿主相互作用等多個環(huán)節(jié)參與B淋巴細胞轉化。
[Abstract]:Objective to screen the differentially expressed genes in CGM1 of B lymphocyte strain transformed by EBV and PBLsof normal human peripheral blood lymphocytes (PBLs) and EB virus (EBV) by whole genome microarray. Methods the expression of EBER in PBLs and CGM1 cells was detected by in situ hybridization. Two cell RNAs were extracted and differentially expressed genes were screened by using the whole genome oligonucleotide gene expression microarray. By bioinformatics, go pathways and KEGG pathways were used to analyze the differentially expressed genes. Results EBER in situ hybridization showed that there were 1 587 genes with significant difference between PBLs EBER-CGM 1 cells and PBLs, among which 897 genes were up-regulated. There are 690 down-regulated genes. These genes are mainly involved in the signaling pathways such as P53, PI3K-AktRas MAPK, Tolllike receptor, TNF- and JAK-STAT, and regulate cell cycle, such as proliferation, activation, differentiation and cytokine production of DNA replication, damage and repair. Conclusion EBV is involved in B lymphocyte transformation through cell cycle regulation, cell activation and differentiation, replication and repair of DNA damage, and virus / host interaction.
【作者單位】: 海南醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院病理科;
【基金】:海南省自然科學基金立項項目(編號:812187、814288) 海南省高等學?茖W研究項目(編號:Hjkj2012-30) 海南醫(yī)學院附屬醫(yī)院中青年科研培育基金立項課題(編號:HYFYPY201401)
【分類號】:R392
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,本文編號:1521988
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