本文關(guān)鍵詞： 黃瓜 WRKY 生物信息學(xué) 熒光定量PCR　出處：《作物雜志》2017年05期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：WRKY轉(zhuǎn)錄因子是植物中廣泛存在的一種轉(zhuǎn)錄因子,參與植物的生物脅迫與非生物脅迫。采用RTPCR克隆黃瓜CsWRKY23基因cDNA序列,對序列進(jìn)行結(jié)構(gòu)域、基因結(jié)構(gòu)分析,構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,通過實(shí)時熒光定量PCR(qRT-PCR)分析該基因在黃瓜根、葉組織中的表達(dá)。結(jié)果表明:CsWRKY23的cDNA開放讀碼框全長1 431bp,含有5個外顯子,4個內(nèi)含子;編碼476個氨基酸,含有兩個WRKY結(jié)構(gòu)域,編碼蛋白的分子量為52.2kDa、等電點(diǎn)為6.43;系統(tǒng)發(fā)育分析表明CsWRKY23與擬南芥AtWRKY33同源。qRTPCR結(jié)果表明該基因響應(yīng)低溫脅迫,并在根、葉組織中的表達(dá)均上調(diào)。本研究為進(jìn)一步鑒定該基因在非生物脅迫的功能奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:WRKY transcription factor is a widespread transcription factor in plants, which is involved in plant biotic stress and abiotic stress. RTPCR was used to clone the cDNA sequence of cucumber CsWRKY23 gene, and to construct phylogenetic tree. The expression of the gene in cucumber roots and leaves was analyzed by real-time fluorescence quantitative PCR qRT-PCR.The results showed that the cDNA open reading frame of 1 / CsWRKY23 contained 1 431 BP, 5 exons and 4 introns, encoding 476 amino acids and containing two WRKY domains. The molecular weight of the encoded protein was 52.2 kDa and the isoelectric point was 6.43.The phylogenetic analysis showed that CsWRKY23 and Arabidopsis AtWRKY33 homology. This study laid a foundation for further identification of the function of the gene in abiotic stress.
【作者單位】： 沈陽師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;沈陽食品檢驗(yàn)所;
【基金】：國家自然科學(xué)基金青年基金項(xiàng)目(31301815) 沈陽師范大學(xué)重大孵化項(xiàng)目(ZD201621)
【分類號】：Q943.2;S642.2

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本文編號：1521491