本文關(guān)鍵詞： 豬圓環(huán)病毒型 分離 鑒定 全基因序列 PCVd基因型　出處：《中國獸醫(yī)科學(xué)》2017年12期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：根據(jù)Gen Bank中豬圓環(huán)病毒2型(PCV 2)基因序列,設(shè)計特異性引物,用PCR方法從福州郊區(qū)某豬場疑似PMWS仔豬病料處理后接種育傳三代的PK-15細(xì)胞中擴(kuò)增1個分離毒株的全基因組,并將其克隆到p MD-18T載體上,對鑒定為陽性的重組質(zhì)粒送檢測序。對該分離株的基因全序列及其開放閱讀框2(ORF2)進(jìn)行同源性分析及遺傳進(jìn)化關(guān)系分析。PCR鑒定結(jié)果顯示,本試驗中分離到的病毒屬于PCV2,命名為PCV2-FZ株。全基因組序列分析顯示,分離株全基因組大小為1 767 bp,含有11個開放性閱讀框,其中ORF2大小為705 bp,共編碼234個氨基酸。PCV2-FZ株與參考毒株基因全序列的核苷酸同源性為94.3%~99.4%,與SD毒株同源性最高,為99.4%;與DK1980PMWSfree和DK1990PMWSfree毒株同源性最低,為94.3%。分離株與參考毒株ORF2核苷酸同源性為89.2%~99.4%,其中與SD毒株同源性最高,為99.4%,與DK1980PMWSfree毒株和DK1987PMWSfree毒株同源性最低,均為89.2%。全基因組與ORF2序列遺傳進(jìn)化樹分析均表明,PCV2-FZ株屬于PCV2d基因型。本研究從福建省首次分離并鑒定了1株P(guān)CV2d型毒株,這對PCV2流行病學(xué)研究和遺傳變異分析具有重要意義。
[Abstract]:According to the sequence of porcine circovirus type 2 (PCV2) gene in Gen Bank, a specific primer was designed and the whole genome of a isolated virus strain was amplified by PCR from PK-15 cells of suspected PMWS piglets in a pig farm in the suburb of Fuzhou. It was cloned into p MD-18T vector, and the recombinant plasmid identified as positive was submitted for sequencing. Homology analysis and genetic evolution analysis showed that the whole gene sequence of the isolate and its open reading box 2 ORF2) were analyzed. The whole genome sequence analysis showed that the whole genome size of the isolate was 1 767 BP, containing 11 open reading frames. The nucleotide homology of ORF2 was 705 BP, encoding 234 amino acids. PCV2-FZ and reference strain. The nucleotide homology was 94.33.99. 4, the highest homology with SD strain was 99.4, and the homology with DK1980PMWSfree and DK1990PMWSfree strains was the lowest. The nucleotide homology of ORF2 between the isolated strain and reference strain was 89.2and 99.4, the highest homology with SD strain was 99.4, and the homology with DK1980PMWSfree strain and DK1987PMWSfree strain was the lowest. The whole genome and ORF2 sequence genetic phylogenetic tree analysis showed that PCV2-FZ strain belonged to PCV2d genotype. One PCV2d strain was isolated and identified from Fujian Province for the first time, which is of great significance for the epidemiological study of PCV2 and the analysis of genetic variation.
【作者單位】： 福建農(nóng)林大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院;福建省獸醫(yī)中藥與動物保健重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金青年基金項目(31502110):猴頭菇多糖對氧化應(yīng)激狀態(tài)下豬小腸上皮通透性的調(diào)節(jié)及其機(jī)制
【分類號】：S852.651

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本文編號：1521122