三種非結(jié)核分枝桿菌esxB基因的克隆與序列分析
本文關(guān)鍵詞: 新金分枝桿菌 母牛分枝桿菌 恥垢分枝桿菌 esxB 表位 出處:《黑龍江畜牧獸醫(yī)》2017年05期 論文類型:期刊論文
【摘要】:為了探討非結(jié)核分枝桿菌中EsxB蛋白的生物學(xué)功能,試驗(yàn)以實(shí)驗(yàn)室分離的母牛分枝桿菌、新金分枝桿菌和恥垢分枝桿菌為對(duì)象,克隆了esxB基因,應(yīng)用生物信息學(xué)方法進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生分析,對(duì)EsxB蛋白進(jìn)行生物學(xué)特性、保守區(qū)分析以及抗原表位、可能的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測。結(jié)果表明:克隆的3種非結(jié)核分枝桿菌的esxB基因大小分別為309 bp、303 bp、294 bp,推導(dǎo)的氨基酸序列與Gen Bank中登錄的相應(yīng)菌種的氨基酸序列同源性分別為95%或97%、100%、100%;屬于WXG100蛋白超家族中CFP-10亞家族成員,具有該亞家族保守的α-螺旋和Yxxx D/E序列;預(yù)測到3條肽鏈線性B細(xì)胞表位各1個(gè),T細(xì)胞表位各4個(gè)、9個(gè)、5個(gè),部分T細(xì)胞表位與結(jié)核桿菌CFP10的CD8+T細(xì)胞表位有5~6個(gè)共同氨基酸。
[Abstract]:In order to investigate the biological function of EsxB protein in non - mycobacterium tuberculosis , the esxB gene was cloned , and the esxB gene was cloned . The sequence identity of esxB gene was 309 bp , 303 bp and 294 bp . The deduced amino acid sequence identity was 95 % or 97 % , 100 % and 100 % , respectively .
【作者單位】: 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31272566) 吉林省科技發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(20140204069NY)
【分類號(hào)】:S852.61
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,本文編號(hào):1519589
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