DNA修復(fù)基因XPD、XPC、XRCC4基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性的相關(guān)性研究
本文關(guān)鍵詞: XPD XPC XRCC4 結(jié)直腸癌 基因多態(tài)性 出處:《山東大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:研究背景結(jié)直腸癌(Colorectal Cancer,CRC)是世界上常見的惡性腫瘤之一,其發(fā)病原因和機(jī)制尚未被完全闡明。在我國,結(jié)直腸癌的發(fā)病率和死亡率迅速增高,有證據(jù)表明,除吸煙、飲酒、高紅肉、高脂肪、低纖維素?cái)z入等環(huán)境因素外,遺傳因素與結(jié)直腸癌的發(fā)生密切相關(guān),一級親屬中有結(jié)直腸癌患者時(shí)個(gè)體結(jié)直腸癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)明顯增高。人類遺傳變異最常來源于單核苷酸多態(tài)性(SNPs),有證據(jù)表明,SNPs可能促進(jìn)結(jié)直腸癌的發(fā)生。XPD、XPC、XRCC4是DNA修復(fù)基因家族的管家基因,對DNA雙鏈突變修復(fù)起重要作用,已有研究表明,XPD、XPC、XRCC4基因的多個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)能夠影響XPD、XPC、XRCC4蛋白的表達(dá)和功能,與某些疾病如惡性腫瘤、心腦血管疾病、風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、糖尿病等疾病的易感性密切相關(guān)。目的探討多態(tài)性位點(diǎn) XPD rsl3181(codon751A/C)、rs238406(codon156C/A),XPC rs2279017(i11C/A)和 XRCC4 rs3734091(codon247T/C)基因多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性的關(guān)系。方法收集北京地區(qū)338例結(jié)直腸癌患者和同地區(qū)同時(shí)期315例健康體檢者的外周血提取基因組DNA。采用TaqMan基因型檢測技術(shù)檢測XPD rs13181、rs238406,XPC rs2279017及XRCC4 rs3734091多態(tài)性位點(diǎn)基因型。采用擬合優(yōu)度卡方檢驗(yàn)檢測每個(gè)位點(diǎn)的基因型頻率是否符合Hardy-Weinberg平衡定律。采用PHASE2.1軟件構(gòu)建單倍體型并計(jì)算單倍體型頻率。采用卡方檢驗(yàn)分析年齡、性別、吸煙、飲酒等因素在研究對象中的分布。校正了年齡、性別、吸煙、飲酒等因素后采用非條件Logistic回歸模型計(jì)算調(diào)整比值比(adjusted ORs)和95%的可信區(qū)間(95%CIs)來分析基因型、等位基因及單倍體型與結(jié)直腸癌易感性的相關(guān)性。結(jié)果病例組XPD rs13181位點(diǎn)基因型GT、等位基因G的頻率明顯高于對照組(GT,adjusted OR=1.69,95%CI=1.159-2.47,P=0.007;等位基因 G,adjusted OR=1.77,95%CI=1.19-2.64,P=0.005)。病例組 XRCC4 rs3734091 位點(diǎn)基因型 GT和等位基因T的頻率顯著高于對照組(GT,adjusted OR =9.02,95%CI=5.61-14.50,P0.001;等位基因 T,adjusted OR=4.06,95%CI=2.49-6.61,P0.001)。XPD rs238406和XPCrs2279017位點(diǎn)的基因型和等位基因頻率在兩組中的分布均無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P0.05)。單倍體型分析表明:根據(jù)XPDrs238406和rs13181位點(diǎn)基因型構(gòu)建出的單倍體型GT明顯降低了個(gè)體患結(jié)直腸癌的風(fēng)險(xiǎn)(adjusted OR=0.39,95%CI=0.18-0.85,P=.018);蚵(lián)合效應(yīng)分析表明:在 XPC rs2279017位點(diǎn)含有等位基因G并且在XRCC4 rs3734091位點(diǎn)含有等位基因T的個(gè)體患結(jié)直腸癌的風(fēng)險(xiǎn)明顯增加(adjusted OR=28.43,95%CI=6.85-117.95,P0.001);在XPD rs13181位點(diǎn)含有等位基因G并且在XRCC4 rs3734091位點(diǎn)含有等位基因T的個(gè)體患結(jié)直腸癌的風(fēng)險(xiǎn)明顯增加(adjusted OR=10.24,95%CI=4.69-22.35,P0.001)。結(jié)論1.多態(tài)性位點(diǎn) XPDrs13181、rs238406,XPCrs2279017 和 XRCC4rs3734091均具有多態(tài)性;2.XPD rs13181和XRCC4 rs3734091位點(diǎn)的多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性相關(guān),而XPD rs238406和XPC rs2279017位點(diǎn)的多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性無關(guān);3.XPD rs238406和rs13181位點(diǎn)基因型單倍體型GT是結(jié)直腸癌的危險(xiǎn)因素;4.XPD、XPC和XRCC4多態(tài)位點(diǎn)等位基因之間的聯(lián)合效應(yīng)是結(jié)直腸癌發(fā)生的較強(qiáng)的危險(xiǎn)因素;5.多態(tài)性位點(diǎn)XPD rs13181和XRCC4 rs3734091有望成為篩查結(jié)直腸癌高危個(gè)體,進(jìn)而進(jìn)行針對性干預(yù)的有效遺傳標(biāo)志物。
[Abstract]:Background: colorectal carcinoma (Colorectal, Cancer, CRC) is one of the most common malignancies in the world, its causes and mechanism has not been fully elucidated. In our country, the incidence and mortality of colorectal cancer increased rapidly, there is evidence that, in addition to smoking, drinking, high red meat, high fat, low fiber intake and other environmental factors outside, the genetic factors and colorectal cancer is closely related to the occurrence of first-degree relatives with colorectal cancer patients when the individual risk of colorectal cancer increased significantly. Human genetic variation most often derived from single nucleotide polymorphisms (SNPs), there is evidence that SNPs may promote the occurrence of colorectal cancer.XPD, XPC, XRCC4 is a housekeeping gene DNA repair gene family, the DNA double strand mutation repair plays an important role, studies have shown that XPD, XPC, XRCC4 gene polymorphic loci could influence the XPD, XPC, expression and function of XRCC4 protein, and some kinds of diseases. Diseases such as malignant tumor, cardiovascular disease, rheumatoid arthritis, closely related to susceptibility to diabetes and other diseases. Objective to investigate the polymorphism of XPD rsl3181 (codon751A/C), rs238406 (codon156C/A), XPC rs2279017 (i11C/A) and XRCC4 rs3734091 (codon247T/C) gene polymorphism and susceptibility to colorectal cancer. Methods peripheral blood the collection of Beijing area in 338 cases of colorectal cancer and 315 healthy subjects at the same time, the genomic DNA. was extracted by TaqMan genotype detection of XPD rs13181, rs238406, XPC rs2279017 and XRCC4 rs3734091 polymorphism genotype. Using chi square goodness of fit test to detect genotype frequencies of each locus is consistent with the Hardy-Weinberg equilibrium law construction of haplotype haplotype frequency was calculated by PHASE2.1 software. By using the chi square test analysis of age, gender, smoking, drinking and other factors in the Study on the distribution of objects. Adjusted for age, sex, smoking, drinking and other factors by non conditional Logistic regression model adjusted odds ratio (adjusted ORs) and 95% confidence interval (95%CIs) to analyze the correlation between genotype, allele and haplotype and colorectal cancer susceptibility. The case group XPD rs13181 genotype GT, G allele frequency was significantly higher than the control group (GT, adjusted, OR=1.69,95%CI=1.159-2.47, P=0.007; allele G, adjusted OR=1.77,95%CI=1.19-2.64, P=0.005). The case group XRCC4 rs3734091 locus genotype GT and allele frequency of T was significantly higher than the control group (GT adjusted, OR =9.02,95%CI=5.61-14.50, P0.001; alleles of T, adjusted OR=4.06,95%CI=2.49-6.61, P0.001) were no significant difference between.XPD rs238406 and XPCrs2279017 loci genotype and allele frequency distribution in the two groups (P0. 05). Haplotype analysis showed that: according to the GT XPDrs238406 haplotype and rs13181 allele type construct significantly reduces the individual risk of colorectal cancer (adjusted, OR=0.39,95%CI=0.18-0.85, P=.018). The combined effects of gene analysis showed that contain allele G and contains in the XRCC4 allele of rs3734091 T in XPC rs2279017 locus of the individual the risk of colorectal cancer increased significantly (adjusted OR=28.43,95%CI=6.85-117.95, P0.001); containing G allele in XRCC4 and containing rs3734091 allele T in XPD locus rs13181 a significantly increased risk of colorectal cancer (adjusted OR=10.24,95%CI=4.69-22.35, P0.001). Conclusion the site 1. polymorphic XPDrs13181, rs238406, XPCrs2279017 and XRCC4rs3734091 have polymorphism; polymorphism and colorectal cancer 2.XPD rs13181 and XRCC4 rs3734091 loci related susceptibility, XPD rs238406 and XPC rs2279017 polymorphism has nothing to do with the susceptibility of colorectal cancer; 3.XPD rs238406 and rs13181 genotypes of the GT haplotype is a risk factor for colorectal cancer; 4.XPD, the combined effect between XPC and XRCC4 polymorphism alleles is a strong risk factor for rectal cancer; 5. polymorphic loci of XPD and rs13181 XRCC4 rs3734091 is expected to become the colorectal cancer screening in high-risk individuals, and effective intervention for genetic markers.
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:R735.34
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,本文編號:1519485
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