本文關(guān)鍵詞： 食管鱗癌 肺鱗癌 基因表達(dá)譜 基因芯片　出處：《昆明醫(yī)科大學(xué)》2016年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：[目的]利用基因芯片檢測(cè)食管鱗癌組織、相應(yīng)癌旁組織及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性食管鱗癌組織、肺鱗癌及相應(yīng)癌旁組織的共同基因表達(dá)和差異基因表達(dá)。尋求食管鱗癌具有特征性或相對(duì)特征性的表達(dá)基因,探討基因表達(dá)譜在食管鱗癌病理診斷與鑒別診斷中的臨床意義。[方法]選取昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院外科手術(shù)切除標(biāo)本,術(shù)中冰凍及術(shù)后病理進(jìn)一步確診。共食管鱗癌6例、相應(yīng)癌旁組織6例及淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性食管鱗癌2例,肺鱗癌6例及相應(yīng)癌旁組織6例。用Trzol提取相應(yīng)組織的RNA,合成cDNA探針,再與含41000個(gè)基因的微陣列(安捷倫44K Oligo基因芯片)雜交,篩選表達(dá)倍數(shù)≥13倍及P-value≤0.05的數(shù)據(jù)作為差異表達(dá)基因。[結(jié)果]食管鱗癌與相應(yīng)癌旁組織比較,共有差異表達(dá)基因5642個(gè),其表達(dá)上調(diào)基因2701個(gè),表達(dá)下調(diào)基因2941個(gè)。上調(diào)基因主要有MAGEA1、MAGEA6、 KREMEN2、MMP12、MAGEA2B、MMP13、MMP1、HMGA2、KRT17、PPP1R14C、VGF、MTL5、 MAGEA8、FOXL2NB、DLX5、KRT14、IRF6、WDR72等,下調(diào)基因主要有ATP1A2、SCARA5、 ANGPTL1、ACTG2、PDZRN4、OGN、MAL、CYP3A5、PLN、SLC2A4、SLITRK3、PDZRN4、 ACTA1、HLF、SORBS2、NCAM1、DES、RYR2、BPIFB1、PRUNE2、SCRG1、KCNB1、MYZAP、 ADH1B等。淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性食管鱗癌組織與癌旁組織比較,共有差異表達(dá)基因415個(gè)。其上調(diào)基因有157個(gè),下調(diào)基因有258個(gè),其中上調(diào)主要有HMGA2、IGLL1、 TNFRSF17、COL10A1、FCRL5、MGAT5B、LOC283028、BLK、IGJ、RUNX1、PBX4、 ESM1、ZNF761、BEND4、LAMA1等,其中下調(diào)主要有CASQ2、DES、PGM5、ATP1A2、 ADAMTS8、S100P、PLN、IL1RN、MPP7、KBTBD12、LDB3、ECM1、SYNP02等。食管鱗癌與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性食管鱗癌組織有共同表達(dá)的基因有550個(gè)。其表達(dá)上調(diào)的基因有247個(gè),表達(dá)下調(diào)的基因有303個(gè),上調(diào)基因主要有HMGA2、COL10A1、 LOC283028、RUNX1、ESM1、ZNF761、TRAF2、CPNE7、ANKMY1、UBE2C、KNTC1、PABPC1L、 HIST1H4K、KCNK12、CCT6A、KRT18,下調(diào)基因主要有CASQ2、DES、PGM5、ATP1A2、ADAMTS8、 S100P、PLN、MPP7、KBTBD12、LDB3、ECM1、SYNPO2、SLPI、RYR2。肺鱗癌組織與相應(yīng)癌旁組織比較,共有差異表達(dá)基因1155個(gè)。其表達(dá)上調(diào)基因355個(gè),表達(dá)下調(diào)基因800個(gè),其中上調(diào)主要有MMP12、SPP1、NTRK2、DLX6、UCHL1、ADAM23、STRA6、 GREM1、MMP11、KRT(14,16,17)等,下調(diào)的主要有BPIFB1、PIP、FOLR1、ANXA3、 KRT (13,24)等。食管鱗癌與肺鱗癌比較,得出食管鱗癌特異或相對(duì)特異性差異表達(dá)基因143個(gè),其中有34個(gè)基因表達(dá)增高,109個(gè)基因表達(dá)降低。其中上調(diào)主要有RUNX1、SEZ6L2、PYCR1、HIST1H2BD、HIST1H4K、PTPRK、MCM5、PABPC1L、 SPHK1、CCT6A、TRAF2、KRT18、TRIM78P、GIGYF1、SNX5、KCNK12等,下調(diào)主要有MPP7、ANKRD37、LOC101927718、ATP2B4、PER3、ABLIM1、PRKCA、SOGA3、CAV1、 TP53I3、NT5DC3、S1PR3、RELN、CDO1、ADAMTS8等。[結(jié)論]食管鱗癌和相應(yīng)癌旁組織存在差異表達(dá)基因5642個(gè),淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性食管鱗癌與相應(yīng)癌旁組織也存在差異表達(dá)基因415個(gè),食管鱗癌及相應(yīng)癌旁組織比較結(jié)果與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性食管鱗癌與相應(yīng)癌旁組織比較結(jié)果有共同表達(dá)基因550個(gè)；肺鱗癌組織與相應(yīng)癌旁組織比較,共有差異表達(dá)基因1155個(gè)；食管鱗癌與肺鱗癌比較,得出食管鱗癌差異表達(dá)基因143個(gè),肺鱗癌差異表達(dá)基因6567個(gè)。結(jié)合G0分析,提示食管鱗癌有特異性或相對(duì)特異性的表達(dá)基因550個(gè),提示可作為食管鱗癌的病理診斷指標(biāo),同時(shí)也可作為轉(zhuǎn)移性食管鱗癌定位診斷的客觀依據(jù),這為探討原發(fā)灶部位不明的轉(zhuǎn)移性惡性腫瘤提供了一個(gè)新思路。食管鱗癌與肺鱗癌組織的比較存在特異性或相對(duì)特異性差異表達(dá)基因143個(gè)和6567個(gè)。提示可作為食管鱗癌與肺鱗癌的鑒別診斷參考指標(biāo)。這為惡性腫瘤的臨床病理診斷與鑒別診斷進(jìn)行了有益的嘗試。
[Abstract]:Objective : To investigate the expression of common gene expression and differential gene expression of esophageal squamous cell carcinoma ( ESCC ) , lymph node metastatic esophageal squamous cell carcinoma ( SCC ) , lung squamous cell carcinoma ( SCC ) and paraneoplastic tissues . Results : There were 5642 differentially expressed genes in esophageal squamous cell carcinoma and corresponding adjacent tissues . The up - regulated genes mainly include MAGEA1 , MAGEA6 , KREMEN2 , MMP - 12 , MAGEA2B , MMP - 13 , MMP1 , MMP - 12 , MAGEA2B , MMP - 13 , VGF , MTL5 , MAGEA8 , FOXL2NB , DLX5 , KRT14 , IRF6 , WDR72 , etc . The downregulated genes mainly include ATP1A2 , SCARA5 , SLITRK3 , PDZRN4 , PDZRN4 , HLF , SORBS2 , NCAM1 , DES , RYR2 , BPIFB1 , PRUNE2 , SCRG1 , KCNB1 , MYZAP . There were a total of 157 genes differentially expressed in lymph node metastatic esophageal squamous cell carcinoma . The downregulated genes mainly include the expression genes of pIFB1 , SEZ6L2 , NTRK2 , DLX6 , KRT ( 13 , 24 ) and so on . The downregulation is mainly with the expression of pIFB1 , SPP1 , NTRK2 , DLX6 , KRT ( 13,24 ) . The expression gene of esophageal squamous cell carcinoma and lung squamous cell carcinoma ( SCC ) was analyzed . The results showed that there were more than 550 differentially expressed genes in esophageal squamous cell carcinoma and corresponding adjacent tissues , and there were 143 and 6567 expression genes in esophageal squamous cell carcinoma and lung squamous cell carcinoma . These results suggested that there were 143 and 6567 expression genes in esophageal squamous cell carcinoma and lung squamous cell carcinoma .

【學(xué)位授予單位】：昆明醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：R735.1

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本文編號(hào)：1504196