中國(guó)朝鮮族和漢族人群的6個(gè)Y染色體STR基因座的遺傳多態(tài)性分析
本文關(guān)鍵詞: Y-STR 復(fù)合擴(kuò)增 遺傳多態(tài)性 法醫(yī)學(xué) 朝鮮族 出處:《延邊大學(xué)》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
【摘要】:目的:為探究Y染色體遺傳標(biāo)記STR基因座在不同民族間的遺傳多態(tài)性,本研究通過(guò)建立6個(gè)Y染色體STR基因座復(fù)合擴(kuò)增體系獲得中國(guó)朝鮮族和漢族群體的遺傳多態(tài)性等相關(guān)法醫(yī)學(xué)參數(shù),通過(guò)群體間遺傳距離分析探究不同地域、不同民族間遺傳差異,為建立朝鮮族STR基因組數(shù)據(jù)庫(kù)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù),為群體遺傳學(xué)分析提供參考數(shù)據(jù)。方法:采用PCR擴(kuò)增、聚丙烯酰胺凝膠電泳和銀染顯色技術(shù)對(duì)200名中國(guó)朝鮮族和200名漢族個(gè)體的5個(gè)單拷貝STR基因座(DYS449、DYS461、DYS508、DYS531、DYS594和1個(gè)多拷貝基因座DYF406S1進(jìn)行檢測(cè),運(yùn)用Excel辦公軟件、SPSS、Arlequin3.5和Mega4.1軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。結(jié)果:5 個(gè)單拷貝 Y-STR 基因座 DYS449、DYS461、DYS508、DYS531、DYS594在朝鮮族群體中分別檢出13、6、4、4、5個(gè)等位基因,遺傳多態(tài)性(GD)依次是0.8436、0.6047、0.5662、0.5303、0.3310,在漢族群體中分別檢出11、6、5、4、6個(gè)等位基因,遺傳多態(tài)性(GD)依次是0.8690、0.6344、0.4815、0.5511、0.3850;多拷貝基因座DYF404S1在朝鮮族群體中檢測(cè)出8個(gè)等位基因,26種單倍型,單倍型多態(tài)性(HD)為0.9260,個(gè)人識(shí)別能力(DP)為0.9214,在漢族群體中檢測(cè)出8個(gè)等位基因,24種單倍型,單倍型多態(tài)性(HD)為0.9107,個(gè)人識(shí)別能力(DP)為0.9062,累計(jì)6個(gè)Y-STR基因座在朝鮮族中構(gòu)成167種單倍型,單倍型多態(tài)性(HD)為0.9981,單體型辨別能力(DC)值為0.8350,匹配概率(MP)為6.85×10-3,個(gè)人識(shí)別能力(DP)值為0.9932,在漢族群體中,構(gòu)成181種單倍型,單倍型多態(tài)性(HD)為0.9989,單體型辨別能力(DC)值為0.9050,匹配概率(MP)為6.05 ×10-3,個(gè)人識(shí)別能力(DP)值為0.9940。遺傳距離結(jié)果顯示同民族即使不同地域之間遺傳差異不明顯,不同民族即使同地域遺傳差異顯著。結(jié)論:快速突變基因座在朝鮮族和漢族兩群體中的遺傳多態(tài)性較高,其他基因座DYS461、DYS508、DYS531在這兩群體中也展現(xiàn)出良好的遺傳多態(tài)性;基因座DYS594在兩群體中遺傳多態(tài)性低;通過(guò)群體間遺傳距離分析,證實(shí)了群體遺傳學(xué)之間的地域性、民族性和種族性差異;6個(gè)Y-STR基因座的法醫(yī)遺傳學(xué)數(shù)據(jù)可為建立中國(guó)朝鮮族STR基因座數(shù)據(jù)庫(kù)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù),也可為群體遺傳學(xué)和法醫(yī)學(xué)應(yīng)用提供參考數(shù)據(jù)。
[Abstract]:Objective: to investigate the genetic polymorphism of Y chromosome marker STR locus in different ethnic groups. In this study, we established 6 Y chromosome STR loci multiple amplification system to obtain the genetic polymorphism of Chinese Korean and Han populations and other related forensic parameters, and analyzed the genetic distance between populations to explore different regions. The genetic differences among different ethnic groups provided basic data for the establishment of Korean STR genome database and reference data for population genetic analysis. Methods: PCR amplification was used. Polyacrylamide gel electrophoresis and silver staining technique were used to detect five single copy STR loci DYS449DYS461 and DYS508 in 200 Chinese Korean and 200 Han Chinese individuals. DYS531 DYS594 and one multi-copy locus DYF406S1 were detected, and Excel office software was used to detect DYS594. Results: DYS449 / DYS461 / DYS508 / 5 single copy Y-STR loci were analyzed by Arlequin3.5 and Mega4.1 software. DYS531 and DYS594 alleles were detected in Korean population respectively. The alleles of 13YS 531 and 5 alleles were detected respectively, and the genetic polymorphism of DYS594 was 0.8436N0. 6047, respectively. The genetic polymorphism (GDG) was 0.8690 in the Han population. The alleles of 1166 alleles and 6 alleles were detected in the Han population. 0.6344N 0.4815U 0.5511U 0.3850; There were 26 haplotypes of 8 alleles detected in Korean population with multiple copy loci (DYF404S1), and the haplotype polymorphism (HD) was 0.9260. The individual recognition ability was 0.9214. 24 haplotypes of 8 alleles and 0.9107 haplotypes were detected in Han population. The total number of Y-STR loci was 0.9062.167 haplotypes and 0.9981 haplotypes were constructed in 6 Y-STR loci in Korean nationality. The values of DCV, MPP and DPP of haplotype discrimination were 0.8350, 6.85 脳 10 ~ (-3) and 0.9932, respectively. Among 181 haplotypes, the HD of haplotypes was 0.9989, the DCvalue of haplotype discrimination was 0.9050, and the matching probability was 6.05 脳 10 ~ (-3). The value of personal identification ability was 0.9940. The genetic distance showed that there was no significant genetic difference between different regions even in the same ethnic group. Conclusion: the rapid mutation loci are highly polymorphic in Korean and Han populations, and other loci are DYS461 and DYS508. DYS531 also showed good genetic polymorphism in these two populations. The genetic polymorphism of locus DYS594 was low in the two populations. Through the analysis of genetic distance between populations, the regional, ethnic and ethnic differences among population genetics were confirmed. The forensic genetic data of 6 Y-STR loci can provide basic data for the establishment of STR locus database of Chinese Korean nationality, and also provide reference data for population genetics and forensic application.
【學(xué)位授予單位】:延邊大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:D919
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,本文編號(hào):1491361
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