發(fā)布時間：2018-02-02 09:23

  本文關鍵詞： 小桐子 Jcβ-StR 克隆 生物信息學分析 表達分析　出處：《生物技術通報》2017年07期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：以小桐子(Jatropha curcas L.)cDNA為模版,克隆了Jc5β-StR基因的CDS序列,并對其序列進行了生物信息學分析。序列分析表明該基因包含1 173 bp開放閱讀框(ORF),編碼390個氨基酸。預測其編碼蛋白質的相對分子量為44.23 k D,理論等電點為5.22。Blast搜索結果及進化分析結果表明,Jc5β-StR與蓖麻5β-St R蛋白序列一致性最高(87%)且親緣關系最近。Jc5β-StR是一個短鏈還原酶,該蛋白編碼有一個短鏈還原酶家族(SDRs)的黃體酮5β還原酶(5β-POR),還含有SDRs的6個保守結構域。組織表達結果顯示Jc5β-StR在小桐子根、莖、葉、花、果皮和種子中都有表達,在種子中表達量最高,且隨種子發(fā)育過程表達量逐漸上升,在種子生長發(fā)育的后期(50 d)達到最高值后下降。非生物脅迫(PEG、Na Cl、低溫和機械損傷)誘導下,Jc5β-StR的表達量都不同程度上調,推測其參與小桐子非生物脅迫響應。
[Abstract]:The CDS sequence of Jc5 尾 -Str gene was cloned by using Jatropha curcas L. curcas as template. The sequence analysis showed that the gene contained 1 173 BP open reading frame (ORF). It encodes 390 amino acids. The predicted molecular weight of the encoded protein is 44.23 KD, the theoretical isoelectric point is 5.22. Blast search results and evolution analysis results show. Jc5 尾 -StR and Ricinus castor 5 尾 -StR protein have the highest sequence consistency (87.10%) and have the closest relationship. Jc5 尾 -StR is a short-chain reductase. The protein encodes a short chain reductase family (SDRs) of progesterone 5 尾 reductase 5 尾 -POR). There were also 6 conserved domains of SDRs. The results of tissue expression showed that Jc5 尾 -StR was expressed in roots, stems, leaves, flowers, pericarp and seeds, and the highest expression was found in seeds. The expression level increased gradually with the seed development and decreased after reaching the highest value at the late stage of seed growth and development. Induced by abiotic stress PEGN Na Cl (low temperature and mechanical damage). The expression of Jc5 尾 -StR was up-regulated in varying degrees, which suggested that it was involved in the abiotic stress response of Paulownia cuspidata.
【作者單位】： 昆明理工大學現(xiàn)代農(nóng)業(yè)工程學院;昆明理工大學建筑與城市規(guī)劃學院;云南農(nóng)業(yè)大學園林園藝學院;云南師范大學生命科學院;
【基金】：國家自然科學基金項目(31460355)
【分類號】：Q943.2;S794.9
【正文快照】： 短鏈還原酶家族(Short-chain dehydrogenases/reductases,SDRs)是迄今為止發(fā)現(xiàn)的最古老、最大的蛋白質超家族之一,存在各種生物形式中,如古細菌,原核生物,真核生物和病毒等[1-2]。SDR家族成員在脂類、氨基酸、碳水化合物、激素類、異生物質代謝和氧化還原反應傳感機制中發(fā)揮重

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本文編號：1484184