本文關(guān)鍵詞： 小桐子 Jcβ-StR 克隆 生物信息學(xué)分析 表達(dá)分析　出處：《生物技術(shù)通報(bào)》2017年07期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：以小桐子(Jatropha curcas L.)cDNA為模版,克隆了Jc5β-StR基因的CDS序列,并對(duì)其序列進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。序列分析表明該基因包含1 173 bp開放閱讀框(ORF),編碼390個(gè)氨基酸。預(yù)測(cè)其編碼蛋白質(zhì)的相對(duì)分子量為44.23 k D,理論等電點(diǎn)為5.22。Blast搜索結(jié)果及進(jìn)化分析結(jié)果表明,Jc5β-StR與蓖麻5β-St R蛋白序列一致性最高(87%)且親緣關(guān)系最近。Jc5β-StR是一個(gè)短鏈還原酶,該蛋白編碼有一個(gè)短鏈還原酶家族(SDRs)的黃體酮5β還原酶(5β-POR),還含有SDRs的6個(gè)保守結(jié)構(gòu)域。組織表達(dá)結(jié)果顯示Jc5β-StR在小桐子根、莖、葉、花、果皮和種子中都有表達(dá),在種子中表達(dá)量最高,且隨種子發(fā)育過程表達(dá)量逐漸上升,在種子生長(zhǎng)發(fā)育的后期(50 d)達(dá)到最高值后下降。非生物脅迫(PEG、Na Cl、低溫和機(jī)械損傷)誘導(dǎo)下,Jc5β-StR的表達(dá)量都不同程度上調(diào),推測(cè)其參與小桐子非生物脅迫響應(yīng)。
[Abstract]:The CDS sequence of Jc5 尾 -Str gene was cloned by using Jatropha curcas L. curcas as template. The sequence analysis showed that the gene contained 1 173 BP open reading frame (ORF). It encodes 390 amino acids. The predicted molecular weight of the encoded protein is 44.23 KD, the theoretical isoelectric point is 5.22. Blast search results and evolution analysis results show. Jc5 尾 -StR and Ricinus castor 5 尾 -StR protein have the highest sequence consistency (87.10%) and have the closest relationship. Jc5 尾 -StR is a short-chain reductase. The protein encodes a short chain reductase family (SDRs) of progesterone 5 尾 reductase 5 尾 -POR). There were also 6 conserved domains of SDRs. The results of tissue expression showed that Jc5 尾 -StR was expressed in roots, stems, leaves, flowers, pericarp and seeds, and the highest expression was found in seeds. The expression level increased gradually with the seed development and decreased after reaching the highest value at the late stage of seed growth and development. Induced by abiotic stress PEGN Na Cl (low temperature and mechanical damage). The expression of Jc5 尾 -StR was up-regulated in varying degrees, which suggested that it was involved in the abiotic stress response of Paulownia cuspidata.
【作者單位】： 昆明理工大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)工程學(xué)院;昆明理工大學(xué)建筑與城市規(guī)劃學(xué)院;云南農(nóng)業(yè)大學(xué)園林園藝學(xué)院;云南師范大學(xué)生命科學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31460355)
【分類號(hào)】：Q943.2;S794.9
【正文快照】： 短鏈還原酶家族(Short-chain dehydrogenases/reductases,SDRs)是迄今為止發(fā)現(xiàn)的最古老、最大的蛋白質(zhì)超家族之一,存在各種生物形式中,如古細(xì)菌,原核生物,真核生物和病毒等[1-2]。SDR家族成員在脂類、氨基酸、碳水化合物、激素類、異生物質(zhì)代謝和氧化還原反應(yīng)傳感機(jī)制中發(fā)揮重

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本文編號(hào)：1484184