陸地棉基因GhWRKY40-1的克隆及表達(dá)分析
本文關(guān)鍵詞: 棉花 WRKY 轉(zhuǎn)錄因子 基因克隆 序列分析 出處:《棉花學(xué)報(bào)》2017年02期 論文類(lèi)型:期刊論文
【摘要】:【目的】WRKY轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)激活下游一系列抗逆應(yīng)答基因的表達(dá)而提高植株的綜合抗性。本研究旨在研究WRKY轉(zhuǎn)錄因子在陸地棉中的功能!痉椒ā客ㄟ^(guò)基因芯片篩選鑒定出1個(gè)逆境誘導(dǎo)的陸地棉WRKY轉(zhuǎn)錄因子基因,由于此基因編碼蛋白含有1個(gè)典型的WRKY結(jié)構(gòu)域,且與擬南芥At WRKY40具有較高相似性,故命名為GhWRKY40-1。采用電子克隆及反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)獲得GhWRKY40-1基因c DNA全長(zhǎng),并對(duì)其進(jìn)行序列分析及結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測(cè)!窘Y(jié)果】GhWRKY40-1的開(kāi)放閱讀框?yàn)?81 bp,編碼326個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)蛋白相對(duì)分子質(zhì)量為35.78×103,等電點(diǎn)為8.39。GhWRKY40-1在擬南芥原生質(zhì)體中瞬時(shí)表達(dá)定位于細(xì)胞核,且具有轉(zhuǎn)錄激活活性。RT-PCR結(jié)果表明,GhWRKY40-1受甘露醇誘導(dǎo)上調(diào)表達(dá)!窘Y(jié)論】推測(cè)GhWYKY40-1可能參與干旱脅迫應(yīng)答反應(yīng),并且在植物逆境脅迫中發(fā)揮重要作用。上述分析為進(jìn)一步從分子水平上驗(yàn)證其抗逆生物學(xué)功能以及揭示棉花非生物脅迫抗逆機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:[objective] WRKY transcription factors enhance the comprehensive resistance of plants by activating downstream expression of a series of stress responsive genes. The purpose of this study was to study the function of WRKY transcription factors in Upland Cotton (Gossypium gossypium L.). A WRKY transcription factor gene induced by stress was identified by over-gene chip screening in Upland cotton (Gossypium hirsutum L.). Because this gene encoding protein contains a typical WRKY domain, and has a high similarity with Arabidopsis at WRKY40. Therefore, it was named GhWRKY40-1.The full length of c DNA of GhWRKY40-1 gene was obtained by electronic cloning and reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR). Sequence analysis and structural and functional prediction were performed. [results] the open reading frame of GhWRKY40-1 was 981bp, encoding 326 amino acids. The relative molecular weight of predicted protein was 35.78 脳 10 ~ (3) and the isoelectric point was 8.39. GhWRKY40-1 was located in the nucleus of Arabidopsis thaliana protoplast. And the transcriptional activation activity. RT-PCR results showed that. The expression of GhWRKY40-1 was up-regulated by mannitol. [conclusion] GhWYKY40-1 may be involved in drought stress response. The above analysis laid a foundation for further verification of its biological function at molecular level and for revealing the mechanism of cotton abiotic stress resistance.
【作者單位】: 新疆農(nóng)墾科學(xué)院棉花研究所/農(nóng)業(yè)部西北內(nèi)陸區(qū)棉花生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/新疆兵團(tuán)棉花遺傳改良與高產(chǎn)栽培重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31260360) 兵團(tuán)青年科技創(chuàng)新資金專項(xiàng)(2011CB001)
【分類(lèi)號(hào)】:S562
【正文快照】: WRKY轉(zhuǎn)錄因子是1類(lèi)鋅指型轉(zhuǎn)錄因子,成員均含有1~2個(gè)大約60個(gè)氨基酸殘基所組成的保守的WRKY結(jié)構(gòu)域,且含有7個(gè)絕對(duì)保守的氨基酸殘基WRKYGQK,并由此得名為WRKY。WRKY轉(zhuǎn)錄因子廣泛參與植物的逆境應(yīng)答,在擬南芥、小麥、大豆和水稻中已有大量的文獻(xiàn)報(bào)道WRKY轉(zhuǎn)錄因子受環(huán)境因子(如高
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