本文關鍵詞： 焦磷酸測序 S rRNA 酸菜 細菌 群落結構　出處：《現(xiàn)代食品科技》2017年02期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為探究東北自然發(fā)酵酸菜中細菌群落結構,本試驗采用454 FLX+平臺對東北地區(qū)傳統(tǒng)自然發(fā)酵的16份酸菜汁樣品中細菌16S rRNA基因的V3-V4區(qū)進行測序。通過454焦磷酸測序,共得到302327條有效序列。計算Chao 1指數(shù)、Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù),對樣品菌群的Alpha多樣性進行評價,發(fā)現(xiàn)松原和大慶樣品的細菌群落具有較高的豐富度。Beta多樣性分析發(fā)現(xiàn)黑龍江、吉林和遼寧省份樣品中存在交疊細菌物種,但含量極低。Heatmap圖顯示各省份的優(yōu)勢菌屬各不相同。樣品群落結構分析表明大慶、黑河和松原樣品中乳桿菌含量超過50%,黑河樣品中乳桿菌含量高達69.6%。KEGG統(tǒng)計結果表明高緯度地區(qū)存在著一定數(shù)量的耐寒細菌。此外,本試驗首次在發(fā)酵食品中發(fā)現(xiàn)污蠅解殼桿菌屬細菌(wohlfahrtiimonas),顯示出高通量測序技術相對傳統(tǒng)純培養(yǎng)技術的優(yōu)勢。
[Abstract]:In order to study the community structure of bacteria in natural fermented pickles in Northeast China. Bacterial 16s in 16 samples of pickled vegetable juice from traditional natural fermentation in Northeast China were studied by 454 FLX platform. The V3-V4 region of rRNA gene was sequenced. A total of 302327 effective sequences were obtained and Chao 1 index Shannon index and Simpson index were calculated to evaluate the Alpha diversity of the sample flora. It was found that the bacterial communities of Songyuan and Daqing samples had higher richness. Beta diversity analysis showed that there were overlapping bacterial species in Heilongjiang, Jilin and Liaoning Province samples. The analysis of sample community structure showed that the content of Lactobacillus in samples of Daqing, Heihe and Songyuan exceeded 50%. The content of Lactobacillus in the samples of Heihe River was as high as 69.6. KEGG statistical results showed that there were a certain number of cold-resistant bacteria in high latitudes. In this experiment, we first found the bacteria of Chitocystis sp. In fermented food, wohlfahrtiimonasus, which showed the advantage of high throughput sequencing technology compared with traditional pure culture technology.
【作者單位】： 沈陽農(nóng)業(yè)大學食品學院;
【基金】：國家自然科學基金資助項目(31370502)
【分類號】：TS255.1
【正文快照】： 酸菜,作為一種大眾化蔬菜腌漬品在我國東北地區(qū)歷史悠久,酸菜是將新鮮白菜用鹽水在密閉容器中泡制一段時間后形成的發(fā)酵蔬菜制品。由于東北三省獨特的地理位置、氣候條件以及民族文化傳統(tǒng),使得該地區(qū)傳統(tǒng)自然發(fā)酵的酸菜酸味濃郁、口味醇厚,其口味與香氣優(yōu)越于其他地區(qū)發(fā)酵的酸

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本文編號：1472610