本文關鍵詞： RNA-seq 中華蜜蜂 幼蟲腸道 高表達基因　出處：《浙江農(nóng)業(yè)學報》2017年09期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：中華蜜蜂(中蜂)是中國特有的本土蜜蜂資源,也是養(yǎng)蜂生產(chǎn)中的常用蜂種之一,具有重要的生態(tài)和經(jīng)濟價值。本研究利用RNA-seq技術對中蜂5和6日齡幼蟲腸道進行深度測序,得到的有效讀段(clean reads)數(shù)分別為29290630與26636038,Q20分別為98.45%和98.38%。GO富集分析結果顯示,Ac5中的高表達基因(HEGs)富集在44個GO term,其中基因富集數(shù)最多的為代謝進程(753 unigenes),其次是催化活性(679 unigenes)與結合(657 unigenes);Ac6中的HEGs富集在44個GO term,其中基因富集數(shù)最多的為代謝進程(792 unigenes),其次是結合(760 unigenes)和催化活性(744 unigenes)。KEGG代謝通路(pathway)富集分析結果顯示,Ac5的HEGs富集在129個pathway,其中基因富集數(shù)最多的是核糖體(103 unigenes)、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白質(zhì)加工(68 unigenes)和碳代謝(67 unigenes);Ac6的HEGs富集在129個代謝通路,其中基因富集數(shù)最多的是核糖體(103 unigenes)、氧化磷酸化(88 unigenes)及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白質(zhì)加工(68 unigenes)。進一步對HEGs進行Venn分析,結果顯示,二者共有的HEGs為2 015個,特有的HEGs分別為219和491個。研究結果不僅可提供中蜂幼蟲腸道發(fā)育過程中的基因表達譜數(shù)據(jù),也為分子水平上深入研究中蜂幼蟲腸道發(fā)育提供重要信息。
[Abstract]:Chinese bee (Chinese bee) is a unique native bee resource in China, and it is also one of the commonly used bee species in beekeeping production. It has important ecological and economic value. In this study, RNA-seq technique was used to carry out deep sequencing of the intestinal tract of the 5th and 6th day-old larvae. The number of valid read segments clean read is 29290630 and 26636038, respectively. Q20 was 98.45% and 98.38%, respectively. The results of enrichment analysis showed that the high expression gene (hEGs) in Ac5 was enriched in 44 go term. The most abundant genes were 753 unigenesus, followed by catalytic activity of 679 unigeneses) and binding of 657 unigeneses. The HEGs in Ac6 was enriched in 44 go terms.Among them, the most abundant gene was metabolic process (792 unigenes). The second one was combined with 760unigenes) and the catalytic activity was 744 unigenes).KEGG pathway. The HEGs of Ac5 was enriched at 129 pathways, and the most abundant gene was ribosome 103unigenes. Endoplasmic reticulum protein processing (68 unigenes) and carbon metabolism 67 unigenesus; The HEGs of Ac6 was enriched in 129 metabolic pathways, and the most abundant gene was ribosome 103unigenes. Oxidative phosphorylation 88 unigenes) and endoplasmic reticulum protein processing 68 unigenes.Furthermore, Venn analysis of HEGs showed that. There were 2 015 HEGs and 219 and 491 unique HEGs, respectively. The results could not only provide the gene expression profile data during the intestinal development of the larvae. It also provides important information for the further study of the intestinal development of wasp larvae at the molecular level.
【作者單位】： 福建農(nóng)林大學蜂學學院;
【基金】：現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術體系建設專項基金(CARS-45-KXJ7) 福建農(nóng)林大學科技發(fā)展基金(KF2015123) 福建省大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)項目(201610389053)
【分類號】：S891
【正文快照】： 東方蜜蜂(Apis cerana)主要集中分布于亞洲的中國、日本、泰國、菲律賓和伊朗等國家,以及俄羅斯遠東地區(qū)[1]。中華蜜蜂(Apis cerana cera-na,簡稱中蜂)特指分布在我國的東方蜜蜂,其距今已有3 000多年的馴養(yǎng)歷史[2]。中蜂是我國重要的本土蜜蜂資源,也是養(yǎng)蜂生產(chǎn)中的常用蜂種之

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