本文關(guān)鍵詞：槐豬和杜洛克豬背最長肌差異表達(dá)基因的篩選與注釋

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【摘要】：為了篩選槐豬和杜洛克豬背最長肌中的差異表達(dá)基因,對槐豬和杜洛克豬背最長肌進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析.結(jié)果表明,槐豬和杜洛克豬分別獲得36 177 844和34 496 450條可用讀段,且與豬參考基因組的比對率分別為78.71%和80.09%.槐豬和杜洛克豬間共有953個差異表達(dá)基因,以杜洛克豬為對照組,槐豬與之相比,有589個上調(diào)基因和364個下調(diào)基因.槐豬和杜洛克豬的差異表達(dá)基因共分類到48個基因本體(GO)條目中,其中,細(xì)胞組分13個、分子功能12個和生物學(xué)過程23個.顯著富集的KEGG通路共計6個,其中,PPAR信號通路是與調(diào)節(jié)脂類代謝顯著相關(guān)的通路.
【作者單位】： 福建農(nóng)林大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院;福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;
【基金】：科技部科技基礎(chǔ)性工作專項(2014FY120800) 福建省省屬公益類科研院所專項(2014R1023-12)
【分類號】：S828
【正文快照】： 以轉(zhuǎn)錄組測序為代表的新一代高通量測序技術(shù)能夠從整體水平研究生物個體在特定組織和特定時刻的基因表達(dá)情況[1-4],目前該技術(shù)已廣泛應(yīng)用于生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、臨床和藥物等研究領(lǐng)域[5].與傳統(tǒng)的基因芯片技術(shù)相比,轉(zhuǎn)錄組測序無需預(yù)先設(shè)計特異性探針,能在全基因組范圍內(nèi)以單堿基分辨

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