本文關(guān)鍵詞：槐豬和杜洛克豬背最長(zhǎng)肌差異表達(dá)基因的篩選與注釋

  更多相關(guān)文章： 槐豬 杜洛克豬 背最長(zhǎng)肌 差異表達(dá) 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

【摘要】：為了篩選槐豬和杜洛克豬背最長(zhǎng)肌中的差異表達(dá)基因,對(duì)槐豬和杜洛克豬背最長(zhǎng)肌進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析.結(jié)果表明,槐豬和杜洛克豬分別獲得36 177 844和34 496 450條可用讀段,且與豬參考基因組的比對(duì)率分別為78.71%和80.09%.槐豬和杜洛克豬間共有953個(gè)差異表達(dá)基因,以杜洛克豬為對(duì)照組,槐豬與之相比,有589個(gè)上調(diào)基因和364個(gè)下調(diào)基因.槐豬和杜洛克豬的差異表達(dá)基因共分類(lèi)到48個(gè)基因本體(GO)條目中,其中,細(xì)胞組分13個(gè)、分子功能12個(gè)和生物學(xué)過(guò)程23個(gè).顯著富集的KEGG通路共計(jì)6個(gè),其中,PPAR信號(hào)通路是與調(diào)節(jié)脂類(lèi)代謝顯著相關(guān)的通路.
【作者單位】： 福建農(nóng)林大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;
【基金】：科技部科技基礎(chǔ)性工作專(zhuān)項(xiàng)(2014FY120800) 福建省省屬公益類(lèi)科研院所專(zhuān)項(xiàng)(2014R1023-12)
【分類(lèi)號(hào)】：S828
【正文快照】： 以轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?yàn)榇淼男乱淮咄繙y(cè)序技術(shù)能夠從整體水平研究生物個(gè)體在特定組織和特定時(shí)刻的基因表達(dá)情況[1-4],目前該技術(shù)已廣泛應(yīng)用于生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、臨床和藥物等研究領(lǐng)域[5].與傳統(tǒng)的基因芯片技術(shù)相比,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序無(wú)需預(yù)先設(shè)計(jì)特異性探針,能在全基因組范圍內(nèi)以單堿基分辨

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 蔡更元,李劍豪,彭國(guó)良,劉敬順,楊景培,劉伯宗;杜洛克豬專(zhuān)門(mén)化父系選育報(bào)告[J];養(yǎng)豬;2001年04期

2 C.S.Lin ,C.W.Hsu;杜洛克豬和桃源豬的骨骼和肌肉中存在著不同的轉(zhuǎn)錄基因[J];飼料工業(yè);2005年20期

3 孫華;彭先文;宋忠旭;程妮;梅書(shū)棋;郭萬(wàn)正;;杜洛克豬新品系選育的遺傳評(píng)定[J];養(yǎng)殖與飼料;2006年01期

4 劉康柱;岳國(guó)璋;張金剛;胡建紅;邢亞玲;;新老美系杜洛克豬生長(zhǎng)性能測(cè)定[J];養(yǎng)豬;2006年06期

5 ;“永新源”杜洛克豬[J];中國(guó)畜禽種業(yè);2008年11期

6 唐輝;許家騏;沈自泉;宋濤;劉平;董立才;王鈺;;中系白色杜洛克豬的生產(chǎn)性能及雜交應(yīng)用效果分析[J];養(yǎng)豬;2008年05期

7 張寶榮;;杜洛克豬[J];新農(nóng)業(yè);2011年03期

8 ;諸美種豬選育歷程[J];豬業(yè)科學(xué);2012年04期

9 劉興義;杜洛克豬[J];新農(nóng)業(yè);1981年21期

10 覃其超,盧厚喜,李都全;杜洛克豬在武漢地區(qū)適應(yīng)性的觀察[J];湖北農(nóng)業(yè)科學(xué);1984年01期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 蘇欽;蘇國(guó)興;劉芬;;新美系杜洛克豬選育報(bào)告[A];福建省畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)2009年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2009年

2 張偉力;徐繼成;;新世紀(jì)美系杜洛克豬種質(zhì)評(píng)述[A];2004東北養(yǎng)豬研究會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2004年

3 胡錦平;翁經(jīng)強(qiáng);褚曉紅;華衛(wèi)東;王志剛;徐如海;;臺(tái)系杜洛克豬選育及其雜交利用研究[A];第一屆中國(guó)養(yǎng)豬生產(chǎn)和疾病控制技術(shù)大會(huì)——2005中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2005年

4 葉道武;吳宓;王勝;張偉力;;美系杜洛克豬在安徽的生長(zhǎng)性能測(cè)定初報(bào)[A];2004東北養(yǎng)豬研究會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2004年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前9條

1 石保國(guó);杜洛克豬[N];陜西科技報(bào);2002年

2 ;杜洛克豬[N];中國(guó)畜牧獸醫(yī)報(bào);2008年

3 文澤;杜洛克豬新品系[N];江蘇農(nóng)業(yè)科技報(bào);2003年

4 黃玉書(shū)邋高加平 趙曉勇;千萬(wàn)元拯救瀕危“姜曲海豬”[N];新華日?qǐng)?bào);2008年

5 劉霞;科學(xué)家首次繪制出豬基因組草圖[N];科技日?qǐng)?bào);2009年

6 山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 李娜;RBP4基因在五個(gè)豬種中的群體遺傳特性[N];中國(guó)畜牧獸醫(yī)報(bào);2009年

7 龍新;生豬生產(chǎn)節(jié)本增效 動(dòng)保管理不能少[N];中國(guó)畜牧獸醫(yī)報(bào);2014年

8 國(guó)家生豬產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系;生豬生產(chǎn)節(jié)本增效技術(shù)指導(dǎo)意見(jiàn)[N];農(nóng)民日?qǐng)?bào);2014年

9 記者 楊照民　通訊員 錢(qián)學(xué)智;找回30年前吃豬肉的感覺(jué)[N];泰州日?qǐng)?bào);2011年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前8條

1 成霞林;新美系杜洛克豬的行為觀察與性能測(cè)定的研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

2 徐繼成;飼養(yǎng)模式對(duì)新引入美系杜洛克豬生長(zhǎng)性能、胴體品質(zhì)及肉質(zhì)的影響[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

3 蔣亞梅;用MTDFREML對(duì)杜洛克豬生產(chǎn)性狀的遺傳分析[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2003年

4 唐凡;大白、長(zhǎng)白、杜洛克豬選育及雜交利用[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

5 劉峰;HDAC1基因、PIT-1基因與豬部分經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)性研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

6 袁崢嶸;DGAT1基因SNPs篩選及其與豬部分經(jīng)濟(jì)性狀關(guān)聯(lián)性研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

7 楊巧麗;豬SLA-DRA基因多態(tài)性及其與仔豬腹瀉的關(guān)聯(lián)分析[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

8 黃冬維;豬ADIPOR1、CTSF基因的多態(tài)性及其與部分經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)性研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

，

本文編號(hào)：1264299