人TRIM28基因及蛋白質(zhì)的生物信息學(xué)分析
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更多相關(guān)文章: TRIM 染色質(zhì)修飾 DNA損傷修復(fù) 生物信息學(xué)
【摘要】:[目的]通過生物信息學(xué)預(yù)測分析人TRIM28基因的啟動子及蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)、信號肽、親疏水性、跨膜區(qū)域、蛋白結(jié)構(gòu)、與之相互作用的蛋白質(zhì)及功能。[方法]使用相應(yīng)軟件分析TRIM28相關(guān)信息。[結(jié)果]TRIM28的3個啟動子中第一個通過甲基化對其表達(dá)影響較深;TRIM28蛋白質(zhì)是由835個氨基酸組成的無信號肽、無跨膜結(jié)構(gòu)的不穩(wěn)定親水蛋白質(zhì),等電點為5.52,哺乳動物中高度保守;二級結(jié)構(gòu)包括10個α螺旋和12個β折疊片層,三級結(jié)構(gòu)構(gòu)建需更多可靠的模板;TRIM28主要定位于細(xì)胞核,自身及相互作用蛋白質(zhì)主要參與染色質(zhì)修飾及DNA損傷修復(fù)過程。[結(jié)論]TRIM28第一個啟動子甲基化影響其表達(dá),蛋白質(zhì)無信號肽、無跨膜結(jié)構(gòu)、不穩(wěn)定系數(shù)高達(dá)46.43,屬不穩(wěn)定親水蛋白質(zhì),定位細(xì)胞核,參與染色質(zhì)修飾和DNA損傷修復(fù)。
【作者單位】: 河南中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院實驗教學(xué)中心;
【分類號】:Q811.4
【正文快照】: TRIM28又稱KAP1、TIF1β,是TIF1家族中重要的一員,是一個重要的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)抑制因子[1-3]。TRIM28與細(xì)胞的各種行為具有密切聯(lián)系,如細(xì)胞分化、精子發(fā)生[4-5]、T、B細(xì)胞發(fā)育、DNA損傷修復(fù)[6-7]等有關(guān),TRIM28也可以調(diào)控P53信號通路[8-9]。TRIM28與腫瘤的發(fā)生發(fā)展具有重要的調(diào)控作用
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,本文編號:1262726
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