本文關(guān)鍵詞：α-tubulin基因的克隆、生物信息學(xué)分析及其在仿刺參腸道再生過(guò)程中的表達(dá)模式

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【摘要】：為了明確仿刺參α-微管蛋白(α-tubulin)基因的序列及結(jié)構(gòu)信息,初步研究該基因在仿刺參腸道再生過(guò)程中的生物學(xué)功能,本研究利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘和c DNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)(RACE)首次克隆得到仿刺參α-tubulin基因的全長(zhǎng)c DNA序列。結(jié)果表明,仿刺參α-tubulin基因c DNA全長(zhǎng)為1641 bp,共編碼453個(gè)氨基酸,經(jīng)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),該基因的5'端非編碼區(qū)為153 bp,3'端非編碼區(qū)為126 bp,推算該基因所編碼的蛋白質(zhì)分子量為50.33 ku,等電點(diǎn)為4.89,屬于親水性非跨膜蛋白質(zhì),且氨基酸序列中含有微管蛋白特有的信號(hào)序列GGGTGSG。通過(guò)與13種已公布物種的α-tubulin氨基酸序列進(jìn)行多重序列比對(duì)及系統(tǒng)進(jìn)化分析,發(fā)現(xiàn)仿刺參α-tubulin蛋白的氨基酸序列與其他真核生物的α-tubulin蛋白序列具有非常高的保守性,與南極巖斑鱈α-tubulin相似性高達(dá)90%。采用實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)對(duì)α-tubulin基因在仿刺參腸組織再生不同時(shí)期的表達(dá)情況進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果顯示α-tubulin基因在仿刺參腸組織再生不同時(shí)期均有表達(dá),其相對(duì)表達(dá)量在腸組織再生17 d時(shí)最高,5 d時(shí)最低。本研究在獲得仿刺參α-tubulin基因結(jié)構(gòu)信息的同時(shí),進(jìn)一步印證了真核生物α-tubulin基因的高度保守性,同時(shí)表明α-tubulin基因參與仿刺參腸道再生過(guò)程。
【作者單位】： 大連海洋大學(xué)農(nóng)業(yè)部北方海水增養(yǎng)殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國(guó)家“八六三”高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(2012AA10A412) 遼寧省農(nóng)業(yè)攻關(guān)及成果產(chǎn)業(yè)化項(xiàng)目(2015203003)~~
【分類號(hào)】：S917.4
【正文快照】： 微管(microtubule)是真核生物細(xì)胞骨架組成成分之一,不僅參與維持細(xì)胞形態(tài)和調(diào)控細(xì)胞器空間分布,還參與細(xì)胞分裂、代謝調(diào)控、物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等細(xì)胞活動(dòng)[1-4]。同時(shí),微管也是高度動(dòng)態(tài)的有絲分裂紡錘體的主要組成部分,是纖毛、鞭毛和中心粒中的極穩(wěn)定成分[1-4]。研究表明,微，

本文編號(hào)：1262361