釀酒酵母基因組位置效應對外源基因表達的影響
發(fā)布時間:2017-12-02 11:22
本文關鍵詞:釀酒酵母基因組位置效應對外源基因表達的影響
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【摘要】:外源基因元件和模塊在底盤細胞中發(fā)揮特定功能是合成生物學研究的基本過程,而外源元件和模塊在基因組中的位置對其功能的實現(xiàn)具有顯著影響。為了系統(tǒng)、全面地表征釀酒酵母基因組位置效應對外源基因的表達影響,以綠色熒光蛋白為報告基因,通過雙交換同源重組方法,對釀酒酵母單基因敲除庫進行高通量轉化,構建釀酒酵母基因組單位點熒光標記菌株庫。結合流式細胞術和高通量測序技術對單位點熒光標記庫菌株進行分析,構建高表達位點庫和低表達位點庫,共發(fā)現(xiàn)促進綠色熒光蛋白表達的位點428個,抑制綠色熒光蛋白表達的位點444個。通過分析高、低表達位點在酵母染色體上的分布,從全基因組尺度上對釀酒酵母基因組整合位置對基因表達的影響進行表征。本研究可為釀酒酵母基因組位置效應的分布規(guī)律和產生機理研究提供重要參考,對外源蛋白工業(yè)生產和合成生物學中的基因表達精細調控也具有重要的指導意義。
【作者單位】: 天津大學系統(tǒng)生物學教育部重點實驗室;天津大學化工學院天津化學化工協(xié)同創(chuàng)新中心;天津大學計算機與科學技術學院;
【基金】:國家國際科技合作項目(No.2015DFA00960) 國家自然科學基金(No.21390203) 天津市科技計劃項目(No.13RCGFSY19800)資助~~
【分類號】:Q78;Q93
【正文快照】:
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1 S.D.Ehrlich;湯懋z,
本文編號:1244749
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