本文關(guān)鍵詞：杜梨2個(gè)MYB轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及序列分析

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【摘要】：【目的】克隆杜梨(Pyrus betulifolia Bunge)MYB家族的2個(gè)基因(Pb3RMYB和Pb4RMYB),分析其序列特征,為研究其調(diào)控的分子機(jī)制奠定基礎(chǔ)�！痉椒ā坷肦T-PCR和RACE技術(shù)克隆杜梨Pb3RMYB和Pb4RMYB的c DNA序列全長(zhǎng);利用BLAST和ORF Finder對(duì)核酸序列進(jìn)行分析,利用CDD、Prot Param、TMHMM、Signal P、Plant-m Ploc、SPOMA、DANMAN、MEGA6等軟件對(duì)氨基酸序列進(jìn)行分析�！窘Y(jié)果】克隆得到Pb3RMYB和Pb4RMYB基因全長(zhǎng),Gen Bank登錄號(hào)分別為KX272614和KX272615。2者均含有MYB保守結(jié)構(gòu)域,二級(jí)結(jié)構(gòu)均以無規(guī)則卷曲、α-螺旋、延伸鏈和β-折疊為主,亞細(xì)胞定位分析表明2者均定位于細(xì)胞核中。其中,Pb3RMYB屬于3R-MYB亞家族,全長(zhǎng)2 355 bp,ORF長(zhǎng)1 710bp,編碼569個(gè)氨基酸,蛋白分子質(zhì)量約為62 077.3 Da,等電點(diǎn)為7.08;BLAST分析表明Pb3RMYB與已報(bào)道的其他物種3RMYB具有較高的相似度。Pb4RMYB屬于4R-MYB亞家族,全長(zhǎng)3 625 bp,ORF長(zhǎng)2 913 bp,編碼970個(gè)氨基酸,蛋白分子質(zhì)量約為109 600.6 Da,等電點(diǎn)為7.41�！窘Y(jié)論】獲得了2個(gè)杜梨MYB基因Pb3RMYB和Pb4RMYB,分別屬于3RMYB和4R-MYB亞家族。
【作者單位】： 山東省果樹研究所;
【基金】：山東省自然科學(xué)基金(ZR2015YL075) 山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年科研基金(2015YQN41) 山東省良種工程項(xiàng)目(梨優(yōu)質(zhì)矮化、多抗功能基因挖掘與種質(zhì)創(chuàng)新利用2014) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(CARS-29-31)
【分類號(hào)】：S661.2
【正文快照】： MYB轉(zhuǎn)錄因子是植物轉(zhuǎn)錄因子中數(shù)量最多、功能最多樣的家族之一,具有高度保守的DNA結(jié)合域——MYB結(jié)構(gòu)域,廣泛分布于植物、動(dòng)物和真菌[1]。在每個(gè)MYB結(jié)構(gòu)域中,一般都含有3個(gè)保守的色氨酸殘基,其間隔為18~19個(gè)氨基酸,是疏水核心的重要成分,對(duì)于維持螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋的構(gòu)型具有重要

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4 張磊;康宗利;劉海霞;康俊根;;甘藍(lán)胞質(zhì)雄性不育(OguCMS)相關(guān)的MYB轉(zhuǎn)錄因子BoMYB1的克隆與表達(dá)分析[J];農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào);2012年06期

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本文編號(hào)：1244721