本文關(guān)鍵詞：番茄轉(zhuǎn)錄因子基因SlYAB2a的克隆、表達(dá)及亞細(xì)胞定位分析

  更多相關(guān)文章： 番茄 SlYABa 基因克隆 表達(dá)分析 亞細(xì)胞定位

【摘要】：為了研究番茄SlYAB2a基因的功能及其在番茄生長發(fā)育中的分子機(jī)理,以番茄的cDNA為模板,利用RTPCR技術(shù)從番茄中克隆到SlYAB2a基因,該基因編碼的蛋白質(zhì)由192個(gè)氨基酸殘基組成,蛋白質(zhì)的分子量為21.35k Da,等電點(diǎn)是8.79,平均親水系數(shù)是-0.487。SlYAB2a蛋白質(zhì)的6~165位氨基酸殘基形成Pfam:YABBY結(jié)構(gòu)域,在20~47位有1個(gè)C2C2鋅指結(jié)構(gòu)域,在122~181位有1個(gè)螺旋-環(huán)-螺旋結(jié)構(gòu)域。二級結(jié)構(gòu)分析表明SlYAB2a蛋白分子中,α-螺旋占19.79%、β-折疊占14.06%、其余66.15%為不規(guī)則卷曲。蛋白多序列比對表明SlYAB2a與馬鈴薯、林煙草、釀酒葡萄、大豆、擬南芥、甘藍(lán)型油菜、花藥野生稻、玉米和小麥YABBY2的一致性分別為98%,78%,71%,65%,64%,64%,58%,57%,57%,說明SlYAB2a蛋白與來源于雙子葉植物的YABBY2一致性較高,而與來源于單子葉植物的一致性較低。通過聚類分析發(fā)現(xiàn)YABBY2蛋白明顯分為單子葉和雙子葉2個(gè)亞類,SlYAB2a蛋白屬于雙子葉亞類,與馬鈴薯、潘那利番茄、絨毛狀煙草、林煙草等的YABBY2蛋白序列親緣關(guān)系較近。實(shí)時(shí)定量RT-PCR分析結(jié)果表明,在番茄植物的不同生長發(fā)育時(shí)期,根、莖、葉、花、果實(shí)中,都有SlYAB2a基因表達(dá);并且在花和青熟果實(shí)中,SlYAB2a基因表達(dá)水平遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其他組織。說明SlYAB2a基因在花和果實(shí)的發(fā)育過程中起著重要作用。洋蔥表皮細(xì)胞瞬時(shí)表達(dá)結(jié)果表明SlYAB2a蛋白定位于細(xì)胞核中。
【作者單位】： 重慶三峽學(xué)院生命科學(xué)與工程學(xué)院;
【基金】：重慶市教育委員會科學(xué)技術(shù)研究項(xiàng)目(KJ131101) 重慶市萬州區(qū)科學(xué)技術(shù)項(xiàng)目(201403063) 重慶三峽學(xué)院科學(xué)研究計(jì)劃項(xiàng)目(15PY03)
【分類號】：S641.2;Q943.2
【正文快照】： 高等植物的葉和花屬于側(cè)生器官,極性建立的過程是側(cè)生器官形態(tài)建成中的核心問題,也是植物發(fā)育生物學(xué)研究的熱點(diǎn)。側(cè)生器官的形成起始于植物的頂端分生組織,器官分化過程中需要建立基-頂軸、近-遠(yuǎn)軸和中-側(cè)軸3個(gè)體軸極性[1]。在側(cè)生器官發(fā)育中,近-遠(yuǎn)軸分化非常關(guān)鍵,因此,這一過

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 李鳳敏;李前忠;周歡敏;;小鼠蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測[J];內(nèi)蒙古大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2010年02期

2 李鳳敏,李前忠;蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位的識別[J];生物物理學(xué)報(bào);2004年04期

3 張松;黃波;夏學(xué)峰;孫之榮;;蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位的生物信息學(xué)研究[J];生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展;2007年06期

4 趙禹;趙巨東;姚龍;;用離散增量結(jié)合支持向量機(jī)方法預(yù)測蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位[J];生物信息學(xué);2010年03期

5 賈蕓;呂軍;趙巨東;楊小希;;蛋白質(zhì)體積對其亞細(xì)胞定位的影響[J];氨基酸和生物資源;2013年03期

6 鄭珊珊;石卓興;代琦;姚玉華;;蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測研究進(jìn)展[J];科技視界;2014年12期

7 鄭珊珊;石卓興;代琦;姚玉華;;蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測研究進(jìn)展[J];科技視界;2014年15期

8 白雪源;馬玉香;羅成華;師鎖柱;侯剴;馮哲;傅博;陳香美;;人膽酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因的克隆、亞細(xì)胞定位及其在腎組織中的表達(dá)[J];中國病理生理雜志;2008年02期

9 潘宇曦;喇玉娟;馮國鄞;賀林;;運(yùn)用小波分析對蛋白質(zhì)進(jìn)行亞細(xì)胞定位預(yù)測(英文)[J];寧夏大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2008年03期

10 張樹波;賴劍煌;;蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測的機(jī)器學(xué)習(xí)方法[J];計(jì)算機(jī)科學(xué);2009年04期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前9條

1 陳虎;孫之榮;;蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位:數(shù)據(jù)整合和預(yù)測系統(tǒng)[A];第十次中國生物物理學(xué)術(shù)大會論文摘要集[C];2006年

2 黃淑云;孫興玉;梁汝萍;邱建丁;;基于小波支持向量機(jī)預(yù)測蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位研究[A];第十一屆全國計(jì)算（機(jī)）化學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2011年

3 王東;李兵;林超;陳玉華;許雅香;沈衛(wèi)德;;家蠶細(xì)胞色素P450基因CYP6AE21的克隆、表達(dá)分析及亞細(xì)胞定位[A];中國蠶學(xué)會第六屆青年學(xué)術(shù)研討會論文集（1）[C];2009年

4 趙燕;張耀洲;童富淡;;家蠶HMGA的表達(dá)差異和亞細(xì)胞定位[A];全國動物生理生化第十二次學(xué)術(shù)交流會論文摘要匯編[C];2012年

5 張鵬;印莉萍;;水稻缺鐵誘導(dǎo)高效表達(dá)基因OsNramp1的克隆、亞細(xì)胞定位及功能研究[A];中國植物生理學(xué)會第十次會員代表大會暨全國學(xué)術(shù)年會論文摘要匯編[C];2009年

6 ;石斑魚死亡調(diào)節(jié)相關(guān)基因GRIM-19的克隆和亞細(xì)胞定位分析[A];2010年中國水產(chǎn)學(xué)會學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2011年

7 鄒永新;弭軍;崔金鵬;張錫宇;李曦;郭辰虹;高貴敏;陳丙璽;龔瑤琴;;CUL4B表達(dá)及其亞細(xì)胞定位分析[A];中國遺傳學(xué)會第八次代表大會暨學(xué)術(shù)討論會論文摘要匯編（2004-2008）[C];2008年

8 楊丹;張耀洲;;家蠶pBmHPC-21基因的克隆、表達(dá)及亞細(xì)胞定位[A];華東六省一市生物化學(xué)與分子生物學(xué)會2009年學(xué)術(shù)交流會論文摘要匯編[C];2009年

9 徐秋芳;樂文靜;熊如意;周益軍;;RSV CP和SP基因在本氏煙中的表達(dá)與亞細(xì)胞定位分析[A];植�？萍紕�(chuàng)新與病蟲防控專業(yè)化——中國植物保護(hù)學(xué)會2011年學(xué)術(shù)年會論文集[C];2011年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 曹雋U，

本文編號：1209555