發(fā)布時(shí)間：2017-11-13 09:33

  本文關(guān)鍵詞：鎖陽(yáng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與兒茶素合成途徑相關(guān)基因的分析

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【摘要】：藥用植物有效成分的代謝積累與基因的調(diào)控作用密不可分,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)對(duì)藥用植物進(jìn)行研究,有助于對(duì)其次生代謝分子機(jī)制的了解及參與調(diào)控次生代謝的關(guān)鍵基因的挖掘。鎖陽(yáng)(Cynomorium songaricum Rupr.)是常見的中、蒙藥材,但目前其基因組和轉(zhuǎn)錄組的信息卻很匱乏。本研究以鎖陽(yáng)為材料,通過(guò)Illumina技術(shù)對(duì)未出土和出土后這兩個(gè)時(shí)期的花序和莖進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,分析兒茶素生物合成途徑及相關(guān)基因的表達(dá),主要獲得以下研究結(jié)果：1.測(cè)序總計(jì)產(chǎn)出28,932,330,420nt數(shù)據(jù),經(jīng)組裝分別得到51360、77540、62181、75830和86702條unigene。將所得的unigene比對(duì)到NR、NT、Swiss-Prot、 KEGG、COG和GO數(shù)據(jù)庫(kù)中,得到unigene的功能注釋信息,成功構(gòu)建了鎖陽(yáng)的轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)。2.對(duì)unigene進(jìn)行差異性表達(dá)分析,結(jié)果顯示兩個(gè)發(fā)育階段鎖陽(yáng)莖中的基因表達(dá)量都明顯高于花序,出土后鎖陽(yáng)的整體基因表達(dá)量較未出土鎖陽(yáng)的高,出土后出現(xiàn)大量高表達(dá)的基因可能與其快速生長(zhǎng)、開花和結(jié)實(shí)有關(guān)。3.利用高效液相色譜法對(duì)各樣本中兒茶素含量進(jìn)行測(cè)定,發(fā)現(xiàn)未出土鎖陽(yáng)花序含量最高,莖次之；而出土后鎖陽(yáng)花序中含量最低,莖上端和下端的含量較高,但差異性不顯著。4.根據(jù)轉(zhuǎn)錄組信息得到了鎖陽(yáng)兒茶素合成途徑,分析發(fā)現(xiàn)有11個(gè)酶參與該合成途徑,共有80個(gè)unigene序列注釋到該通路中,經(jīng)篩選后得到了21個(gè)相關(guān)unigene。5.對(duì)篩選得到的基因unigene表達(dá)量進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)基因LAR和DFR表達(dá)量的變化規(guī)律和兒茶素的成分積累情況相似,因此,我們推斷LAR和DFR可能對(duì)鎖陽(yáng)兒茶素的合成起著重要的調(diào)控作用。
【學(xué)位授予單位】：內(nèi)蒙古大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S567.239;Q943.2

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3 王彥雕;鎖陽(yáng)、白刺種子萌發(fā)及其寄生關(guān)系的建立[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

本文編號(hào)：1180105